MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD02

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010509	CGCA	2	8	1053	1060	25 %	0 %	25 %	50 %	170745006
2	NC_010509	CCAA	2	8	1169	1176	50 %	0 %	0 %	50 %	170745006
3	NC_010509	CAGG	2	8	1450	1457	25 %	0 %	50 %	25 %	170745006
4	NC_010509	AGGC	2	8	1763	1770	25 %	0 %	50 %	25 %	170745006
5	NC_010509	TCGC	2	8	1832	1839	0 %	25 %	25 %	50 %	170745006
6	NC_010509	ACCG	2	8	2014	2021	25 %	0 %	25 %	50 %	170745006
7	NC_010509	AGCC	2	8	2444	2451	25 %	0 %	25 %	50 %	170745007
8	NC_010509	GCAA	2	8	2516	2523	50 %	0 %	25 %	25 %	170745007
9	NC_010509	CGCA	2	8	2780	2787	25 %	0 %	25 %	50 %	170745007
10	NC_010509	CGGG	2	8	3024	3031	0 %	0 %	75 %	25 %	170745007
11	NC_010509	GCCG	2	8	3373	3380	0 %	0 %	50 %	50 %	170745007
12	NC_010509	GATC	2	8	3885	3892	25 %	25 %	25 %	25 %	170745008
13	NC_010509	GCGA	2	8	3976	3983	25 %	0 %	50 %	25 %	170745008
14	NC_010509	CCGT	2	8	5535	5542	0 %	25 %	25 %	50 %	170745010
15	NC_010509	GCCG	2	8	5594	5601	0 %	0 %	50 %	50 %	170745010
16	NC_010509	GATA	2	8	6302	6309	50 %	25 %	25 %	0 %	170745011
17	NC_010509	GTGA	2	8	6319	6326	25 %	25 %	50 %	0 %	170745011
18	NC_010509	CGAA	2	8	6803	6810	50 %	0 %	25 %	25 %	170745011
19	NC_010509	GCCG	2	8	6880	6887	0 %	0 %	50 %	50 %	170745011
20	NC_010509	TCGC	2	8	7379	7386	0 %	25 %	25 %	50 %	170745012
21	NC_010509	GCGG	2	8	7658	7665	0 %	0 %	75 %	25 %	170745012
22	NC_010509	CCGG	2	8	9048	9055	0 %	0 %	50 %	50 %	170745014
23	NC_010509	CGCA	2	8	9078	9085	25 %	0 %	25 %	50 %	170745014
24	NC_010509	CGAT	2	8	9510	9517	25 %	25 %	25 %	25 %	170745014
25	NC_010509	TGCG	2	8	11833	11840	0 %	25 %	50 %	25 %	170745016
26	NC_010509	GCCG	2	8	12138	12145	0 %	0 %	50 %	50 %	170745017
27	NC_010509	CCGC	2	8	12163	12170	0 %	0 %	25 %	75 %	170745017
28	NC_010509	TTGT	2	8	14479	14486	0 %	75 %	25 %	0 %	170745021
29	NC_010509	GGCA	2	8	14659	14666	25 %	0 %	50 %	25 %	170745022
30	NC_010509	CACC	2	8	15123	15130	25 %	0 %	0 %	75 %	170745023
31	NC_010509	CGGT	2	8	15580	15587	0 %	25 %	50 %	25 %	170745024
32	NC_010509	TGCT	2	8	15966	15973	0 %	50 %	25 %	25 %	170745025
33	NC_010509	CGCC	2	8	16770	16777	0 %	0 %	25 %	75 %	170745026
34	NC_010509	GCCG	2	8	16848	16855	0 %	0 %	50 %	50 %	170745026
35	NC_010509	GCCG	2	8	18300	18307	0 %	0 %	50 %	50 %	170745027
36	NC_010509	TGCG	2	8	18686	18693	0 %	25 %	50 %	25 %	170745028
37	NC_010509	CCGG	2	8	18813	18820	0 %	0 %	50 %	50 %	170745028
38	NC_010509	AGCG	2	8	20295	20302	25 %	0 %	50 %	25 %	170745029
39	NC_010509	TGCG	2	8	20544	20551	0 %	25 %	50 %	25 %	170745029
40	NC_010509	CCGA	2	8	20726	20733	25 %	0 %	25 %	50 %	170745029
41	NC_010509	GGCC	2	8	21341	21348	0 %	0 %	50 %	50 %	170745029
42	NC_010509	ACTG	2	8	21818	21825	25 %	25 %	25 %	25 %	170745030
43	NC_010509	CGAG	2	8	22641	22648	25 %	0 %	50 %	25 %	170745032
