MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 chromosome

Total Repeats: 2742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010498	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	170684018
2	NC_010498	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	170681884
3	NC_010498	CGCAG	2	10	8246	8255	20 %	0 %	40 %	40 %	170681632
4	NC_010498	CGTAC	2	10	9674	9683	20 %	20 %	20 %	40 %	170683195
5	NC_010498	CGCGC	2	10	10661	10670	0 %	0 %	40 %	60 %	170683397
6	NC_010498	GTTTC	2	10	11556	11565	0 %	60 %	20 %	20 %	170680475
7	NC_010498	CTGGA	2	10	17929	17938	20 %	20 %	40 %	20 %	170683329
8	NC_010498	CGGAC	2	10	17978	17987	20 %	0 %	40 %	40 %	170683329
9	NC_010498	AAATG	2	10	19545	19554	60 %	20 %	20 %	0 %	170682715
10	NC_010498	CCGAT	2	10	20302	20311	20 %	20 %	20 %	40 %	170684120
11	NC_010498	GCCTT	2	10	20989	20998	0 %	40 %	20 %	40 %	170684120
12	NC_010498	CCAGA	2	10	24140	24149	40 %	0 %	20 %	40 %	170681287
13	NC_010498	GCGAA	2	10	37615	37624	40 %	0 %	40 %	20 %	170680299
14	NC_010498	CCGTT	2	10	38509	38518	0 %	40 %	20 %	40 %	170680299
15	NC_010498	CACGG	2	10	38886	38895	20 %	0 %	40 %	40 %	170680299
16	NC_010498	CCATG	2	10	43166	43175	20 %	20 %	20 %	40 %	170681966
17	NC_010498	CCGTA	2	10	44812	44821	20 %	20 %	20 %	40 %	170680462
18	NC_010498	TTAAA	2	10	45550	45559	60 %	40 %	0 %	0 %	170680462
19	NC_010498	ACCCA	2	10	46293	46302	40 %	0 %	0 %	60 %	170680951
20	NC_010498	TTTGA	2	10	47919	47928	20 %	60 %	20 %	0 %	170684267
21	NC_010498	CGGCG	2	10	48170	48179	0 %	0 %	60 %	40 %	170684267
22	NC_010498	AATCA	2	10	48452	48461	60 %	20 %	0 %	20 %	170682403
23	NC_010498	CGGTT	2	10	49407	49416	0 %	40 %	40 %	20 %	170682933
24	NC_010498	TGGCG	2	10	51099	51108	0 %	20 %	60 %	20 %	170681587
25	NC_010498	TGCAC	2	10	52861	52870	20 %	20 %	20 %	40 %	170679681
26	NC_010498	GGCGC	2	10	53980	53989	0 %	0 %	60 %	40 %	170680033
27	NC_010498	GAAAC	2	10	54793	54802	60 %	0 %	20 %	20 %	170680033
28	NC_010498	ACAGA	2	10	56084	56093	60 %	0 %	20 %	20 %	170683412
29	NC_010498	AACGT	2	10	58059	58068	40 %	20 %	20 %	20 %	170681872
30	NC_010498	GCGTC	2	10	61043	61052	0 %	20 %	40 %	40 %	170682162
31	NC_010498	ATGTT	2	10	61857	61866	20 %	60 %	20 %	0 %	170681284
32	NC_010498	CTTCG	2	10	62293	62302	0 %	40 %	20 %	40 %	170681284
33	NC_010498	GGTCG	2	10	62635	62644	0 %	20 %	60 %	20 %	170681284
34	NC_010498	GGGCG	2	10	64430	64439	0 %	0 %	80 %	20 %	170681787
35	NC_010498	GTTCA	2	10	67301	67310	20 %	40 %	20 %	20 %	170680507
36	NC_010498	AAAGT	2	10	68314	68323	60 %	20 %	20 %	0 %	170680507
37	NC_010498	GTGCT	2	10	69577	69586	0 %	40 %	40 %	20 %	170683863
38	NC_010498	GGTGA	2	10	70561	70570	20 %	20 %	60 %	0 %	170683863
39	NC_010498	CAGCG	2	10	71929	71938	20 %	0 %	40 %	40 %	170682791
40	NC_010498	TCGCG	2	10	73199	73208	0 %	20 %	40 %	40 %	170682791
41	NC_010498	CTGTC	2	10	74609	74618	0 %	40 %	20 %	40 %	170683895
