MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD02

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010509	TGGGC	2	10	2141	2150	0 %	20 %	60 %	20 %	170745006
2	NC_010509	ACGGC	2	10	3105	3114	20 %	0 %	40 %	40 %	170745007
3	NC_010509	GCGCA	2	10	3554	3563	20 %	0 %	40 %	40 %	170745007
4	NC_010509	GACGT	2	10	8091	8100	20 %	20 %	40 %	20 %	170745012
5	NC_010509	CGGCA	2	10	8144	8153	20 %	0 %	40 %	40 %	170745012
6	NC_010509	CGTCA	2	10	8171	8180	20 %	20 %	20 %	40 %	170745012
7	NC_010509	GCTCG	2	10	8532	8541	0 %	20 %	40 %	40 %	170745013
8	NC_010509	GAGCG	2	10	9030	9039	20 %	0 %	60 %	20 %	170745014
9	NC_010509	GCCGC	2	10	9790	9799	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_010509	CATTT	2	10	10936	10945	20 %	60 %	0 %	20 %	170745015
11	NC_010509	GACAG	2	10	11149	11158	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_010509	TCGGA	2	10	11237	11246	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010509	GCGCG	2	10	12213	12222	0 %	0 %	60 %	40 %	170745017
14	NC_010509	ACAGC	2	10	13126	13135	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_010509	CCATT	2	10	13138	13147	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_010509	CAACG	2	10	13487	13496	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_010509	CCAAC	2	10	13667	13676	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_010509	TTGCT	2	10	16186	16195	0 %	60 %	20 %	20 %	170745025
19	NC_010509	GCGTC	2	10	16536	16545	0 %	20 %	40 %	40 %	170745026
20	NC_010509	GCAGG	2	10	16651	16660	20 %	0 %	60 %	20 %	170745026
21	NC_010509	GGTTC	2	10	17701	17710	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_010509	AATAT	2	10	17969	17978	60 %	40 %	0 %	0 %	170745027
23	NC_010509	AGTCG	2	10	18477	18486	20 %	20 %	40 %	20 %	170745028
24	NC_010509	AAGGC	2	10	20835	20844	40 %	0 %	40 %	20 %	170745029
25	NC_010509	GGACT	2	10	21736	21745	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010509	CCGGC	2	10	21841	21850	0 %	0 %	40 %	60 %	170745030
27	NC_010509	ATCAA	2	10	25395	25404	60 %	20 %	0 %	20 %	170745033
28	NC_010509	TGCCG	2	10	26450	26459	0 %	20 %	40 %	40 %	170745035
29	NC_010509	GGTGA	2	10	28975	28984	20 %	20 %	60 %	0 %	170745038
30	NC_010509	CCCTA	2	10	31367	31376	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_010509	GCAAA	2	10	31494	31503	60 %	0 %	20 %	20 %	170745041
32	NC_010509	AGCCG	2	10	33709	33718	20 %	0 %	40 %	40 %	170745041
33	NC_010509	CGGGC	2	10	35419	35428	0 %	0 %	60 %	40 %	170745043
34	NC_010509	CCCCT	2	10	36704	36713	0 %	20 %	0 %	80 %	170745044
35	NC_010509	TCCCA	2	10	37381	37390	20 %	20 %	0 %	60 %	170745045
36	NC_010509	GACCA	2	10	38334	38343	40 %	0 %	20 %	40 %	170745046
37	NC_010509	CCCTG	2	10	38578	38587	0 %	20 %	20 %	60 %	170745047
38	NC_010509	TCCGC	2	10	38616	38625	0 %	20 %	20 %	60 %	170745047
39	NC_010509	ACGCG	2	10	39489	39498	20 %	0 %	40 %	40 %	170745047
40	NC_010509	CGCGC	2	10	39572	39581	0 %	0 %	40 %	60 %	170745047
41	NC_010509	CGAAA	2	10	40629	40638	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_010509	GCCTT	2	10	41409	41418	0 %	40 %	20 %	40 %	170745049
43	NC_010509	GTTGA	2	10	42161	42170	20 %	40 %	40 %	0 %	170745050
44	NC_010509	GCCCC	2	10	43798	43807	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
45	NC_010509	TGCAA	2	10	44537	44546	40 %	20 %	20 %	20 %	170745053
46	NC_010509	GCATC	2	10	44860	44869	20 %	20 %	20 %	40 %	170745054
47	NC_010509	TTGCT	2	10	46248	46257	0 %	60 %	20 %	20 %	170745056
48	NC_010509	GCGTC	2	10	46598	46607	0 %	20 %	40 %	40 %	170745057
49	NC_010509	GCAGG	2	10	46713	46722	20 %	0 %	60 %	20 %	170745057

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.