44	NC_010509	CCGC	2	8	22807	22814	0 %	0 %	25 %	75 %	170745032
45	NC_010509	TCGC	2	8	24251	24258	0 %	25 %	25 %	50 %	170745032
46	NC_010509	TGGA	2	8	24422	24429	25 %	25 %	50 %	0 %	170745032
47	NC_010509	TCCG	2	8	25202	25209	0 %	25 %	25 %	50 %	170745033
48	NC_010509	AGCA	2	8	25479	25486	50 %	0 %	25 %	25 %	170745033
49	NC_010509	AACT	2	8	25631	25638	50 %	25 %	0 %	25 %	170745033
50	NC_010509	CGAG	2	8	25793	25800	25 %	0 %	50 %	25 %	170745034
51	NC_010509	GCCA	2	8	25830	25837	25 %	0 %	25 %	50 %	170745034
52	NC_010509	CGAG	2	8	26357	26364	25 %	0 %	50 %	25 %	170745035
53	NC_010509	GTTC	2	8	26522	26529	0 %	50 %	25 %	25 %	170745035
54	NC_010509	GCAA	2	8	27237	27244	50 %	0 %	25 %	25 %	170745036
55	NC_010509	TGGC	2	8	27704	27711	0 %	25 %	50 %	25 %	170745037
56	NC_010509	TCGC	2	8	28123	28130	0 %	25 %	25 %	50 %	170745038
57	NC_010509	CCTG	2	8	29024	29031	0 %	25 %	25 %	50 %	170745039
58	NC_010509	CGAC	2	8	29170	29177	25 %	0 %	25 %	50 %	170745039
59	NC_010509	GCCC	2	8	29340	29347	0 %	0 %	25 %	75 %	170745039
60	NC_010509	CGTG	2	8	29638	29645	0 %	25 %	50 %	25 %	170745039
61	NC_010509	ATGG	2	8	30201	30208	25 %	25 %	50 %	0 %	170745040
62	NC_010509	GAAG	2	8	30801	30808	50 %	0 %	50 %	0 %	170745040
63	NC_010509	AGCG	2	8	31160	31167	25 %	0 %	50 %	25 %	170745040
64	NC_010509	TTGA	2	8	32135	32142	25 %	50 %	25 %	0 %	170745041
65	NC_010509	GCCG	2	8	32392	32399	0 %	0 %	50 %	50 %	170745041
66	NC_010509	CGTG	2	8	33424	33431	0 %	25 %	50 %	25 %	170745041
67	NC_010509	GCTC	2	8	34738	34745	0 %	25 %	25 %	50 %	170745042
68	NC_010509	TGGA	2	8	35707	35714	25 %	25 %	50 %	0 %	170745043
69	NC_010509	TCGG	2	8	36356	36363	0 %	25 %	50 %	25 %	170745043
70	NC_010509	AGGG	2	8	37499	37506	25 %	0 %	75 %	0 %	170745045
71	NC_010509	CTGT	2	8	37923	37930	0 %	50 %	25 %	25 %	170745046
72	NC_010509	GCCG	2	8	38208	38215	0 %	0 %	50 %	50 %	170745046
73	NC_010509	CCTG	2	8	38804	38811	0 %	25 %	25 %	50 %	170745047
74	NC_010509	GCTC	2	8	38941	38948	0 %	25 %	25 %	50 %	170745047
75	NC_010509	CGAT	2	8	39504	39511	25 %	25 %	25 %	25 %	170745047
76	NC_010509	TGGC	2	8	39692	39699	0 %	25 %	50 %	25 %	170745048
77	NC_010509	CTTC	2	8	39870	39877	0 %	50 %	0 %	50 %	170745048
78	NC_010509	AGCG	2	8	40081	40088	25 %	0 %	50 %	25 %	170745048
79	NC_010509	CCAC	2	8	40149	40156	25 %	0 %	0 %	75 %	170745048
80	NC_010509	CGTC	2	8	40805	40812	0 %	25 %	25 %	50 %	170745049
81	NC_010509	TTCG	2	8	41461	41468	0 %	50 %	25 %	25 %	170745049
82	NC_010509	CCCG	2	8	41528	41535	0 %	0 %	25 %	75 %	170745049
83	NC_010509	TCGC	2	8	44507	44514	0 %	25 %	25 %	50 %	170745053
84	NC_010509	CGCC	2	8	46832	46839	0 %	0 %	25 %	75 %	170745057
85	NC_010509	GCCG	2	8	46910	46917	0 %	0 %	50 %	50 %	170745057

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.