42	NC_010498	TTTTC	2	10	77618	77627	0 %	80 %	0 %	20 %	170679653
43	NC_010498	AAAGC	2	10	77922	77931	60 %	0 %	20 %	20 %	170681643
44	NC_010498	GAAAC	2	10	82137	82146	60 %	0 %	20 %	20 %	170682457
45	NC_010498	GGCAA	2	10	82885	82894	40 %	0 %	40 %	20 %	170681784
46	NC_010498	TTGCT	2	10	83621	83630	0 %	60 %	20 %	20 %	170681588
47	NC_010498	GATGG	2	10	84357	84366	20 %	20 %	60 %	0 %	170681588
48	NC_010498	GGGAG	2	10	85349	85358	20 %	0 %	80 %	0 %	170680796
49	NC_010498	CCTGG	2	10	86610	86619	0 %	20 %	40 %	40 %	170682290
50	NC_010498	ATGCG	2	10	88055	88064	20 %	20 %	40 %	20 %	170684236
51	NC_010498	GACCG	2	10	88877	88886	20 %	0 %	40 %	40 %	170683572
52	NC_010498	ATGTT	2	10	91425	91434	20 %	60 %	20 %	0 %	170679841
53	NC_010498	AAAAC	2	10	91840	91849	80 %	0 %	0 %	20 %	170679841
54	NC_010498	TGCAT	2	10	92367	92376	20 %	40 %	20 %	20 %	170683042
55	NC_010498	ATTCC	2	10	92537	92546	20 %	40 %	0 %	40 %	170683042
56	NC_010498	GTTTG	2	10	93534	93543	0 %	60 %	40 %	0 %	170683042
57	NC_010498	AGTTC	2	10	97630	97639	20 %	40 %	20 %	20 %	170679711
58	NC_010498	TATCG	2	10	99510	99519	20 %	40 %	20 %	20 %	170681597
59	NC_010498	GGGCT	2	10	103382	103391	0 %	20 %	60 %	20 %	170684044
60	NC_010498	GCCTG	2	10	103842	103851	0 %	20 %	40 %	40 %	170681706
61	NC_010498	TCTGG	2	10	105089	105098	0 %	40 %	40 %	20 %	170682663
62	NC_010498	ACCGT	2	10	105755	105764	20 %	20 %	20 %	40 %	170682663
63	NC_010498	ATCAG	2	10	107528	107537	40 %	20 %	20 %	20 %	170683694
64	NC_010498	AGCCG	2	10	109296	109305	20 %	0 %	40 %	40 %	170683837
65	NC_010498	GCGCA	2	10	111624	111633	20 %	0 %	40 %	40 %	170680487
66	NC_010498	TGGCG	2	10	112619	112628	0 %	20 %	60 %	20 %	170681165
67	NC_010498	CCGGC	2	10	115589	115598	0 %	0 %	40 %	60 %	170680792
68	NC_010498	CGCGG	2	10	118796	118805	0 %	0 %	60 %	40 %	170683836
69	NC_010498	CATCG	2	10	121053	121062	20 %	20 %	20 %	40 %	170681709
70	NC_010498	TAACG	2	10	121747	121756	40 %	20 %	20 %	20 %	170681709
71	NC_010498	ATGCC	2	10	122206	122215	20 %	20 %	20 %	40 %	170681709
72	NC_010498	AATGC	2	10	123489	123498	40 %	20 %	20 %	20 %	170681105
73	NC_010498	TCTGT	2	10	124435	124444	0 %	60 %	20 %	20 %	170681997
74	NC_010498	AGCAG	2	10	126866	126875	40 %	0 %	40 %	20 %	170680377
75	NC_010498	TCATT	2	10	131908	131917	20 %	60 %	0 %	20 %	170683102
76	NC_010498	CGAAG	2	10	132687	132696	40 %	0 %	40 %	20 %	170679674
77	NC_010498	ACACG	2	10	132820	132829	40 %	0 %	20 %	40 %	170679674
78	NC_010498	TCGCG	2	10	133081	133090	0 %	20 %	40 %	40 %	170679674
79	NC_010498	GCATC	2	10	133171	133180	20 %	20 %	20 %	40 %	170679674
80	NC_010498	GACTG	2	10	134489	134498	20 %	20 %	40 %	20 %	170680617
81	NC_010498	AGAGC	2	10	134899	134908	40 %	0 %	40 %	20 %	170680617
82	NC_010498	TCTGG	2	10	143357	143366	0 %	40 %	40 %	20 %	170683451
83	NC_010498	GGGCA	2	10	144768	144777	20 %	0 %	60 %	20 %	170683045
