MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD06

Total Repeats: 315

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010502	CTT	2	6	26	31	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170745611
2	NC_010502	TGC	2	6	90	95	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745611
3	NC_010502	GGC	2	6	118	123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745611
4	NC_010502	TGG	2	6	150	155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170745611
5	NC_010502	GTC	2	6	249	254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745611
6	NC_010502	CGC	2	6	257	262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745611
7	NC_010502	AAC	2	6	288	293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170745611
8	NC_010502	CGC	2	6	517	522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745612
9	NC_010502	CGT	2	6	696	701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745612
10	NC_010502	GCG	2	6	718	723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745612
11	NC_010502	GTT	2	6	801	806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170745612
12	NC_010502	CGC	2	6	1126	1131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745613
13	NC_010502	CCT	2	6	1192	1197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745613
14	NC_010502	GGC	2	6	1223	1228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745613
15	NC_010502	CGC	2	6	1261	1266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745613
16	NC_010502	CAC	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745613
17	NC_010502	CGA	2	6	1294	1299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745613
18	NC_010502	GAG	2	6	1310	1315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745613
19	NC_010502	CGG	2	6	1330	1335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745613
20	NC_010502	TGC	2	6	1526	1531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745614
21	NC_010502	ACC	2	6	1629	1634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745614
22	NC_010502	ACC	2	6	1642	1647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745614
23	NC_010502	CGG	2	6	1694	1699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745614
24	NC_010502	CGT	2	6	1725	1730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745614
25	NC_010502	GAG	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745614
26	NC_010502	GGC	2	6	1781	1786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745614
27	NC_010502	CTC	2	6	1797	1802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745615
28	NC_010502	CGC	2	6	1910	1915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745615
29	NC_010502	TCG	2	6	1916	1921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745615
30	NC_010502	TCA	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170745615
31	NC_010502	CGT	2	6	1961	1966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745615
32	NC_010502	TCC	2	6	2014	2019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745615
33	NC_010502	TCG	2	6	2104	2109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745615
34	NC_010502	GCT	2	6	2132	2137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745615
35	NC_010502	TCC	2	6	2149	2154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745615
36	NC_010502	CGA	2	6	2168	2173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745615
37	NC_010502	GCC	2	6	2258	2263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745615
38	NC_010502	AAC	2	6	2596	2601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170745616
39	NC_010502	CGC	2	6	2664	2669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745616
40	NC_010502	GGC	2	6	2718	2723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745616
41	NC_010502	TCC	3	9	3024	3032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745617
42	NC_010502	TGA	2	6	3053	3058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745617
43	NC_010502	CAA	2	6	3326	3331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170745617
44	NC_010502	CTG	2	6	3510	3515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745617
45	NC_010502	TCT	2	6	3533	3538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170745617
46	NC_010502	AAC	2	6	4095	4100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170745618
47	NC_010502	TAG	2	6	4184	4189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745618
48	NC_010502	CTT	2	6	4196	4201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170745618
49	NC_010502	ATA	2	6	4379	4384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170745618
50	NC_010502	TCT	2	6	4494	4499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170745618
51	NC_010502	CTT	2	6	4522	4527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170745618
52	NC_010502	TTG	2	6	4566	4571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170745618
53	NC_010502	TCG	2	6	4632	4637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745618
54	NC_010502	TAA	2	6	4638	4643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170745618
55	NC_010502	GTC	2	6	4679	4684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745618
56	NC_010502	GAA	2	6	4716	4721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170745619
57	NC_010502	TTC	2	6	4723	4728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170745619
58	NC_010502	CGA	2	6	4769	4774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745619
59	NC_010502	GGA	2	6	4897	4902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745619
60	NC_010502	GGC	2	6	5489	5494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745620
61	NC_010502	TCG	2	6	5504	5509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745620
62	NC_010502	CAG	2	6	5515	5520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745620
63	NC_010502	CTC	2	6	5548	5553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745620
64	NC_010502	GGC	2	6	5684	5689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745620
65	NC_010502	GCG	2	6	5842	5847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745620
66	NC_010502	TCG	2	6	5924	5929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745620
67	NC_010502	AGC	2	6	5978	5983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745620
68	NC_010502	GGT	2	6	5991	5996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170745620
69	NC_010502	CTG	2	6	6288	6293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745621
70	NC_010502	AGC	2	6	6297	6302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745621
71	NC_010502	CTG	2	6	6403	6408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745621
72	NC_010502	CCA	2	6	6426	6431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745621
73	NC_010502	GCC	2	6	6459	6464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745621
74	NC_010502	GCG	2	6	6479	6484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745621
75	NC_010502	AGC	2	6	6576	6581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745622
76	NC_010502	GAC	2	6	6701	6706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745622
77	NC_010502	GCC	2	6	6722	6727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745622
78	NC_010502	CAC	2	6	6728	6733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745622
