MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD06

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010502	CGGC	2	8	104	111	0 %	0 %	50 %	50 %	170745611
2	NC_010502	CGGT	2	8	167	174	0 %	25 %	50 %	25 %	170745611
3	NC_010502	CGCC	2	8	233	240	0 %	0 %	25 %	75 %	170745611
4	NC_010502	CGTG	2	8	665	672	0 %	25 %	50 %	25 %	170745612
5	NC_010502	CTGG	2	8	1543	1550	0 %	25 %	50 %	25 %	170745614
6	NC_010502	CGCC	2	8	2086	2093	0 %	0 %	25 %	75 %	170745615
7	NC_010502	GACC	2	8	3437	3444	25 %	0 %	25 %	50 %	170745617
8	NC_010502	GCGA	2	8	4532	4539	25 %	0 %	50 %	25 %	170745618
9	NC_010502	TAGC	2	8	4874	4881	25 %	25 %	25 %	25 %	170745619
10	NC_010502	CCAG	2	8	5760	5767	25 %	0 %	25 %	50 %	170745620
11	NC_010502	GGCC	2	8	6303	6310	0 %	0 %	50 %	50 %	170745621
12	NC_010502	CGGG	2	8	6796	6803	0 %	0 %	75 %	25 %	170745622
13	NC_010502	CGAC	2	8	6867	6874	25 %	0 %	25 %	50 %	170745622
14	NC_010502	CTGG	2	8	6946	6953	0 %	25 %	50 %	25 %	170745622
15	NC_010502	ACCT	2	8	6962	6969	25 %	25 %	0 %	50 %	170745622
16	NC_010502	GCTG	2	8	6984	6991	0 %	25 %	50 %	25 %	170745622
17	NC_010502	GAGG	2	8	7439	7446	25 %	0 %	75 %	0 %	170745623
18	NC_010502	GGCC	2	8	7545	7552	0 %	0 %	50 %	50 %	170745623
19	NC_010502	GCCC	2	8	7779	7786	0 %	0 %	25 %	75 %	170745623
20	NC_010502	GCCG	2	8	8423	8430	0 %	0 %	50 %	50 %	170745624
21	NC_010502	GACT	2	8	8624	8631	25 %	25 %	25 %	25 %	170745624
22	NC_010502	CGGC	2	8	9070	9077	0 %	0 %	50 %	50 %	170745624
23	NC_010502	CGTG	2	8	11371	11378	0 %	25 %	50 %	25 %	170745627
24	NC_010502	CTGA	2	8	11521	11528	25 %	25 %	25 %	25 %	170745627
25	NC_010502	TCTG	2	8	12360	12367	0 %	50 %	25 %	25 %	170745628
26	NC_010502	TACG	2	8	12583	12590	25 %	25 %	25 %	25 %	170745628
27	NC_010502	GCCG	2	8	12699	12706	0 %	0 %	50 %	50 %	170745628
28	NC_010502	CGCC	2	8	12861	12868	0 %	0 %	25 %	75 %	170745628
29	NC_010502	CGGC	2	8	18533	18540	0 %	0 %	50 %	50 %	170745629
30	NC_010502	CAGC	2	8	18729	18736	25 %	0 %	25 %	50 %	170745629
31	NC_010502	CAGC	2	8	19128	19135	25 %	0 %	25 %	50 %	170745629
32	NC_010502	CGGC	2	8	19331	19338	0 %	0 %	50 %	50 %	170745629
33	NC_010502	CGGG	2	8	19712	19719	0 %	0 %	75 %	25 %	170745629
34	NC_010502	CGGC	2	8	20024	20031	0 %	0 %	50 %	50 %	170745629
35	NC_010502	CAGC	2	8	20220	20227	25 %	0 %	25 %	50 %	170745629
36	NC_010502	CAGC	2	8	20619	20626	25 %	0 %	25 %	50 %	170745629
37	NC_010502	ACGG	2	8	21061	21068	25 %	0 %	50 %	25 %	170745629
38	NC_010502	GGAA	2	8	21201	21208	50 %	0 %	50 %	0 %	170745629
39	NC_010502	GCTC	2	8	21260	21267	0 %	25 %	25 %	50 %	170745629
40	NC_010502	CAAG	2	8	21282	21289	50 %	0 %	25 %	25 %	170745629
41	NC_010502	ATCT	2	8	21443	21450	25 %	50 %	0 %	25 %	170745629
42	NC_010502	TAAT	2	8	21503	21510	50 %	50 %	0 %	0 %	170745629
43	NC_010502	ACGA	2	8	21682	21689	50 %	0 %	25 %	25 %	170745629
44	NC_010502	GCCG	2	8	22093	22100	0 %	0 %	50 %	50 %	170745630
45	NC_010502	TGGC	2	8	23568	23575	0 %	25 %	50 %	25 %	170745630
46	NC_010502	GAGC	2	8	23743	23750	25 %	0 %	50 %	25 %	170745630
47	NC_010502	CCTC	2	8	24058	24065	0 %	25 %	0 %	75 %	170745631
48	NC_010502	CGAT	2	8	24226	24233	25 %	25 %	25 %	25 %	170745631
49	NC_010502	TCGG	2	8	24374	24381	0 %	25 %	50 %	25 %	170745631
50	NC_010502	CGAG	2	8	24646	24653	25 %	0 %	50 %	25 %	170745631
51	NC_010502	ACCA	2	8	26095	26102	50 %	0 %	0 %	50 %	170745632
52	NC_010502	CCTT	2	8	26355	26362	0 %	50 %	0 %	50 %	170745632
53	NC_010502	CGCT	2	8	27517	27524	0 %	25 %	25 %	50 %	170745633
54	NC_010502	CGCT	2	8	27644	27651	0 %	25 %	25 %	50 %	170745633
55	NC_010502	CGGC	2	8	27666	27673	0 %	0 %	50 %	50 %	170745633

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.