MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD02

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010509	GCCG	2	8	173	180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010509	CGCA	2	8	1053	1060	25 %	0 %	25 %	50 %	170745006
3	NC_010509	CCAA	2	8	1169	1176	50 %	0 %	0 %	50 %	170745006
4	NC_010509	CAGG	2	8	1450	1457	25 %	0 %	50 %	25 %	170745006
5	NC_010509	AGGC	2	8	1763	1770	25 %	0 %	50 %	25 %	170745006
6	NC_010509	TCGC	2	8	1832	1839	0 %	25 %	25 %	50 %	170745006
7	NC_010509	ACCG	2	8	2014	2021	25 %	0 %	25 %	50 %	170745006
8	NC_010509	AGCC	2	8	2444	2451	25 %	0 %	25 %	50 %	170745007
9	NC_010509	GCAA	2	8	2516	2523	50 %	0 %	25 %	25 %	170745007
10	NC_010509	CGCA	2	8	2780	2787	25 %	0 %	25 %	50 %	170745007
11	NC_010509	CGGG	2	8	3024	3031	0 %	0 %	75 %	25 %	170745007
12	NC_010509	GCCG	2	8	3373	3380	0 %	0 %	50 %	50 %	170745007
13	NC_010509	GATC	2	8	3885	3892	25 %	25 %	25 %	25 %	170745008
14	NC_010509	GCGA	2	8	3976	3983	25 %	0 %	50 %	25 %	170745008
15	NC_010509	CGAT	2	8	4292	4299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010509	CGTT	2	8	4474	4481	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010509	TGAG	2	8	4626	4633	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010509	CGCA	2	8	4782	4789	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010509	GACC	2	8	4828	4835	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010509	CGGG	2	8	4919	4926	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010509	CCGT	2	8	5535	5542	0 %	25 %	25 %	50 %	170745010
22	NC_010509	GCCG	2	8	5594	5601	0 %	0 %	50 %	50 %	170745010
23	NC_010509	GTAG	2	8	5803	5810	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010509	GATA	2	8	6302	6309	50 %	25 %	25 %	0 %	170745011
25	NC_010509	GTGA	2	8	6319	6326	25 %	25 %	50 %	0 %	170745011
26	NC_010509	CGAA	2	8	6803	6810	50 %	0 %	25 %	25 %	170745011
27	NC_010509	GCCG	2	8	6880	6887	0 %	0 %	50 %	50 %	170745011
28	NC_010509	TCGC	2	8	7379	7386	0 %	25 %	25 %	50 %	170745012
29	NC_010509	GCGG	2	8	7658	7665	0 %	0 %	75 %	25 %	170745012
30	NC_010509	CGGA	2	8	8808	8815	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010509	CCGG	2	8	9048	9055	0 %	0 %	50 %	50 %	170745014
32	NC_010509	CGCA	2	8	9078	9085	25 %	0 %	25 %	50 %	170745014
33	NC_010509	CGAT	2	8	9510	9517	25 %	25 %	25 %	25 %	170745014
34	NC_010509	CTTC	2	8	10090	10097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010509	AAGC	2	8	11073	11080	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010509	GCCC	2	8	11550	11557	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_010509	TGCG	2	8	11833	11840	0 %	25 %	50 %	25 %	170745016
38	NC_010509	GCCG	2	8	12138	12145	0 %	0 %	50 %	50 %	170745017
39	NC_010509	CCGC	2	8	12163	12170	0 %	0 %	25 %	75 %	170745017
40	NC_010509	AAGC	2	8	13293	13300	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010509	CTTT	2	8	13471	13478	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010509	CGCC	2	8	13579	13586	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_010509	TTGT	2	8	14479	14486	0 %	75 %	25 %	0 %	170745021
44	NC_010509	GGCA	2	8	14659	14666	25 %	0 %	50 %	25 %	170745022
45	NC_010509	CACC	2	8	15123	15130	25 %	0 %	0 %	75 %	170745023
46	NC_010509	CGGT	2	8	15580	15587	0 %	25 %	50 %	25 %	170745024
47	NC_010509	TGCT	2	8	15966	15973	0 %	50 %	25 %	25 %	170745025
48	NC_010509	CGCC	2	8	16770	16777	0 %	0 %	25 %	75 %	170745026
49	NC_010509	GCCG	2	8	16848	16855	0 %	0 %	50 %	50 %	170745026
50	NC_010509	GGGT	2	8	16909	16916	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010509	GCCG	2	8	17114	17121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010509	CGGT	2	8	17293	17300	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010509	CGTT	2	8	17770	17777	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010509	GACC	2	8	17859	17866	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010509	GCCG	2	8	18300	18307	0 %	0 %	50 %	50 %	170745027
56	NC_010509	TGCG	2	8	18686	18693	0 %	25 %	50 %	25 %	170745028
57	NC_010509	CCGG	2	8	18813	18820	0 %	0 %	50 %	50 %	170745028
58	NC_010509	AGCG	2	8	20295	20302	25 %	0 %	50 %	25 %	170745029
59	NC_010509	TGCG	2	8	20544	20551	0 %	25 %	50 %	25 %	170745029
60	NC_010509	CCGA	2	8	20726	20733	25 %	0 %	25 %	50 %	170745029
