MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD08

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010507	GCCC	2	8	468	475	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_010507	CGGC	2	8	1722	1729	0 %	0 %	50 %	50 %	170744979
3	NC_010507	CTCG	2	8	2507	2514	0 %	25 %	25 %	50 %	170744980
4	NC_010507	GCCG	2	8	2604	2611	0 %	0 %	50 %	50 %	170744980
5	NC_010507	GCCG	2	8	2812	2819	0 %	0 %	50 %	50 %	170744980
6	NC_010507	CCGG	2	8	3573	3580	0 %	0 %	50 %	50 %	170744982
7	NC_010507	CTCG	2	8	4038	4045	0 %	25 %	25 %	50 %	170744982
8	NC_010507	GGCC	2	8	4154	4161	0 %	0 %	50 %	50 %	170744982
9	NC_010507	CGGA	2	8	4465	4472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010507	GCCC	2	8	4872	4879	0 %	0 %	25 %	75 %	170744983
11	NC_010507	CGCC	2	8	5480	5487	0 %	0 %	25 %	75 %	170744984
12	NC_010507	GCCG	2	8	5656	5663	0 %	0 %	50 %	50 %	170744985
13	NC_010507	AGCA	2	8	5844	5851	50 %	0 %	25 %	25 %	170744985
14	NC_010507	AGGC	2	8	6161	6168	25 %	0 %	50 %	25 %	170744985
15	NC_010507	CCTG	2	8	6328	6335	0 %	25 %	25 %	50 %	170744985
16	NC_010507	GCCG	2	8	6395	6402	0 %	0 %	50 %	50 %	170744985
17	NC_010507	ACGG	2	8	6900	6907	25 %	0 %	50 %	25 %	170744985
18	NC_010507	CCGG	2	8	6995	7002	0 %	0 %	50 %	50 %	170744985
19	NC_010507	CGGC	2	8	7143	7150	0 %	0 %	50 %	50 %	170744985
20	NC_010507	CTCG	2	8	7154	7161	0 %	25 %	25 %	50 %	170744985
21	NC_010507	CGGG	2	8	7230	7237	0 %	0 %	75 %	25 %	170744985
22	NC_010507	CCGG	2	8	7490	7497	0 %	0 %	50 %	50 %	170744985
23	NC_010507	CCGG	2	8	7627	7634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010507	CGGC	2	8	7731	7738	0 %	0 %	50 %	50 %	170744986
25	NC_010507	GGCC	2	8	7744	7751	0 %	0 %	50 %	50 %	170744986
26	NC_010507	CCGC	2	8	8176	8183	0 %	0 %	25 %	75 %	170744987
27	NC_010507	ATCT	2	8	8342	8349	25 %	50 %	0 %	25 %	170744987
28	NC_010507	TCAG	2	8	8704	8711	25 %	25 %	25 %	25 %	170744987
29	NC_010507	TGGT	2	8	8773	8780	0 %	50 %	50 %	0 %	170744987
30	NC_010507	CTCC	2	8	8795	8802	0 %	25 %	0 %	75 %	170744987
31	NC_010507	CCGG	2	8	8816	8823	0 %	0 %	50 %	50 %	170744987
32	NC_010507	CGCC	2	8	8937	8944	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_010507	CCTT	2	8	8948	8955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010507	CCGG	2	8	9111	9118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010507	AACC	2	8	9735	9742	50 %	0 %	0 %	50 %	170744988
36	NC_010507	GACG	2	8	9766	9773	25 %	0 %	50 %	25 %	170744988
37	NC_010507	GGCC	2	8	9997	10004	0 %	0 %	50 %	50 %	170744988
38	NC_010507	GCTC	2	8	10290	10297	0 %	25 %	25 %	50 %	170744989
39	NC_010507	GCCG	2	8	10338	10345	0 %	0 %	50 %	50 %	170744989
40	NC_010507	CGGG	2	8	10869	10876	0 %	0 %	75 %	25 %	170744989
41	NC_010507	CGAC	2	8	11021	11028	25 %	0 %	25 %	50 %	170744989
42	NC_010507	GCCG	2	8	13545	13552	0 %	0 %	50 %	50 %	170744991
43	NC_010507	CGGT	2	8	13656	13663	0 %	25 %	50 %	25 %	170744991
44	NC_010507	TAAC	2	8	14143	14150	50 %	25 %	0 %	25 %	170744992
45	NC_010507	CATC	2	8	14219	14226	25 %	25 %	0 %	50 %	170744992
46	NC_010507	GGCA	2	8	15410	15417	25 %	0 %	50 %	25 %	170744994
47	NC_010507	GCCG	2	8	15428	15435	0 %	0 %	50 %	50 %	170744994
48	NC_010507	CGGC	2	8	15532	15539	0 %	0 %	50 %	50 %	170744994
49	NC_010507	GAGC	2	8	15828	15835	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010507	GACG	2	8	15940	15947	25 %	0 %	50 %	25 %	170744995
51	NC_010507	GGTC	2	8	16503	16510	0 %	25 %	50 %	25 %	170744997
52	NC_010507	GGCT	2	8	16518	16525	0 %	25 %	50 %	25 %	170744997
53	NC_010507	TGCT	2	8	16648	16655	0 %	50 %	25 %	25 %	170744997
54	NC_010507	GCTC	2	8	16664	16671	0 %	25 %	25 %	50 %	170744997
55	NC_010507	GCTC	2	8	16949	16956	0 %	25 %	25 %	50 %	170744998
56	NC_010507	GACC	2	8	17041	17048	25 %	0 %	25 %	50 %	170744998
57	NC_010507	CGAG	2	8	17281	17288	25 %	0 %	50 %	25 %	170744999
58	NC_010507	CCGG	2	8	17635	17642	0 %	0 %	50 %	50 %	170744999
59	NC_010507	GTCG	2	8	17666	17673	0 %	25 %	50 %	25 %	170744999
60	NC_010507	GGTT	2	8	17740	17747	0 %	50 %	50 %	0 %	170744999
61	NC_010507	GCTA	2	8	18615	18622	25 %	25 %	25 %	25 %	170745001
62	NC_010507	CCGC	2	8	18712	18719	0 %	0 %	25 %	75 %	170745001
63	NC_010507	GACG	2	8	19477	19484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010507	CTGG	2	8	19671	19678	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010507	GCTC	2	8	20424	20431	0 %	25 %	25 %	50 %	170745004
66	NC_010507	CCCT	2	8	20682	20689	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.