MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD02

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010509	GTC	3	9	90	98	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010509	GCC	2	6	102	107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_010509	GGC	2	6	108	113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010509	GCC	2	6	211	216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_010509	GCC	2	6	244	249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010509	CCT	2	6	2346	2351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_010509	CTA	2	6	3700	3705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010509	CAG	2	6	3707	3712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010509	GGC	2	6	3723	3728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010509	CTG	2	6	4210	4215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010509	GTC	2	6	4250	4255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010509	GTC	2	6	4426	4431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010509	GCC	2	6	4448	4453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_010509	AGC	2	6	4509	4514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010509	TGC	2	6	4545	4550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010509	GGT	2	6	4592	4597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010509	TGC	2	6	4728	4733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010509	GTA	2	6	4804	4809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010509	GCC	2	6	4815	4820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_010509	GCG	2	6	4864	4869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010509	TCA	2	6	4947	4952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010509	GGC	2	6	5783	5788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010509	CCA	2	6	5952	5957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_010509	ACG	2	6	8835	8840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010509	GTC	2	6	9601	9606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010509	GTT	2	6	9620	9625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010509	CTG	2	6	9629	9634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010509	TCT	2	6	9648	9653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010509	TTC	2	6	9704	9709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010509	TTC	2	6	9812	9817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010509	GCC	2	6	9875	9880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_010509	CGG	2	6	10074	10079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010509	ATG	2	6	10109	10114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010509	GCC	2	6	10229	10234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_010509	CGG	2	6	10296	10301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010509	CGG	2	6	10350	10355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010509	CAG	2	6	10396	10401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010509	GTA	2	6	10452	10457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010509	GAC	2	6	10556	10561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010509	GAA	2	6	11000	11005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010509	TGG	2	6	11021	11026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010509	GTC	2	6	11211	11216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010509	GCA	2	6	11229	11234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010509	GAC	2	6	11255	11260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010509	CGG	2	6	11312	11317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010509	GCT	2	6	11407	11412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010509	TCA	2	6	11444	11449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010509	CGG	2	6	12612	12617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010509	GCA	2	6	12956	12961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010509	CAA	2	6	13015	13020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010509	TCT	2	6	13071	13076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010509	CAG	2	6	13084	13089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010509	CAA	2	6	13195	13200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010509	GCG	2	6	13243	13248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010509	CAC	2	6	13275	13280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_010509	CGG	2	6	13303	13308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010509	TGC	2	6	13315	13320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010509	TCA	2	6	13322	13327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010509	CAT	2	6	13350	13355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010509	AGC	2	6	13363	13368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010509	ACA	2	6	13373	13378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010509	GTG	2	6	13426	13431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010509	CGG	2	6	13610	13615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010509	AAT	2	6	13642	13647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010509	CGA	2	6	13708	13713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010509	CGA	2	6	13717	13722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010509	TCT	2	6	13742	13747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010509	GTC	2	6	13764	13769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010509	GTG	2	6	14105	14110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010509	GTC	2	6	14111	14116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010509	GTG	2	6	14700	14705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010509	ATG	2	6	14791	14796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010509	GGC	2	6	16920	16925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010509	CGG	3	9	16933	16941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010509	GTC	3	9	17031	17039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010509	GCC	2	6	17043	17048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010509	GGC	2	6	17049	17054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010509	GCC	2	6	17152	17157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_010509	GTC	2	6	17207	17212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010509	GCC	2	6	17229	17234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_010509	CTG	2	6	17357	17362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010509	GAC	2	6	17370	17375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010509	ATG	2	6	17607	17612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010509	GCC	2	6	17617	17622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_010509	ATG	2	6	17798	17803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010509	GTA	2	6	17833	17838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010509	TAT	2	6	18366	18371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010509	CGC	2	6	31218	31223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010509	TTG	2	6	31246	31251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010509	TCA	2	6	31286	31291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010509	GTT	2	6	36513	36518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010509	CAC	3	9	36555	36563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_010509	GCG	2	6	36604	36609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010509	CAC	2	6	37181	37186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_010509	CAC	2	6	37255	37260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010509	GCG	2	6	37268	37273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010509	GGA	2	6	37904	37909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010509	CTT	2	6	40309	40314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010509	TCT	2	6	40450	40455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010509	GGC	2	6	40536	40541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010509	CGC	2	6	42997	43002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_010509	GCG	2	6	43019	43024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010509	ACA	2	6	43486	43491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010509	ACA	2	6	43497	43502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010509	GCC	2	6	43545	43550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_010509	ACA	2	6	43586	43591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010509	GCG	2	6	43626	43631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010509	TTG	2	6	43640	43645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010509	CCG	2	6	43665	43670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_010509	GCT	2	6	43748	43753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010509	GCC	3	9	43766	43774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_010509	ACC	2	6	43877	43882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_010509	GCG	2	6	43990	43995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010509	TCG	2	6	44013	44018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010509	TGG	2	6	44044	44049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010509	GCA	2	6	44213	44218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010509	CCA	2	6	44222	44227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_010509	CAG	2	6	44247	44252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010509	CAT	2	6	44256	44261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010509	CGT	2	6	44267	44272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010509	GCA	2	6	44285	44290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010509	TGC	2	6	44343	44348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010509	CTG	2	6	44358	44363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010509	CCT	2	6	45310	45315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_010509	GGC	2	6	46982	46987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010509	CGG	3	9	46995	47003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.