MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 27815 chromosome

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010503	ATATTA	2	12	4990	5001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010503	TTTGTT	2	12	8944	8955	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010503	TTTTAA	2	12	22047	22058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010503	TTTAAA	2	12	39936	39947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010503	TAAAAA	2	12	79888	79899	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010503	CTAATT	2	12	105741	105752	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010503	ATTGCT	2	12	152529	152540	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010503	AAATTA	2	12	161587	161598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010503	TTATAA	2	12	188230	188241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010503	TATTTT	2	12	209332	209343	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010503	ATAAAA	2	12	216129	216140	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010503	TAAAAA	2	12	254504	254515	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010503	ATAAAA	2	12	256126	256137	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010503	TAATTC	2	12	260550	260561	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010503	CGAAAA	2	12	262358	262369	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010503	TAAAAA	2	12	267813	267824	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010503	TTATTT	2	12	294575	294586	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010503	ATTAAA	2	12	305632	305643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010503	AATAAA	2	12	337805	337816	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010503	AAGATA	2	12	374696	374707	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010503	TATATT	2	12	374715	374726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010503	GATTTA	2	12	377158	377169	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010503	TTTGTT	2	12	395009	395020	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010503	AATTAA	2	12	397487	397498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010503	AATAAA	2	12	400665	400676	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010503	ATTAAA	2	12	407599	407610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010503	TTTATA	2	12	411052	411063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010503	TATTGA	2	12	426724	426735	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010503	TTTTAA	2	12	428658	428669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010503	GCACTT	2	12	428706	428717	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010503	AAATTC	2	12	429649	429660	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010503	AAAGAT	2	12	436225	436236	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010503	TAAAAA	2	12	466411	466422	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010503	AACTTA	2	12	504252	504263	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010503	CATAAT	2	12	506981	506992	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_010503	AGTTCA	2	12	507594	507605	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010503	ATTATA	2	12	508165	508176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010503	TTAAAT	2	12	584392	584403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010503	ATAAAA	2	12	621287	621298	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010503	TTTTAA	2	12	626587	626598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010503	ATATAA	2	12	630735	630746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010503	AAATAT	2	12	641177	641188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010503	TTATAA	2	12	648481	648492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010503	ATTTAA	2	12	688592	688603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010503	TTTAAA	2	12	688619	688630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010503	AAATTT	2	12	732850	732861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.