MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD08

Total Repeats: 233

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010507	GCC	2	6	554	559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744978
2	NC_010507	GCC	2	6	678	683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744978
3	NC_010507	GCC	2	6	723	728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744978
4	NC_010507	GCC	2	6	782	787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744979
5	NC_010507	CGG	2	6	824	829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744979
6	NC_010507	CGG	2	6	850	855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744979
7	NC_010507	TTG	2	6	874	879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170744979
8	NC_010507	GCC	2	6	896	901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744979
9	NC_010507	GCT	2	6	940	945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744979
10	NC_010507	CGA	2	6	1011	1016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170744979
11	NC_010507	GGC	2	6	1021	1026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744979
12	NC_010507	GGC	2	6	1066	1071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744979
13	NC_010507	GCC	2	6	1268	1273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744979
14	NC_010507	CGC	2	6	1429	1434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744979
15	NC_010507	GGC	2	6	1437	1442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744979
16	NC_010507	GCC	2	6	1487	1492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744979
17	NC_010507	GCG	3	9	1552	1560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744979
18	NC_010507	CTG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744979
19	NC_010507	GCC	2	6	1897	1902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744979
20	NC_010507	GCG	2	6	1926	1931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744979
21	NC_010507	CAG	2	6	1997	2002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170744979
22	NC_010507	GCG	2	6	2014	2019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744979
23	NC_010507	TGC	2	6	2074	2079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744979
24	NC_010507	GCC	2	6	2308	2313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744980
25	NC_010507	GGC	2	6	2420	2425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744980
26	NC_010507	GGC	2	6	2489	2494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744980
27	NC_010507	CCG	2	6	2539	2544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744980
28	NC_010507	CGC	2	6	2567	2572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744980
29	NC_010507	CGC	2	6	2584	2589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744980
30	NC_010507	GCC	2	6	2633	2638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744980
31	NC_010507	CGC	2	6	2800	2805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744980
32	NC_010507	GCT	2	6	2855	2860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744980
33	NC_010507	TCG	2	6	2904	2909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744981
34	NC_010507	CGG	2	6	2992	2997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744981
35	NC_010507	CGG	2	6	3048	3053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744981
36	NC_010507	GGC	2	6	3073	3078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744981
37	NC_010507	ATG	2	6	3082	3087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170744981
38	NC_010507	AGA	3	9	3096	3104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170744982
39	NC_010507	CAT	2	6	3366	3371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170744982
40	NC_010507	GCG	2	6	3443	3448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744982
41	NC_010507	TGA	2	6	3452	3457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170744982
42	NC_010507	CCG	2	6	3489	3494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744982
43	NC_010507	CGG	2	6	3495	3500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744982
44	NC_010507	CGC	2	6	3585	3590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744982
45	NC_010507	GCC	3	9	3760	3768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744982
46	NC_010507	GCC	2	6	3790	3795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744982
47	NC_010507	GCC	2	6	3922	3927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744982
48	NC_010507	CGA	2	6	4068	4073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170744982
49	NC_010507	CGT	2	6	4088	4093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744982
50	NC_010507	GCC	2	6	4123	4128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744982
51	NC_010507	GGC	2	6	4134	4139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744982
52	NC_010507	CCT	2	6	4292	4297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170744982
53	NC_010507	GCC	2	6	4435	4440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744982
54	NC_010507	TCG	2	6	4613	4618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744983
55	NC_010507	GTG	2	6	4703	4708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170744983
56	NC_010507	CGC	2	6	4782	4787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744983
57	NC_010507	CGC	2	6	4882	4887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744983
58	NC_010507	CGC	2	6	5024	5029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744984
59	NC_010507	GCA	2	6	5037	5042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170744984
60	NC_010507	CGC	2	6	5046	5051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744984
61	NC_010507	CCA	2	6	5093	5098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170744984
62	NC_010507	CGG	2	6	5163	5168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744984
63	NC_010507	CGT	2	6	5265	5270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744984
64	NC_010507	GAG	2	6	5272	5277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170744984
65	NC_010507	CGG	2	6	5304	5309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744984
66	NC_010507	GAC	2	6	5368	5373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170744984
67	NC_010507	GCG	2	6	5429	5434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744984