79	NC_010502	TCG	2	6	7029	7034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745622
80	NC_010502	TGA	2	6	7083	7088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745622
81	NC_010502	GCC	2	6	7091	7096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745622
82	NC_010502	GCC	2	6	7112	7117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745622
83	NC_010502	AGC	2	6	7173	7178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745622
84	NC_010502	CGC	2	6	7180	7185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745622
85	NC_010502	CTT	2	6	7249	7254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170745622
86	NC_010502	CGA	2	6	7286	7291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745622
87	NC_010502	CTA	2	6	7342	7347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170745622
88	NC_010502	AGC	2	6	7456	7461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745623
89	NC_010502	ACC	2	6	7483	7488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745623
90	NC_010502	GCA	2	6	7493	7498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745623
91	NC_010502	GGC	3	9	7499	7507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745623
92	NC_010502	CCG	2	6	7603	7608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745623
93	NC_010502	CCG	2	6	7653	7658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745623
94	NC_010502	CGC	3	9	7835	7843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745623
95	NC_010502	GCC	2	6	7873	7878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745623
96	NC_010502	GCA	3	9	7927	7935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745623
97	NC_010502	CCG	2	6	7946	7951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745623
98	NC_010502	GGC	2	6	7980	7985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745623
99	NC_010502	GGC	2	6	8001	8006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745623
100	NC_010502	GCC	2	6	8071	8076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745623
101	NC_010502	GGC	2	6	8088	8093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745623
102	NC_010502	CAG	2	6	8100	8105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745623
103	NC_010502	ACC	2	6	8106	8111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745623
104	NC_010502	GTC	2	6	8136	8141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745623
105	NC_010502	CAT	2	6	8160	8165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170745623
106	NC_010502	CCG	2	6	8166	8171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745623
107	NC_010502	GCC	2	6	8215	8220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745623
108	NC_010502	AGC	2	6	8283	8288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745624
109	NC_010502	GCG	2	6	8434	8439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745624
110	NC_010502	CTC	2	6	8465	8470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745624
111	NC_010502	CGG	3	9	8478	8486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745624
112	NC_010502	GCC	2	6	8492	8497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745624
113	NC_010502	GGC	2	6	8636	8641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745624
114	NC_010502	ACC	2	6	8667	8672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745624
115	NC_010502	GTC	2	6	8708	8713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745624
116	NC_010502	GCC	2	6	8759	8764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745624
117	NC_010502	GTC	2	6	8828	8833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745624
118	NC_010502	TGT	2	6	8842	8847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170745624
119	NC_010502	CTC	2	6	8876	8881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745624
120	NC_010502	CGC	2	6	8935	8940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745624
121	NC_010502	GGC	2	6	8954	8959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745624
122	NC_010502	GCC	2	6	8969	8974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745624
123	NC_010502	GAC	2	6	9047	9052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745624
124	NC_010502	CTG	2	6	9086	9091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745624
125	NC_010502	ATG	2	6	9102	9107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745624
126	NC_010502	CAC	2	6	9167	9172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745625
127	NC_010502	CGC	2	6	9232	9237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745625
128	NC_010502	CGC	2	6	9266	9271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745625
129	NC_010502	CTT	2	6	9272	9277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170745625
130	NC_010502	CGT	2	6	9301	9306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745625
131	NC_010502	CCG	2	6	9375	9380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745625
132	NC_010502	CGA	2	6	9385	9390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745625
133	NC_010502	GCC	2	6	9419	9424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745625
134	NC_010502	CAT	2	6	9464	9469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170745625
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136	NC_010502	TCG	2	6	9612	9617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745625
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139	NC_010502	GCG	2	6	10664	10669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745626
140	NC_010502	CAT	2	6	10728	10733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170745626
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154	NC_010502	GCC	2	6	11495	11500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745627
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247	NC_010502	ATT	2	6	22513	22518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170745630
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253	NC_010502	GCG	2	6	22904	22909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745630
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255	NC_010502	TCG	2	6	23052	23057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745630
256	NC_010502	CAG	2	6	23126	23131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745630
257	NC_010502	CTC	2	6	23172	23177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745630
258	NC_010502	GCC	3	9	23209	23217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745630
259	NC_010502	GGT	2	6	23314	23319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170745630
260	NC_010502	ATC	2	6	23332	23337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170745630
261	NC_010502	GCA	2	6	23451	23456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745630
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263	NC_010502	CTG	2	6	23483	23488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745630
264	NC_010502	ACA	2	6	23508	23513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170745630
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270	NC_010502	CGA	2	6	23721	23726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745630
271	NC_010502	ATC	3	9	23798	23806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170745630
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.