MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella woodyi ATCC 51908 chromosome

Total Repeats: 279

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010506	AAAACA	2	12	23116	23127	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010506	AGAATT	2	12	28807	28818	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010506	CATAGA	2	12	50247	50258	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010506	CCTTAT	2	12	54465	54476	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010506	CTTGTT	2	12	54940	54951	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010506	TGAAGG	2	12	56406	56417	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010506	ACAAAA	2	12	72834	72845	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010506	TTACTT	2	12	72878	72889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010506	GGTTAA	2	12	84153	84164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010506	ATCATT	2	12	111272	111283	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_010506	ATCATT	2	12	111609	111620	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010506	ATATTC	2	12	152102	152113	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010506	TCCTGT	2	12	301982	301993	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010506	TTTTCT	2	12	306500	306511	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010506	CAAAAA	2	12	323119	323130	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010506	AAAATA	2	12	323991	324002	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010506	CCTTAT	2	12	345159	345170	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010506	CTTGTT	2	12	345634	345645	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010506	TGAAGG	2	12	347218	347229	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010506	ATACGC	2	12	366903	366914	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010506	CCTTAT	2	12	411315	411326	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010506	CTTGTT	2	12	411789	411800	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_010506	TGAAGG	2	12	413255	413266	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010506	GCTATT	2	12	416212	416223	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010506	TAACAA	2	12	430773	430784	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_010506	TTAAAC	2	12	451303	451314	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010506	AGTTTC	2	12	454732	454743	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_010506	GTATTT	2	12	469739	469750	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010506	AAAATA	2	12	484947	484958	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010506	TATAAA	2	12	488143	488154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010506	TTAAAA	2	12	491875	491886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010506	ACACTC	3	18	509047	509064	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010506	ATGATT	2	12	520251	520262	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010506	TATTTT	2	12	586975	586986	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010506	GAACAG	2	12	674334	674345	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_010506	TTTTCT	2	12	700660	700671	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010506	TAGGAG	2	12	734051	734062	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010506	TTAAGG	2	12	744463	744474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010506	TTAACT	2	12	747286	747297	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010506	CTACAT	2	12	752484	752495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010506	CCTTTA	2	12	773923	773934	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010506	TATTTT	2	12	849249	849260	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010506	TATCGA	2	12	907734	907745	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_010506	GCGTGG	2	12	924331	924342	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_010506	GCGTGG	2	12	924411	924422	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010506	GCGTGG	2	12	924491	924502	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010506	TCAAAT	2	12	955863	955874	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_010506	TATAGC	2	12	964039	964050	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_010506	ACAAAA	2	12	1144899	1144910	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_010506	ACCTGA	2	12	1145679	1145690	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010506	CTGACT	2	12	1261497	1261508	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010506	ATTGAT	2	12	1380184	1380195	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010506	TATTTT	2	12	1384948	1384959	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010506	AGGTGT	2	12	1385494	1385505	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010506	AATCTA	2	12	1400043	1400054	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_010506	ATTTTG	2	12	1409880	1409891	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010506	TGGCGG	2	12	1412875	1412886	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_010506	TTAAAA	2	12	1423662	1423673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010506	TTGTTT	2	12	1451248	1451259	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010506	TGAGTA	2	12	1453569	1453580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010506	TAACGA	2	12	1477433	1477444	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_010506	AAGCTT	2	12	1512452	1512463	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_010506	GGTTGC	2	12	1516846	1516857	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010506	TTATAG	2	12	1532934	1532945	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010506	AAAAAT	2	12	1542628	1542639	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010506	TAAACT	2	12	1559577	1559588	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_010506	AATTTT	2	12	1559779	1559790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010506	TCTGTT	2	12	1570609	1570620	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010506	AAGTAT	2	12	1608502	1608513	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010506	GTGATC	2	12	1626685	1626696	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010506	TCTATT	2	12	1630141	1630152	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_010506	GTTTTA	2	12	1669873	1669884	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010506	ATCATT	2	12	1690589	1690600	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_010506	TCTGCA	2	12	1697215	1697226	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010506	TGTGAT	2	12	1736159	1736170	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010506	CCGTGC	2	12	1741157	1741168	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010506	ATAAAA	2	12	1761902	1761913	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010506	GCTCTG	2	12	1807159	1807170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010506	ATTTAA	2	12	1830331	1830342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010506	AAAGAT	2	12	1842883	1842894	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010506	AATGAC	2	12	1865207	1865218	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_010506	TATTTA	2	12	1872812	1872823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010506	TATTTT	2	12	1872972	1872983	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010506	CTTAAG	2	12	1885001	1885012	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_010506	CTAAAA	2	12	1895165	1895176	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_010506	ATTTAA	2	12	1898804	1898815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010506	TGAGCA	2	12	1904123	1904134	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_010506	TGATCT	2	12	1914774	1914785	