68	NC_010507	GCC	2	6	5452	5457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744984
69	NC_010507	TGA	2	6	5463	5468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170744984
70	NC_010507	GCC	2	6	5470	5475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744984
71	NC_010507	GCG	3	9	5574	5582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744985
72	NC_010507	CCG	2	6	5589	5594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744985
73	NC_010507	CGC	2	6	5598	5603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744985
74	NC_010507	ACG	2	6	5604	5609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170744985
75	NC_010507	CCG	2	6	5643	5648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744985
76	NC_010507	TGA	2	6	6050	6055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170744985
77	NC_010507	CCG	2	6	6104	6109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744985
78	NC_010507	CAC	2	6	6273	6278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170744985
79	NC_010507	GGC	2	6	6366	6371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744985
80	NC_010507	CGC	2	6	6614	6619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744985
81	NC_010507	CGG	2	6	6628	6633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744985
82	NC_010507	GGC	2	6	6646	6651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744985
83	NC_010507	CGT	2	6	6668	6673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744985
84	NC_010507	CGG	2	6	6701	6706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744985
85	NC_010507	CCG	2	6	6717	6722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744985
86	NC_010507	CGT	2	6	6830	6835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744985
87	NC_010507	CAG	2	6	6877	6882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170744985
88	NC_010507	AGC	2	6	6883	6888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170744985
89	NC_010507	CGG	2	6	6953	6958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744985
90	NC_010507	CGC	2	6	7219	7224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744985
91	NC_010507	GGA	2	6	7253	7258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170744985
92	NC_010507	CGC	3	9	7373	7381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744985
93	NC_010507	GGC	2	6	7481	7486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744985
94	NC_010507	TAG	2	6	7552	7557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170744985
95	NC_010507	CGG	2	6	7578	7583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744985
96	NC_010507	GCT	2	6	7696	7701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744986
97	NC_010507	GAA	2	6	7774	7779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170744986
98	NC_010507	GTC	2	6	7829	7834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744986
99	NC_010507	GCG	2	6	7844	7849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744986
100	NC_010507	TCC	2	6	7895	7900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170744986
101	NC_010507	GCG	2	6	7944	7949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744986
102	NC_010507	ATG	2	6	8078	8083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170744987
103	NC_010507	TAG	2	6	8113	8118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170744987
104	NC_010507	GCC	2	6	8381	8386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744987
105	NC_010507	GCG	2	6	8421	8426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744987
106	NC_010507	ATT	2	6	8427	8432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170744987
107	NC_010507	GAA	2	6	8627	8632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170744987
108	NC_010507	GTA	2	6	8687	8692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170744987
109	NC_010507	CCG	2	6	8745	8750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744987
110	NC_010507	TGA	2	6	9138	9143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170744988
111	NC_010507	CGG	2	6	9229	9234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744988
112	NC_010507	TCG	2	6	9282	9287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744988
113	NC_010507	CGG	2	6	9338	9343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744988
114	NC_010507	GAC	2	6	9470	9475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170744988
115	NC_010507	TGC	2	6	9489	9494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744988
116	NC_010507	GCG	2	6	9513	9518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744988
117	NC_010507	GGC	3	9	9538	9546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744988
118	NC_010507	CGT	2	6	9547	9552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744988
119	NC_010507	CGT	2	6	9577	9582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744988
120	NC_010507	CGT	2	6	9586	9591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744988
121	NC_010507	GCA	2	6	9672	9677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170744988
122	NC_010507	CGT	2	6	9682	9687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744988
123	NC_010507	TGC	2	6	9690	9695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744988
124	NC_010507	TCA	2	6	9849	9854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170744988
125	NC_010507	GAA	2	6	9874	9879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170744988
126	NC_010507	CCG	2	6	10035	10040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744988
127	NC_010507	CGG	3	9	10068	10076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744988
128	NC_010507	ATG	3	9	10083	10091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170744988
129	NC_010507	CGG	2	6	10179	10184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744988
130	NC_010507	GAT	2	6	10260	10265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170744988
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134	NC_010507	GGC	2	6	10572	10577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744989
135	NC_010507	CGA	2	6	10590	10595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170744989
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233	NC_010507	GCC	2	6	20527	20532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745004

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.