84	NC_010498	CAGCG	2	10	145047	145056	20 %	0 %	40 %	40 %	170682621
85	NC_010498	TTCAG	2	10	150515	150524	20 %	40 %	20 %	20 %	170683523
86	NC_010498	GCGCG	2	10	151086	151095	0 %	0 %	60 %	40 %	170683523
87	NC_010498	CCGTC	2	10	151877	151886	0 %	20 %	20 %	60 %	170680010
88	NC_010498	GTGAA	2	10	151887	151896	40 %	20 %	40 %	0 %	170680010
89	NC_010498	GTTCA	2	10	152274	152283	20 %	40 %	20 %	20 %	170680677
90	NC_010498	ATCCA	2	10	152600	152609	40 %	20 %	0 %	40 %	170680677
91	NC_010498	CTTTA	2	10	153863	153872	20 %	60 %	0 %	20 %	170679696
92	NC_010498	ATTTG	2	10	154476	154485	20 %	60 %	20 %	0 %	170679696
93	NC_010498	CGGGC	2	10	155278	155287	0 %	0 %	60 %	40 %	170680801
94	NC_010498	GGGAG	2	10	157728	157737	20 %	0 %	80 %	0 %	170682409
95	NC_010498	TTAAT	2	10	160570	160579	40 %	60 %	0 %	0 %	170682836
96	NC_010498	TTTTG	2	10	162405	162414	0 %	80 %	20 %	0 %	170681181
97	NC_010498	CATAA	2	10	162605	162614	60 %	20 %	0 %	20 %	170681181
98	NC_010498	GCAAG	2	10	163309	163318	40 %	0 %	40 %	20 %	170679612
99	NC_010498	TTCAA	2	10	163570	163579	40 %	40 %	0 %	20 %	170679612
100	NC_010498	AACTG	2	10	163842	163851	40 %	20 %	20 %	20 %	170679612
101	NC_010498	TCGGC	2	10	168841	168850	0 %	20 %	40 %	40 %	170680324
102	NC_010498	TGGCG	2	10	169265	169274	0 %	20 %	60 %	20 %	170680324
103	NC_010498	ACCAC	2	10	172169	172178	40 %	0 %	0 %	60 %	170684250
104	NC_010498	GGCGT	2	10	173872	173881	0 %	20 %	60 %	20 %	170681199
105	NC_010498	CTGCG	2	10	176945	176954	0 %	20 %	40 %	40 %	170683049
106	NC_010498	TTATC	2	10	177721	177730	20 %	60 %	0 %	20 %	170679586
107	NC_010498	CTTTC	2	10	178574	178583	0 %	60 %	0 %	40 %	170681393
108	NC_010498	AACCT	2	10	181149	181158	40 %	20 %	0 %	40 %	170684223
109	NC_010498	TGGTC	2	10	181191	181200	0 %	40 %	40 %	20 %	170684223
110	NC_010498	CGGCG	2	10	183066	183075	0 %	0 %	60 %	40 %	170683245
111	NC_010498	TGGTG	2	10	183078	183087	0 %	40 %	60 %	0 %	170683245
112	NC_010498	TTCCA	2	10	183677	183686	20 %	40 %	0 %	40 %	170683245
113	NC_010498	GGTCC	2	10	188000	188009	0 %	20 %	40 %	40 %	170681038
114	NC_010498	ACGGG	2	10	189917	189926	20 %	0 %	60 %	20 %	170681908
115	NC_010498	GTGAT	2	10	192076	192085	20 %	40 %	40 %	0 %	170680398
116	NC_010498	GTGAT	2	10	192367	192376	20 %	40 %	40 %	0 %	170680398
117	NC_010498	GCCAG	2	10	196051	196060	20 %	0 %	40 %	40 %	170683624
118	NC_010498	GGCGT	2	10	196889	196898	0 %	20 %	60 %	20 %	170683624
119	NC_010498	CCGCT	2	10	197321	197330	0 %	20 %	20 %	60 %	170683624
120	NC_010498	GTTCT	2	10	197492	197501	0 %	60 %	20 %	20 %	170683624
121	NC_010498	CTGAA	2	10	199484	199493	40 %	20 %	20 %	20 %	170679652
122	NC_010498	AAGCG	2	10	199548	199557	40 %	0 %	40 %	20 %	170679652
123	NC_010498	TGGTG	2	10	201331	201340	0 %	40 %	60 %	0 %	170681680
124	NC_010498	TGCAC	2	10	201457	201466	20 %	20 %	20 %	40 %	170681680
