MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 chromosome

Total Repeats: 523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010498	GAATT	2	10	15812	15821	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010498	AATGT	2	10	18341	18350	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010498	TTCTT	2	10	18402	18411	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_010498	TCATC	2	10	19811	19820	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_010498	GATGC	2	10	39877	39886	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010498	ACATC	2	10	55787	55796	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_010498	TAGTG	2	10	82460	82469	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010498	ATTTT	2	10	85185	85194	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010498	CGCCA	2	10	85413	85422	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_010498	TATTG	2	10	128135	128144	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010498	AATTG	2	10	132234	132243	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010498	GGCAT	2	10	152049	152058	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010498	GTAAG	2	10	152813	152822	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010498	AAATT	2	10	167460	167469	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010498	TACGT	2	10	192612	192621	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010498	TGGCC	2	10	194302	194311	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_010498	GTCTG	2	10	202015	202024	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010498	TGCGC	2	10	225199	225208	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_010498	CGGTT	2	10	232659	232668	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_010498	CCTTT	2	10	254537	254546	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_010498	AAAAT	2	10	268649	268658	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010498	AAGCG	2	10	270309	270318	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010498	GACAG	2	10	286905	286914	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_010498	CGAAA	2	10	287194	287203	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_010498	CAAAA	2	10	295955	295964	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010498	AATGG	2	10	296983	296992	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010498	TGCTT	2	10	304065	304074	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_010498	TATCT	2	10	306780	306789	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_010498	ACATT	2	10	319187	319196	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010498	TGTGT	2	10	328052	328061	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010498	TGTTA	2	10	329160	329169	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010498	TTGAT	2	10	330050	330059	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010498	GTTAA	2	10	332535	332544	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010498	CAAAA	2	10	345951	345960	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_010498	ATAAA	2	10	350561	350570	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010498	AAAAT	2	10	350623	350632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010498	CGCTT	2	10	370049	370058	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_010498	GGCTG	2	10	381893	381902	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_010498	TTGCG	2	10	390635	390644	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_010498	AACAA	2	10	392765	392774	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_010498	CTTCT	2	10	421743	421752	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_010498	GTTTC	2	10	456536	456545	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_010498	CTTTT	2	10	461759	461768	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_010498	GGAGT	2	10	464331	464340	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010498	TAGTG	2	10	472724	472733	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010498	GAAGA	2	10	489743	489752	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010498	TCAGG	2	10	497166	497175	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_010498	TGAGT	2	10	503515	503524	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010498	CAGGT	2	10	504802	504811	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_010498	TCAGG	2	10	533101	533110	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_010498	TATTT	2	10	560755	560764	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010498	GATGC	2	10	575234	575243	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_010498	GATGC	2	10	575334	575343	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_010498	GTTTC	2	10	581722	581731	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_010498	GTCAG	2	10	610484	610493	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_010498	ATAGC	2	10	638584	638593	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_010498	TGCTA	2	10	655911	655920	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_010498	ATTTG	2	10	658551	658560	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010498	TCAAT	2	10	660859	660868	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010498	GGAAC	2	10	662049	662058	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_010498	CGTAA	2	10	663257	663266	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_010498	GCATA	2	10	675452	675461	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010498	AGCAA	2	10	675559	675568	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_010498	ATATT	2	10	677182	677191	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010498	GATGC	2	10	682303	682312	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_010498	GTGTT	2	10	688491	688500	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010498	CAGGG	2	10	702174	702183	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_010498	TCGCG	2	10	707453	707462	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_010498	ATTTA	2	10	720057	720066	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010498	GTGCT	2	10	750084	750093	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_010498	ATAAC	2	10	763421	763430	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_010498	CTAAT	2	10	763511	763520	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_010498	GTCGT	2	10	773023	773032	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_010498	GATCT	2	10	776027	776036	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010498	ACATA	2	10	828238	828247	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_010498	GATGC	2	10	833415	833424	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_010498	CAAAA	2	10	840014	840023	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_010498	TATAT	2	10	844748	844757	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010498	TGATG	2	10	850830	850839	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010498	CAGGG	2	10	