61	NC_010509	GGCC	2	8	21341	21348	0 %	0 %	50 %	50 %	170745029
62	NC_010509	ACTG	2	8	21818	21825	25 %	25 %	25 %	25 %	170745030
63	NC_010509	CGAG	2	8	22641	22648	25 %	0 %	50 %	25 %	170745032
64	NC_010509	CCGC	2	8	22807	22814	0 %	0 %	25 %	75 %	170745032
65	NC_010509	TCGC	2	8	24251	24258	0 %	25 %	25 %	50 %	170745032
66	NC_010509	TGGA	2	8	24422	24429	25 %	25 %	50 %	0 %	170745032
67	NC_010509	TCCG	2	8	25202	25209	0 %	25 %	25 %	50 %	170745033
68	NC_010509	AGCA	2	8	25479	25486	50 %	0 %	25 %	25 %	170745033
69	NC_010509	AACT	2	8	25631	25638	50 %	25 %	0 %	25 %	170745033
70	NC_010509	GTCA	2	8	25653	25660	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010509	CGAG	2	8	25793	25800	25 %	0 %	50 %	25 %	170745034
72	NC_010509	GCCA	2	8	25830	25837	25 %	0 %	25 %	50 %	170745034
73	NC_010509	CGAG	2	8	26357	26364	25 %	0 %	50 %	25 %	170745035
74	NC_010509	GTTC	2	8	26522	26529	0 %	50 %	25 %	25 %	170745035
75	NC_010509	ATTG	2	8	27077	27084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010509	CCGC	2	8	27160	27167	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_010509	GCAA	2	8	27237	27244	50 %	0 %	25 %	25 %	170745036
78	NC_010509	TGGC	2	8	27704	27711	0 %	25 %	50 %	25 %	170745037
79	NC_010509	TCGC	2	8	28123	28130	0 %	25 %	25 %	50 %	170745038
80	NC_010509	CCTG	2	8	29024	29031	0 %	25 %	25 %	50 %	170745039
81	NC_010509	CGAC	2	8	29170	29177	25 %	0 %	25 %	50 %	170745039
82	NC_010509	GCCC	2	8	29340	29347	0 %	0 %	25 %	75 %	170745039
83	NC_010509	CGTG	2	8	29638	29645	0 %	25 %	50 %	25 %	170745039
84	NC_010509	ATGG	2	8	30201	30208	25 %	25 %	50 %	0 %	170745040
85	NC_010509	GAAG	2	8	30801	30808	50 %	0 %	50 %	0 %	170745040
86	NC_010509	AGCG	2	8	31160	31167	25 %	0 %	50 %	25 %	170745040
87	NC_010509	GCCG	2	8	31293	31300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010509	TTGA	2	8	32135	32142	25 %	50 %	25 %	0 %	170745041
89	NC_010509	GCCG	2	8	32392	32399	0 %	0 %	50 %	50 %	170745041
90	NC_010509	CGTG	2	8	33424	33431	0 %	25 %	50 %	25 %	170745041
91	NC_010509	GCTC	2	8	34738	34745	0 %	25 %	25 %	50 %	170745042
92	NC_010509	TGGA	2	8	35707	35714	25 %	25 %	50 %	0 %	170745043
93	NC_010509	TCGG	2	8	36356	36363	0 %	25 %	50 %	25 %	170745043
94	NC_010509	CAAG	2	8	37150	37157	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010509	CGAT	2	8	37160	37167	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010509	AGGG	2	8	37499	37506	25 %	0 %	75 %	0 %	170745045
97	NC_010509	CTGT	2	8	37923	37930	0 %	50 %	25 %	25 %	170745046
98	NC_010509	GCCG	2	8	38208	38215	0 %	0 %	50 %	50 %	170745046
99	NC_010509	CCTG	2	8	38804	38811	0 %	25 %	25 %	50 %	170745047
100	NC_010509	GCTC	2	8	38941	38948	0 %	25 %	25 %	50 %	170745047
101	NC_010509	CGAT	2	8	39504	39511	25 %	25 %	25 %	25 %	170745047
102	NC_010509	TGGC	2	8	39692	39699	0 %	25 %	50 %	25 %	170745048
103	NC_010509	CTTC	2	8	39870	39877	0 %	50 %	0 %	50 %	170745048
104	NC_010509	AGCG	2	8	40081	40088	25 %	0 %	50 %	25 %	170745048
105	NC_010509	CCAC	2	8	40149	40156	25 %	0 %	0 %	75 %	170745048
106	NC_010509	CAAT	2	8	40233	40240	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010509	GCTT	2	8	40345	40352	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_010509	CCGG	2	8	40487	40494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_010509	CCAT	2	8	40567	40574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010509	CGTC	2	8	40805	40812	0 %	25 %	25 %	50 %	170745049
111	NC_010509	TTCG	2	8	41461	41468	0 %	50 %	25 %	25 %	170745049
112	NC_010509	CCCG	2	8	41528	41535	0 %	0 %	25 %	75 %	170745049
113	NC_010509	GACC	2	8	43717	43724	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_010509	GGAG	2	8	43839	43846	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010509	AGAT	2	8	44081	44088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010509	GCGG	2	8	44197	44204	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010509	GAGC	2	8	44277	44284	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010509	TCGC	2	8	44507	44514	0 %	25 %	25 %	50 %	170745053
119	NC_010509	CGCC	2	8	46832	46839	0 %	0 %	25 %	75 %	170745057
120	NC_010509	GCCG	2	8	46910	46917	0 %	0 %	50 %	50 %	170745057
121	NC_010509	GGGT	2	8	46971	46978	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.