MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Xylella fastidiosa M12 chromosome

Total Repeats: 34326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010513	TGA	2	6	18	23	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729252
2	NC_010513	AGA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170729252
3	NC_010513	TAG	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729252
4	NC_010513	AGT	2	6	238	243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729252
5	NC_010513	ACA	2	6	269	274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729252
6	NC_010513	TAC	2	6	295	300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729252
7	NC_010513	TTG	2	6	366	371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729252
8	NC_010513	TGC	2	6	397	402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729252
9	NC_010513	TGG	2	6	460	465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729252
10	NC_010513	TGC	2	6	496	501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729252
11	NC_010513	AAG	2	6	687	692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170729252
12	NC_010513	ATT	2	6	737	742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729252
13	NC_010513	CCT	2	6	833	838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170729252
14	NC_010513	TAG	2	6	975	980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729252
15	NC_010513	CAA	2	6	1058	1063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729252
16	NC_010513	ATT	2	6	1101	1106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729252
17	NC_010513	ACA	2	6	1250	1255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729252
18	NC_010513	ACA	2	6	1540	1545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010513	ACC	5	15	1577	1591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_010513	GTA	2	6	1694	1699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729253
21	NC_010513	TAA	2	6	1737	1742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170729253
22	NC_010513	GAT	2	6	1792	1797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729253
23	NC_010513	AAT	2	6	1807	1812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170729253
24	NC_010513	GAT	2	6	1913	1918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729253
25	NC_010513	TAT	3	9	2014	2022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729253
26	NC_010513	TTA	2	6	2033	2038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729253
27	NC_010513	CAA	2	6	2075	2080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729253
28	NC_010513	TTA	2	6	2089	2094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729253
29	NC_010513	ATT	2	6	2213	2218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729253
30	NC_010513	TTA	2	6	2252	2257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729253
31	NC_010513	GTG	2	6	2472	2477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729253
32	NC_010513	AAG	3	9	2532	2540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170729253
33	NC_010513	AGG	2	6	2544	2549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170729253
34	NC_010513	ATT	2	6	2601	2606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729253
35	NC_010513	GTG	2	6	2631	2636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729253
36	NC_010513	TTC	2	6	2668	2673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170729253
37	NC_010513	AGT	2	6	2713	2718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729253
38	NC_010513	ATA	2	6	2754	2759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010513	ATA	2	6	2771	2776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010513	TAA	2	6	2821	2826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010513	TGT	2	6	2916	2921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010513	ATG	2	6	2938	2943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010513	TTA	2	6	2962	2967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010513	TCA	2	6	2980	2985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010513	TTC	2	6	2986	2991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010513	GTT	2	6	3075	3080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729254
47	NC_010513	ATA	2	6	3353	3358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170729254
48	NC_010513	AGT	2	6	3407	3412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729254
49	NC_010513	TCA	2	6	3420	3425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729254
50	NC_010513	ACG	2	6	3442	3447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729254
51	NC_010513	ATT	2	6	3466	3471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729254
52	NC_010513	AAC	2	6	3525	3530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729254
53	NC_010513	AAC	2	6	3648	3653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729254
54	NC_010513	CGT	2	6	3725	3730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729254
55	NC_010513	ATT	2	6	4171	4176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010513	TCT	2	6	4217	4222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010513	ATT	2	6	4324	4329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010513	ATA	2	6	4370	4375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010513	GCT	2	6	4671	4676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729255
60	NC_010513	GGC	2	6	4684	4689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170729255
61	NC_010513	TAC	2	6	4715	4720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729255
62	NC_010513	CAC	2	6	4789	4794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170729255
63	NC_010513	AGA	2	6	4932	4937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170729255
64	NC_010513	TGG	2	6	4980	4985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729255
65	NC_010513	CGA	2	6	4992	4997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729255
66	NC_010513	TGG	2	6	5016	5021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729255
67	NC_010513	CAA	2	6	5104	5109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729255
68	NC_010513	TAC	2	6	5172	5177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729255
69	NC_010513	GTG	2	6	5303	5308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729255
70	NC_010513	CGA	2	6	5319	5324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729255
71	NC_010513	GGT	2	6	5338	5343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729255
72	NC_010513	TTG	2	6	5429	5434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729255
73	NC_010513	TGG	2	6	5511	5516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729255
74	NC_010513	TGC	2	6	5538	5543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729255
75	NC_010513	TGA	2	6	5616	5621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729255
76	NC_010513	TTC	2	6	5676	5681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170729255
77	NC_010513	GGA	2	6	5751	5756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170729255
78	NC_010513	TGC	2	6	5811	5816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729255
79	NC_010513	GCT	2	6	5830	5835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729255
80	NC_010513	TCG	2	6	5945	5950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729255
81	NC_010513	CTG	2	6	5960	5965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729255
82	NC_010513	CAT	3	9	6156	6164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729255
83	NC_010513	CCT	2	6	6492	6497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170729255
84	NC_010513	TGA	2	6	6639	6644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729255
85	NC_010513	GCC	2	6	6655	6660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729255