870699	870708	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_010498	AGTAA	2	10	882560	882569	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010498	GCATT	2	10	911369	911378	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_010498	ATTTT	2	10	925949	925958	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010498	TTTAA	2	10	949400	949409	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010498	TGCAA	2	10	949798	949807	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_010498	ACAGG	2	10	967576	967585	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_010498	AGCGA	2	10	967604	967613	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_010498	TCATT	2	10	978833	978842	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_010498	AGAAA	2	10	986153	986162	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010498	CTTGC	2	10	1002531	1002540	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_010498	GAATT	2	10	1003833	1003842	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010498	AAAGC	2	10	1007349	1007358	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_010498	AACCG	2	10	1051791	1051800	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_010498	CGTTG	2	10	1053385	1053394	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_010498	AGTTA	2	10	1053461	1053470	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010498	AGAAA	2	10	1063253	1063262	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010498	TCCAT	2	10	1074301	1074310	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_010498	CGAAT	2	10	1086465	1086474	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010498	GCGTT	2	10	1087109	1087118	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_010498	TCCAG	2	10	1092934	1092943	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_010498	GTGAC	2	10	1101461	1101470	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_010498	CAATG	2	10	1106705	1106714	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_010498	TAAGT	2	10	1108098	1108107	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010498	TAAAA	2	10	1137880	1137889	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010498	TTATC	2	10	1144085	1144094	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_010498	ATTGA	2	10	1144103	1144112	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010498	ATGTC	2	10	1146578	1146587	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_010498	TATAT	2	10	1149517	1149526	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010498	AATAC	2	10	1150553	1150562	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_010498	TGTTC	2	10	1151157	1151166	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_010498	GGAAT	2	10	1155962	1155971	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010498	TGCAT	2	10	1163600	1163609	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_010498	CTTGA	2	10	1179468	1179477	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_010498	TTTTC	2	10	1189368	1189377	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_010498	AGGGG	2	10	1191479	1191488	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010498	GTGGA	2	10	1210134	1210143	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010498	ATTTT	2	10	1225413	1225422	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010498	TAAAG	2	10	1235560	1235569	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010498	TGCGC	2	10	1257458	1257467	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_010498	CGCTA	2	10	1269994	1270003	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_010498	CAAAA	2	10	1280216	1280225	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_010498	ACAAA	2	10	1309410	1309419	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_010498	CTCTT	2	10	1351175	1351184	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_010498	AATCG	2	10	1358111	1358120	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_010498	GTATG	2	10	1368780	1368789	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010498	AAAAC	2	10	1382723	1382732	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_010498	GTCAC	2	10	1383432	1383441	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_010498	GGGGA	2	10	1388369	1388378	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010498	CAAAA	2	10	1398955	1398964	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_010498	TGGTT	2	10	1426965	1426974	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010498	AATAA	2	10	1453851	1453860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010498	CGAAT	2	10	1456093	1456102	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_010498	GAGAA	2	10	1459683	1459692	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010498	ATTTT	2	10	1471398	1471407	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010498	TTCAC	2	10	1505189	1505198	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_010498	GATTT	2	10	1505662	1505671	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010498	AAGCG	2	10	1526843	1526852	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_010498	AAACA	2	10	1543116	1543125	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_010498	CGCCA	2	10	1558043	1558052	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_010498	AACCA	2	10	1574083	1574092	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_010498	TTAAT	2	10	1584274	1584283	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010498	ACTTT	2	10	1588926	1588935	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_010498	GACGG	2	10	1590587	1590596	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
144	NC_010498	TTAAG	2	10	1591117	1591126	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010498	TTTTC	2	10	1601898	1601907	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_010498	ATGTC	2	10	1603302	1603311	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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150	NC_010498	AAAAT	2	10	1620188	1620197	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010498	TGGTG	2	10	1620256	1620265	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_010498	CGTTT	2	10	1684959	1684968	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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163	NC_010498	CCATT	2	10	1705666	1705675	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
164	NC_010498	CGTTT	2	10	1728098	1728107	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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166	NC_010498	TACGT	2	10	1760110	1760119	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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194	NC_010498	GATGC	2	10	1979561	1979570	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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199	NC_010498	ACCAG	2	10	1998194	1998203	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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