MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 27815 chromosome

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010503	TTATT	2	10	1921	1930	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010503	ATTTT	2	10	26750	26759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010503	GAAAT	2	10	34528	34537	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010503	TTTTA	2	10	34623	34632	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010503	TTGTT	2	10	34638	34647	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010503	TAAGT	2	10	35453	35462	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010503	ACAAA	2	10	35496	35505	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_010503	ATATT	2	10	36550	36559	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010503	TTTTA	2	10	39987	39996	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010503	TGTTT	2	10	66353	66362	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010503	AATTA	2	10	88504	88513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010503	TATAA	2	10	95577	95586	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010503	TACTT	2	10	101654	101663	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010503	ATAGG	2	10	102215	102224	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010503	AAATT	2	10	105726	105735	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010503	AACAT	2	10	110908	110917	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010503	ATTTT	2	10	111082	111091	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010503	TAATA	2	10	112620	112629	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010503	AAATT	2	10	112735	112744	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010503	AATTA	2	10	115386	115395	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010503	AATTT	2	10	119270	119279	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010503	TTTTA	2	10	119405	119414	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010503	ATTTT	2	10	135098	135107	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010503	TATTT	2	10	136747	136756	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010503	TCGTG	2	10	146429	146438	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010503	ATTAA	2	10	147128	147137	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010503	GTGAA	2	10	147367	147376	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010503	GAAAA	2	10	147395	147404	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010503	GAATG	2	10	149594	149603	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010503	CTCAT	2	10	149699	149708	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_010503	CGCTA	2	10	150249	150258	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_010503	AAATT	2	10	153939	153948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010503	TAAAA	2	10	161652	161661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010503	TTTTA	2	10	187888	187897	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010503	AAACC	2	10	188242	188251	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_010503	GGTTT	2	10	188257	188266	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010503	TAAAA	2	10	194802	194811	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010503	CTTCT	2	10	194823	194832	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_010503	GTTTA	2	10	209044	209053	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010503	TTTTA	2	10	216026	216035	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010503	ATATT	2	10	217755	217764	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010503	TTAAT	2	10	235542	235551	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010503	ATTAT	3	15	253501	253515	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010503	TTATT	2	10	254559	254568	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010503	TAAAA	2	10	254884	254893	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010503	TAATA	2	10	262300	262309	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010503	CAAAT	2	10	270489	270498	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_010503	GAAAT	2	10	271738	271747	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010503	AATTT	2	10	272126	272135	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010503	ATTAT	2	10	297489	297498	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010503	TTAAA	2	10	300617	300626	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010503	ATATT	2	10	300689	300698	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010503	TCTTA	2	10	305734	305743	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_010503	ATTAT	2	10	310448	310457	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010503	TAAAT	2	10	312521	312530	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010503	TCGTG	2	10	345024	345033	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_010503	ATTAA	2	10	345723	345732	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010503	GTGAA	2	10	345962	345971	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010503	GAAAA	2	10	345990	345999	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010503	GAATG	2	10	348189	348198	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010503	CTCAT	2	10	348294	348303	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_010503	CGCTA	2	10	348844	348853	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_010503	ATTTA	2	10	354237	354246	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010503	GCATA	2	10	355669	355678	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_010503	AAATT	2	10	355847	355856	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010503	AGAAC	2	10	355909	355918	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_010503	ATTAT	2	10	359249	359258	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010503	AAAGC	2	10	359997	360006	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_010503	TCAGT	2	10	374774	374783	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_010503	TTATT	2	10	374784	374793	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010503	AAATT	2	10	378108	378117	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010503	TAATT	2	10	379421	379430	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010503	ATTTA	2	10	387720	387729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010503	TAATA	2	10	391483	391492	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010503	AATTA	2	10	400685	400694	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010503	AAATT	2	10	418771	418780	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010503	ATTTA	2	10	427318	427327	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010503	ATTTT	2	10	427329	427338	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010503	ATTAA	2	10	437627	437636	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010503	TATCT	2	10	437704	437713	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_010503	TTGTT	2	10	462209	462218	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010503	TAAAA	2	10	488090	488099	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010503	TAATG	2	10	492344	492353	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010503	TAATA	2	10	493554	493563	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010503	ATTTT	2	10	496189	496198	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010503	TAATT	2	10	496418	496427	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010503	TAAAA	2	10	497620	497629	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010503	ATAAA	2	10	500224	500233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010503	ATTTT	2	10	500266	500275	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010503	ACGAA	2	10	504402	504411	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_010503	CATTT	2	10	507750	507759	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_010503	TAATT	2	10	511475	511484	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010503	TATTT	2	10	520038	520047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010503	ATTAT	2	10	528678	528687	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010503	ATTTC	2	10	528864	528873	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_010503	TTATT	2	10	537516	537525	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010503	TGTTT	2	10	537576	537585	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010503	TTTAT	2	10	537593	537602	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010503	TAAAT	2	10	550114	550123	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010503	TAATT	2	10	553364	553373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010503	CTAAT	2	10	553511	553520	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_010503	AATTT	2	10	555477	555486	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010503	AATTT	2	10	555550	555559	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010503	TAATT	2	10	558420	558429	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010503	TTAAT	2	10	558467	558476	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010503	GCAAA	2	10	581515	581524	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_010503	TTAAA	2	10	584425	584434	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010503	AATTT	2	10	584528	584537	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010503	TAATT	2	10	588381	588390	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010503	TAATT	2	10	611540	611549	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010503	AAAAT	2	10	621307	621316	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010503	TTTTA	2	10	621324	621333	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010503	ATAAA	2	10	623013	623022	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010503	TAATT	2	10	624911	624920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010503	AATTC	2	10	658664	658673	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_010503	TTTTA	2	10	660936	660945	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010503	TATAT	2	10	664128	664137	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010503	TAATA	2	10	664148	664157	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010503	GTTAA	2	10	670716	670725	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010503	TATAC	2	10	670816	670825	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_010503	TCTTT	2	10	680961	680970	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_010503	TTAAA	2	10	687172	687181	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010503	AGTTT	2	10	688515	688524	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010503	AAATA	2	10	688871	688880	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010503	TTATA	2	10	705735	705744	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010503	TAAAA	2	10	717966	717975	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010503	AAATC	2	10	722241	722250	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_010503	TATAA	2	10	724117	724126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010503	TTGAA	2	10	725949	725958	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010503	AAAAT	2	10	727501	727510	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010503	AAAAG	2	10	731135	731144	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010503	TAATA	2	10	735920	735929	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010503	ATATT	2	10	738130	738139	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010503	TTCAA	2	10	751016	751025	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.