86	NC_010513	TTG	2	6	6661	6666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729255
87	NC_010513	GGA	2	6	6687	6692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170729255
88	NC_010513	TGC	2	6	6764	6769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729255
89	NC_010513	GAA	2	6	6867	6872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170729255
90	NC_010513	AGC	2	6	6920	6925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729255
91	NC_010513	TAC	2	6	6933	6938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729255
92	NC_010513	TGC	2	6	6990	6995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729255
93	NC_010513	TTA	2	6	7095	7100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010513	TGT	2	6	7112	7117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010513	TCA	2	6	7249	7254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010513	TGG	2	6	7390	7395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729256
97	NC_010513	GTT	3	9	7421	7429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729256
98	NC_010513	TGA	2	6	7457	7462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729256
99	NC_010513	CAT	2	6	7467	7472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729256
100	NC_010513	TCG	2	6	7654	7659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729256
101	NC_010513	ATT	2	6	7685	7690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729256
102	NC_010513	ATT	2	6	7818	7823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729256
103	NC_010513	TAC	2	6	7904	7909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729256
104	NC_010513	GAA	2	6	7993	7998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010513	TGA	2	6	8030	8035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729257
106	NC_010513	GTG	2	6	8123	8128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729257
107	NC_010513	GCA	3	9	8133	8141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729257
108	NC_010513	TTG	2	6	8168	8173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729257
109	NC_010513	GAA	2	6	8308	8313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170729257
110	NC_010513	GCT	2	6	8395	8400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729257
111	NC_010513	CGT	2	6	8424	8429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729257
112	NC_010513	TCA	2	6	8436	8441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729257
113	NC_010513	GAG	2	6	8443	8448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170729257
114	NC_010513	TGC	2	6	8526	8531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729257
115	NC_010513	TTG	2	6	8618	8623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729257
116	NC_010513	GAA	2	6	8679	8684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170729257
117	NC_010513	CCG	2	6	8710	8715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729257
118	NC_010513	AGC	2	6	8765	8770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729257
119	NC_010513	GCA	2	6	8839	8844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729257
120	NC_010513	TCT	2	6	8858	8863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010513	CTG	2	6	8977	8982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729258
122	NC_010513	GGT	2	6	9010	9015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729258
123	NC_010513	CTG	2	6	9026	9031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729258
124	NC_010513	GTC	2	6	9062	9067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729258
125	NC_010513	TGC	2	6	9069	9074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729258
126	NC_010513	CTC	2	6	9138	9143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170729258
127	NC_010513	GCA	2	6	9324	9329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729258
128	NC_010513	AAC	2	6	9370	9375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729258
129	NC_010513	TGC	2	6	9389	9394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729258
130	NC_010513	TTA	2	6	9551	9556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729258
131	NC_010513	TGC	2	6	9567	9572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729258
132	NC_010513	TTC	2	6	9573	9578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170729258
133	NC_010513	TTA	2	6	9604	9609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729258
134	NC_010513	GTG	2	6	9754	9759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729258
135	NC_010513	ACA	2	6	9839	9844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729258
136	NC_010513	TTA	2	6	9936	9941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729258
137	NC_010513	GAA	2	6	9978	9983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170729258
138	NC_010513	GCT	2	6	9985	9990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729258
139	NC_010513	ACG	2	6	10001	10006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729258
140	NC_010513	GCC	2	6	10049	10054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729258
141	NC_010513	AGA	2	6	10110	10115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170729258
142	NC_010513	AAG	2	6	10120	10125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170729258
143	NC_010513	ACG	2	6	10151	10156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_010513	GCG	2	6	10484	10489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_010513	GAA	2	6	10595	10600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170729259
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148	NC_010513	GCG	2	6	10760	10765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170729259
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163	NC_010513	AAT	2	6	11257	11262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_010513	ATC	2	6	11321	11326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_010513	AAC	2	6	11327	11332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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200	NC_010513	GCT	2	6	13620	13625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
201	NC_010513	TTC	2	6	13717	13722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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232	NC_010513	GCA	2	6	16829	16834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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242	NC_010513	TGA	2	6	17500	17505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729266
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247	NC_010513	ATG	2	6	17854	17859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729266
248	NC_010513	TCC	3	9	17903	17911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
249	NC_010513	TCA	2	6	17936	17941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_010513	ATC	2	6	17957	17962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_010513	AAG	2	6	18047	18052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_010513	TGA	2	6	18129	18134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
253	NC_010513	ATC	2	6	18398	18403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_010513	TGA	2	6	18423	18428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
255	NC_010513	GTT	2	6	18514	18519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
256	NC_010513	GAA	2	6	18697	18702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
257	NC_010513	TGT	3	9	18780	18788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_010513	CGT	2	6	18814	18819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_010513	CTC	2	6	18852	18857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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