MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa M12 chromosome

Total Repeats: 1728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010513	AAAT	2	8	1396	1403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010513	ATTT	2	8	2881	2888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010513	AGAA	2	8	4414	4421	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010513	GATA	2	8	4559	4566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010513	TTTC	2	8	8916	8923	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010513	AAAT	2	8	8929	8936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010513	TTTA	2	8	10268	10275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010513	CAAT	2	8	10406	10413	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010513	AATC	2	8	13011	13018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010513	ATAC	2	8	13154	13161	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010513	AAAG	2	8	13326	13333	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010513	ATTG	2	8	16818	16825	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010513	CTAG	2	8	17969	17976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010513	GCAG	2	8	18070	18077	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010513	TACA	2	8	18330	18337	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010513	CAGA	2	8	18353	18360	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010513	GATC	2	8	18365	18372	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010513	CAAT	2	8	18727	18734	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010513	GTGG	2	8	19556	19563	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010513	TCAG	2	8	19793	19800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010513	GTCA	2	8	20384	20391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010513	CAAC	2	8	20550	20557	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010513	AGTT	2	8	21364	21371	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010513	AATA	3	12	31722	31733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010513	TGTT	2	8	32532	32539	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010513	TGCG	2	8	34192	34199	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010513	GAGT	2	8	36090	36097	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010513	GATT	2	8	38819	38826	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010513	ATCA	2	8	38878	38885	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010513	GTGA	2	8	39570	39577	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010513	AGGC	2	8	39599	39606	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010513	GAAT	2	8	46314	46321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010513	GTCG	2	8	46349	46356	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010513	ATTC	2	8	48651	48658	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010513	AATT	2	8	49036	49043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010513	ATGC	2	8	49130	49137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010513	GTGA	2	8	49174	49181	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010513	AAGC	2	8	49188	49195	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010513	TCCC	2	8	49517	49524	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_010513	AATG	2	8	51095	51102	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010513	GATA	2	8	51585	51592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010513	TGGT	2	8	51663	51670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010513	AAAT	2	8	52058	52065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010513	GATA	2	8	52086	52093	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010513	ACTC	2	8	52357	52364	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010513	GATT	2	8	52403	52410	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010513	GCTT	2	8	52617	52624	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010513	GATT	2	8	54279	54286	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010513	CCTG	2	8	55420	55427	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010513	GATT	2	8	55515	55522	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010513	AGTC	2	8	56004	56011	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010513	AAAT	2	8	56297	56304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010513	ATCA	2	8	58525	58532	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010513	TCTT	2	8	58638	58645	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010513	GTCA	2	8	60121	60128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010513	TTGC	2	8	61919	61926	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010513	TGTC	2	8	62195	62202	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010513	GATT	2	8	62413	62420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010513	ATTA	2	8	62510	62517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010513	GCAA	2	8	62560	62567	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010513	ATAA	2	8	62666	62673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010513	AAGG	2	8	63623	63630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010513	CCGT	2	8	63777	63784	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010513	AAGT	2	8	64714	64721	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010513	TAAG	2	8	65369	65376	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010513	GACC	2	8	68184	68191	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010513	CGTC	2	8	68702	68709	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010513	AAAG	2	8	68825	68832	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010513	GTTG	2	8	69192	69199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010513	AGGT	2	8	69358	69365	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010513	GTTT	2	8	70930	70937	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010513	GACA	2	8	72830	72837	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010513	AATT	2	8	74989	74996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010513	GAGC	2	8	75126	75133	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010513	TTTC	2	8	76012	76019	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010513	GGTT	2	8	77247	77254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010513	GATA	2	8	77519	77526	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010513	TAAA	2	8	77630	77637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010513	TTGA	2	8	77662	77669	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010513	ATGA	2	8	82298	82305	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010513	TATT	2	8	83102	83109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010513	TGAT	2	8	83174	83181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010513	TAAT	2	8	83275	83282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010513	TAAA	2	8	83328	83335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010513	AAAG	2	8	83636	83643	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010513	TGGT	2	8	83876	83883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010513	TTTG	2	8	83905	83912	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010513	AAGT	2	8	83979	83986	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010513	TTGC	2	8	84012	84019	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010513	CTAA	2	8	84067	84074	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010513	GCAG	2	8	84081	84088	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010513	GCAG	2	8	84165	84172	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_010513	TGCT	2	8	84272	84279	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_010513	ACTT	2	8	84335	84342	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010513	ACTC	2	8	87822	87829	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010513	GTTT	2	8	88153	88160	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010513	ATAC	2	8	94126	94133	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010513	TTGT	2	8	94253	94260	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010513	TTGC	2	8	96496	96503	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010513	GCTG	2	8	96654	96661	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010513	GTAA	2	8	96791	96798	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010513	CTTG	2	8	96890	96897	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010513	TCGT	2	8	97009	97016	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010513	TTCA	2	8	106636	106643	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010513	ACCT	2	8	107778	107785	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010513	TTTA	2	8	109772	109779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010513	CAAA	2	8	111318	111325	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_010513	GTGC	2	8	114169	114176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_010513	ATGC	2	8	114567	114574	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010513	ATGA	2	8	115940	115947	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010513	CATC	2	8	116139	116146	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_010513	TTTA	2	8	116269	116276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010513	GCCT	2	8	117102	117109	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_010513	CGTA	2	8	117146	117153	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010513	GACG	2	8	118345	118352	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010513	TTCG	2	8	118576	118583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010513	TTGA	2	8	121422	121429	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010513	TCTA	2	8	122082	122089	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_010513	CAAC	2	8	122301	122308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_010513	AACA	2	8	122475	122482	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010513	TTGT	2	8	122560	122567	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010513	CTTG	2	8	127006	127013	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010513	TGGC	2	8	142405	142412	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_010513	TGGT	2	8	142432	142439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010513	GATA	2	8	148826	148833	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010513	CCCA	2	8	148900	148907	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
127	NC_010513	TAAT	2	8	149680	149687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010513	TACA	2	8	151523	151530	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010513	ACTT	2	8	151982	151989	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_010513	AGCA	2	8	155574	155581	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_010513	ATGG	2	8	155582	155589	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010513	TGGT	2	8	155665	155672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010513	TCAT	2	8	158650	158657	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_010513	GTGC	2	8	158787	158794	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_010513	TCAT	2	8	162422	162429	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010513	CAGT	2	8	162720	162727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010513	TGAA	2	8	162826	162833	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010513	GGAT	2	8	165321	165328	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010513	TGAT	2	8	169511	169518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010513	TCCT	2	8	169537	169544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_010513	TAAG	2	8	169628	169635	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010513	GACC	2	8	172443	172450	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_010513	CGTC	2	8	172961	172968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_010513	AAAG	2	8	173084	173091	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010513	GTTG	2	8	173451	173458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010513	AGGT	2	8	173617	173624	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010513	GTTT	2	8	175189	175196	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010513	GATT	2	8	179472	179479	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010513	GTGG	2	8	180877	180884	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010513	AGGT	2	8	180928	180935	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010513	CTGC	2	8	181032	181039	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_010513	TAGC	2	8	183453	183460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_010513	AGAT	2	8	183593	183600	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_010513	TCAG	2	8	185842	185849	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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297	NC_010513	GATT	2	8	354465	354472	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
298	NC_010513	AGTG	2	8	355357	355364	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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