MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD06

Total Repeats: 440

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010502	CTT	2	6	26	31	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170745611
2	NC_010502	TGC	2	6	90	95	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745611
3	NC_010502	GGC	2	6	118	123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745611
4	NC_010502	TGG	2	6	150	155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170745611
5	NC_010502	GTC	2	6	249	254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745611
6	NC_010502	CGC	2	6	257	262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745611
7	NC_010502	AAC	2	6	288	293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170745611
8	NC_010502	CGC	2	6	517	522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745612
9	NC_010502	CGT	2	6	696	701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745612
10	NC_010502	GCG	2	6	718	723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745612
11	NC_010502	GTT	2	6	801	806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170745612
12	NC_010502	AGT	2	6	906	911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010502	GGT	2	6	922	927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010502	CGC	2	6	1126	1131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745613
15	NC_010502	CCT	2	6	1192	1197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745613
16	NC_010502	GGC	2	6	1223	1228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745613
17	NC_010502	CGC	2	6	1261	1266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745613
18	NC_010502	CAC	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745613
19	NC_010502	CGA	2	6	1294	1299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745613
20	NC_010502	GAG	2	6	1310	1315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745613
21	NC_010502	CGG	2	6	1330	1335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745613
22	NC_010502	TGG	2	6	1378	1383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010502	CGA	2	6	1511	1516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010502	TGC	2	6	1526	1531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745614
25	NC_010502	ACC	2	6	1629	1634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745614
26	NC_010502	ACC	2	6	1642	1647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745614
27	NC_010502	CGG	2	6	1694	1699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745614
28	NC_010502	CGT	2	6	1725	1730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745614
29	NC_010502	GAG	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745614
30	NC_010502	GGC	2	6	1781	1786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745614
31	NC_010502	CTC	2	6	1797	1802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745615
32	NC_010502	CGC	2	6	1910	1915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745615
33	NC_010502	TCG	2	6	1916	1921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745615
34	NC_010502	TCA	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170745615
35	NC_010502	CGT	2	6	1961	1966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745615
36	NC_010502	TCC	2	6	2014	2019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745615
37	NC_010502	TCG	2	6	2104	2109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745615
38	NC_010502	GCT	2	6	2132	2137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745615
39	NC_010502	TCC	2	6	2149	2154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745615
40	NC_010502	CGA	2	6	2168	2173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745615
41	NC_010502	GCC	2	6	2258	2263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745615
42	NC_010502	ATG	2	6	2324	2329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010502	AAG	2	6	2337	2342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010502	GGC	2	6	2505	2510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010502	AAC	2	6	2596	2601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170745616
46	NC_010502	CGC	2	6	2664	2669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745616
47	NC_010502	GGC	2	6	2718	2723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745616
48	NC_010502	GCC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_010502	CGA	2	6	2927	2932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010502	TCC	3	9	3024	3032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745617
51	NC_010502	TGA	2	6	3053	3058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745617
52	NC_010502	CAA	2	6	3326	3331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170745617
53	NC_010502	CTG	2	6	3510	3515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745617
54	NC_010502	TCT	2	6	3533	3538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170745617
55	NC_010502	ACT	2	6	3569	3574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010502	GGA	2	6	3575	3580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010502	GTG	2	6	3615	3620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010502	GGC	2	6	3644	3649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010502	GCC	2	6	3750	3755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_010502	GGC	2	6	3759	3764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010502	ACC	2	6	3879	3884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_010502	CGG	2	6	3905	3910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010502	GGC	2	6	3921	3926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010502	CGG	3	9	3995	4003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010502	GCG	2	6	4026	4031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010502	GCC	2	6	4034	4039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_010502	AGC	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010502	CCG	2	6	4052	4057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_010502	AAC	2	6	4095	4100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170745618
70	NC_010502	TAG	2	6	4184	4189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745618
71	NC_010502	CTT	2	6	4196	4201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170745618
72	NC_010502	ATA	2	6	4379	4384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170745618
73	NC_010502	TCT	2	6	4494	4499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170745618
74	NC_010502	CTT	2	6	4522	4527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170745618
75	NC_010502	TTG	2	6	4566	4571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170745618
76	NC_010502	TCG	2	6	4632	4637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745618
77	NC_010502	TAA	2	6	4638	4643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170745618
78	NC_010502	GTC	2	6	4679	4684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745618
79	NC_010502	GAA	2	6	4716	4721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170745619
80	NC_010502	TTC	2	6	4723	4728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170745619
81	NC_010502	CGA	2	6	4769	4774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745619
82	NC_010502	GGA	2	6	4897	4902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745619
83	NC_010502	ACT	2	6	4973	4978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010502	TCC	2	6	5072	5077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_010502	TCG	2	6	5080	5085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010502	GCG	2	6	5200	5205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010502	ATC	2	6	5225	5230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010502	GCC	2	6	5447	5452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010502	CGT	2	6	5459	5464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010502	CGG	2	6	5473	5478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010502	GGC	2	6	5489	5494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745620
92	NC_010502	TCG	2	6	5504	5509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745620
93	NC_010502	CAG	2	6	5515	5520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745620
94	NC_010502	CTC	2	6	5548	5553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745620
95	NC_010502	GGC	2	6	5684	5689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745620
96	NC_010502	GCG	2	6	5842	5847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745620
97	NC_010502	TCG	2	6	5924	5929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745620
98	NC_010502	AGC	2	6	5978	5983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745620
