MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD01

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010510	ACCTAC	2	12	10479	10490	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010510	ACAGTC	2	12	12561	12572	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010510	GCATCG	2	12	20439	20450	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010510	CGCCTC	2	12	28401	28412	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_010510	TTTTCT	2	12	47906	47917	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010510	CGACGG	2	12	55051	55062	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010510	CGGGCG	2	12	102746	102757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010510	TCCGCG	2	12	119992	120003	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010510	CGTGCT	2	12	130190	130201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010510	CCCGGT	2	12	131321	131332	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010510	TCGGCG	2	12	133444	133455	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010510	TTTCTC	2	12	148053	148064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010510	TCCGTG	2	12	151218	151229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010510	CGATGC	2	12	160524	160535	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010510	CGGCCT	2	12	190110	190121	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010510	CCGGAC	2	12	190723	190734	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010510	CGCGGG	2	12	233432	233443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010510	TCCGCT	2	12	241706	241717	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010510	CGCGTT	2	12	247516	247527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010510	GCCGAC	2	12	250961	250972	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010510	TGACGG	2	12	251013	251024	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_010510	CGGTGC	2	12	253138	253149	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010510	GTCGCG	2	12	258225	258236	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010510	GGCCGG	2	12	265061	265072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010510	CGGGGA	2	12	265995	266006	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_010510	CGTTGT	2	12	270188	270199	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010510	GAGATC	2	12	307509	307520	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_010510	CGACTG	2	12	311248	311259	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010510	CGGAAG	2	12	323086	323097	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_010510	TGCAGC	2	12	364725	364736	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010510	TGACCC	2	12	364741	364752	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010510	GCTGGT	2	12	369505	369516	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010510	AGCGGC	2	12	373451	373462	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010510	CCGGAC	2	12	373548	373559	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010510	ATCGGC	2	12	374620	374631	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010510	ATTATA	2	12	387148	387159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010510	ACCAAA	2	12	415001	415012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010510	AGGGGC	2	12	415086	415097	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_010510	CCCGAC	2	12	457784	457795	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_010510	CCCGAT	2	12	461714	461725	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010510	GCGGCC	2	12	470402	470413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010510	CTCGGG	2	12	470431	470442	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010510	GGCCGA	2	12	472147	472158	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010510	GCCCGC	2	12	473489	473500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_010510	TCCGGG	2	12	484816	484827	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010510	CGGGGG	2	12	484880	484891	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010510	GAGCCG	2	12	517897	517908	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010510	CCGTTC	2	12	535184	535195	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010510	TTTCTC	2	12	545197	545208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010510	TCCGTG	2	12	548356	548367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010510	GCGCTC	2	12	567895	567906	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010510	GCTCAC	2	12	569569	569580	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.