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_010506	AATAGA	2	12	1931035	1931046	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010506	AATCGA	2	12	1990316	1990327	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_010506	TATAGA	2	12	2015007	2015018	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010506	TTACTA	2	12	2041175	2041186	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_010506	TATAAA	2	12	2073868	2073879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010506	CTGTTT	2	12	2088993	2089004	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_010506	AAAATC	2	12	2100414	2100425	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_010506	AGTTAG	2	12	2123334	2123345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010506	TTTTAA	2	12	2161547	2161558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010506	TTATTT	2	12	2161579	2161590	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010506	TTATAC	2	12	2173976	2173987	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_010506	ATTTAG	2	12	2181299	2181310	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010506	CTACTT	2	12	2281499	2281510	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010506	TTCATT	2	12	2281597	2281608	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_010506	TATAAA	2	12	2338967	2338978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010506	TTAACA	2	12	2367337	2367348	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_010506	GTTTTA	2	12	2382668	2382679	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010506	GGGATA	2	12	2429274	2429285	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010506	TGTTTT	2	12	2572967	2572978	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010506	TAATTG	2	12	2608589	2608600	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010506	ATCCCT	2	12	2637968	2637979	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010506	ATCCCT	2	12	2638434	2638445	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_010506	TCGTGA	2	12	2638985	2638996	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_010506	GAAAAT	2	12	2643375	2643386	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010506	ATGTTT	2	12	2688629	2688640	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010506	ACCATA	2	12	2732079	2732090	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010506	TTGAAT	2	12	2736146	2736157	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010506	ATAAAT	2	12	2750962	2750973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010506	TTGTTT	2	12	2768793	2768804	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010506	GTTATC	2	12	2788183	2788194	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_010506	GATTAA	2	12	2794177	2794188	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010506	GCCAAC	2	12	2807351	2807362	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_010506	CTTTTT	2	12	2845313	2845324	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_010506	ATTTTT	2	12	2860110	2860121	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010506	TCTCTA	4	24	2874897	2874920	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010506	TAACAA	2	12	2893153	2893164	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_010506	CTTATA	2	12	2971271	2971282	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_010506	CTCATC	2	12	2978991	2979002	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010506	AATCAA	2	12	2994286	2994297	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_010506	TTTAAA	2	12	3019450	3019461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010506	AGGGAT	2	12	3020735	3020746	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010506	AGGTAA	2	12	3032507	3032518	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010506	TTTAAG	2	12	3042452	3042463	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010506	TACACA	2	12	3118169	3118180	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010506	AGTAAA	2	12	3126017	3126028	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010506	AAGATA	2	12	3172183	3172194	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010506	AATTTA	2	12	3181654	3181665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010506	ACAAAA	2	12	3182854	3182865	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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138	NC_010506	TCGATA	2	12	3401401	3401412	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_010506	CCTTCA	2	12	3438446	3438457	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010506	ATAAGG	2	12	3441061	3441072	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010506	GATAAT	2	12	3471296	3471307	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_010506	ACTCAA	2	12	3511348	3511359	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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146	NC_010506	TATATT	2	12	3538855	3538866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010506	AAAACA	2	12	3569240	3569251	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_010506	TTTAGC	2	12	3573619	3573630	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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151	NC_010506	AAACAA	2	12	3596095	3596106	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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155	NC_010506	CCTCAA	2	12	3690205	3690216	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_010506	TTATTT	2	12	3778444	3778455	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_010506	ATATAA	2	12	3809935	3809946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_010506	CTTTTC	2	12	3827558	3827569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_010506	TATTTT	2	12	3881771	3881782	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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235	NC_010506	ACTAAA	2	12	5249110	5249121	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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239	NC_010506	TAAGCT	2	12	5366464	5366475	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
240	NC_010506	AGGGAT	2	12	5369525	5369536	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
241	NC_010506	TCAAAC	2	12	5371918	5371929	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
242	NC_010506	TAGAAA	2	12	5377894	5377905	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
243	NC_010506	CGATCT	2	12	5423380	5423391	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
244	NC_010506	CAAAAA	2	12	5430413	5430424	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
245	NC_010506	CGAATG	2	12	5453458	5453469	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
246	NC_010506	AGTTTA	2	12	5465362	5465373	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
247	NC_010506	CCTTCA	2	12	5474932	5474943	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
248	NC_010506	AACAAG	2	12	5476398	5476409	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
249	NC_010506	ATAAGG	2	12	5476926	5476937	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
250	NC_010506	CCTTCA	2	12	5482186	5482197	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
251	NC_010506	ATAAGG	2	12	5484675	5484686	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_010506	AAGCTT	2	12	5512856	5512867	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
253	NC_010506	TTTAAT	2	12	5516063	5516074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_010506	ACAAAA	2	12	5517731	5517742	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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257	NC_010506	TAATTC	2	12	5552540	5552551	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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261	NC_010506	AACAAG	2	12	5630760	5630771	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.