99	NC_010502	GGT	2	6	5991	5996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170745620
100	NC_010502	CGG	2	6	6067	6072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010502	ATG	2	6	6074	6079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010502	TCG	2	6	6143	6148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010502	TCC	2	6	6175	6180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_010502	CTG	2	6	6288	6293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745621
105	NC_010502	AGC	2	6	6297	6302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745621
106	NC_010502	CTG	2	6	6403	6408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745621
107	NC_010502	CCA	2	6	6426	6431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745621
108	NC_010502	GCC	2	6	6459	6464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745621
109	NC_010502	GCG	2	6	6479	6484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745621
110	NC_010502	AGC	2	6	6576	6581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745622
111	NC_010502	GAC	2	6	6701	6706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745622
112	NC_010502	GCC	2	6	6722	6727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745622
113	NC_010502	CAC	2	6	6728	6733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745622
114	NC_010502	TCG	2	6	7029	7034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745622
115	NC_010502	TGA	2	6	7083	7088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745622
116	NC_010502	GCC	2	6	7091	7096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745622
117	NC_010502	GCC	2	6	7112	7117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745622
118	NC_010502	AGC	2	6	7173	7178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745622
119	NC_010502	CGC	2	6	7180	7185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745622
120	NC_010502	CTT	2	6	7249	7254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170745622
121	NC_010502	CGA	2	6	7286	7291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745622
122	NC_010502	CTA	2	6	7342	7347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170745622
123	NC_010502	AGC	2	6	7456	7461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745623
124	NC_010502	ACC	2	6	7483	7488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745623
125	NC_010502	GCA	2	6	7493	7498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745623
126	NC_010502	GGC	3	9	7499	7507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745623
127	NC_010502	CCG	2	6	7603	7608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745623
128	NC_010502	CCG	2	6	7653	7658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745623
129	NC_010502	CGC	3	9	7835	7843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745623
130	NC_010502	GCC	2	6	7873	7878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745623
131	NC_010502	GCA	3	9	7927	7935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745623
132	NC_010502	CCG	2	6	7946	7951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745623
133	NC_010502	GGC	2	6	7980	7985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745623
134	NC_010502	GGC	2	6	8001	8006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745623
135	NC_010502	GCC	2	6	8071	8076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745623
136	NC_010502	GGC	2	6	8088	8093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745623
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139	NC_010502	GTC	2	6	8136	8141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745623
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262	NC_010502	GTT	2	6	16518	16523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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390	NC_010502	GGC	2	6	23909	23914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745630
391	NC_010502	TGA	2	6	23963	23968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745630
392	NC_010502	CTG	2	6	24032	24037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745631
393	NC_010502	AGA	2	6	24306	24311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170745631
394	NC_010502	GCG	2	6	24357	24362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745631
395	NC_010502	GGC	2	6	24366	24371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745631
396	NC_010502	GCG	2	6	24519	24524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745631
397	NC_010502	AAG	2	6	24530	24535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170745631
398	NC_010502	ACG	2	6	24616	24621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745631
399	NC_010502	CGA	2	6	24828	24833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745631
400	NC_010502	GGA	2	6	24954	24959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745631
401	NC_010502	CAA	2	6	25150	25155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170745631
402	NC_010502	GTG	2	6	25202	25207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170745631
403	NC_010502	GTC	2	6	25441	25446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
404	NC_010502	CTG	2	6	25552	25557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
405	NC_010502	CGC	2	6	25667	25672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
406	NC_010502	TCG	2	6	25740	25745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
407	NC_010502	CAG	2	6	25761	25766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
408	NC_010502	GTC	2	6	25778	25783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
409	NC_010502	GCA	2	6	25799	25804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
410	NC_010502	TTC	2	6	26104	26109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170745632
411	NC_010502	CAC	3	9	26116	26124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745632
412	NC_010502	GCC	2	6	26156	26161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745632
413	NC_010502	ATT	2	6	26183	26188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170745632
414	NC_010502	GAT	2	6	26237	26242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745632
415	NC_010502	GCC	2	6	26246	26251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745632
416	NC_010502	GCC	2	6	26273	26278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745632
417	NC_010502	CGC	2	6	26299	26304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745632
418	NC_010502	CCT	2	6	26310	26315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745632
419	NC_010502	CTT	2	6	26326	26331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170745632
420	NC_010502	GCC	2	6	26378	26383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745632
421	NC_010502	GCC	2	6	26387	26392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745632
422	NC_010502	ACC	2	6	26396	26401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745632
423	NC_010502	CTC	2	6	26425	26430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745632
424	NC_010502	GTC	2	6	26480	26485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745632
425	NC_010502	AAT	2	6	26501	26506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170745632
426	NC_010502	CAT	2	6	26572	26577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170745632
427	NC_010502	ATC	2	6	26603	26608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170745632
428	NC_010502	TGC	2	6	26717	26722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745632
429	NC_010502	TTG	2	6	26804	26809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170745632
430	NC_010502	GCT	2	6	26859	26864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745632
431	NC_010502	TTC	2	6	26925	26930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170745632
432	NC_010502	TGC	2	6	26963	26968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745632
433	NC_010502	CTC	2	6	27027	27032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
434	NC_010502	TCG	2	6	27257	27262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745633
435	NC_010502	GAG	2	6	27346	27351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745633
436	NC_010502	GGC	2	6	27393	27398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745633
437	NC_010502	GAT	2	6	27471	27476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745633
438	NC_010502	AAG	2	6	27676	27681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170745633
439	NC_010502	AGG	2	6	27686	27691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745633
440	NC_010502	GGC	2	6	27720	27725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745633

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.