125	NC_010498	TGCGC	2	10	201850	201859	0 %	20 %	40 %	40 %	170681680
126	NC_010498	CATGG	2	10	203551	203560	20 %	20 %	40 %	20 %	170683853
127	NC_010498	CAGAT	2	10	204590	204599	40 %	20 %	20 %	20 %	170681254
128	NC_010498	ACTTT	2	10	204723	204732	20 %	60 %	0 %	20 %	170681254
129	NC_010498	GACGT	2	10	208643	208652	20 %	20 %	40 %	20 %	170683955
130	NC_010498	CAGTG	2	10	210458	210467	20 %	20 %	40 %	20 %	170683962
131	NC_010498	ATGCC	2	10	213038	213047	20 %	20 %	20 %	40 %	170681777
132	NC_010498	TGGCC	2	10	214364	214373	0 %	20 %	40 %	40 %	170682325
133	NC_010498	ACCGC	2	10	214377	214386	20 %	0 %	20 %	60 %	170682325
134	NC_010498	GTAAC	2	10	215107	215116	40 %	20 %	20 %	20 %	170682325
135	NC_010498	AGCCG	2	10	215735	215744	20 %	0 %	40 %	40 %	170682325
136	NC_010498	GGTGG	2	10	215844	215853	0 %	20 %	80 %	0 %	170682325
137	NC_010498	ACGGT	2	10	226855	226864	20 %	20 %	40 %	20 %	170680577
138	NC_010498	AGCTC	2	10	227543	227552	20 %	20 %	20 %	40 %	170680577
139	NC_010498	TGATT	2	10	229696	229705	20 %	60 %	20 %	0 %	170680927
140	NC_010498	GTGAA	2	10	241513	241522	40 %	20 %	40 %	0 %	170680535
141	NC_010498	TAATT	2	10	241697	241706	40 %	60 %	0 %	0 %	170680535
142	NC_010498	ACTGG	2	10	244636	244645	20 %	20 %	40 %	20 %	170680838
143	NC_010498	CGCGG	2	10	245681	245690	0 %	0 %	60 %	40 %	170683943
144	NC_010498	TGAAC	2	10	250597	250606	40 %	20 %	20 %	20 %	170681190
145	NC_010498	AAACG	2	10	252693	252702	60 %	0 %	20 %	20 %	170680694
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147	NC_010498	AGGGC	2	10	255959	255968	20 %	0 %	60 %	20 %	170681922
148	NC_010498	TTACC	2	10	256964	256973	20 %	40 %	0 %	40 %	170681922
149	NC_010498	CGGCG	2	10	257548	257557	0 %	0 %	60 %	40 %	170683079
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151	NC_010498	AAAAT	2	10	260871	260880	80 %	20 %	0 %	0 %	170680472
152	NC_010498	GCAAA	2	10	267893	267902	60 %	0 %	20 %	20 %	170679816
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154	NC_010498	CATCC	2	10	269319	269328	20 %	20 %	0 %	60 %	170680626
155	NC_010498	TTTGA	2	10	269764	269773	20 %	60 %	20 %	0 %	170680626
156	NC_010498	GCACC	2	10	270439	270448	20 %	0 %	20 %	60 %	170680272
157	NC_010498	CGGCG	2	10	273243	273252	0 %	0 %	60 %	40 %	170683346
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159	NC_010498	CGACA	2	10	276479	276488	40 %	0 %	20 %	40 %	170679856
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161	NC_010498	TACCG	2	10	277638	277647	20 %	20 %	20 %	40 %	170681389
162	NC_010498	TGCAA	2	10	280703	280712	40 %	20 %	20 %	20 %	170683997
163	NC_010498	TGGCG	2	10	280757	280766	0 %	20 %	60 %	20 %	170683997
164	NC_010498	GGGCG	2	10	285589	285598	0 %	0 %	80 %	20 %	170681968
165	NC_010498	AAAAT	2	10	286639	286648	80 %	20 %	0 %	0 %	170682839
166	NC_010498	GCTCA	2	10	288465	288474	20 %	20 %	20 %	40 %	170680645
167	NC_010498	GCCGC	2	10	290633	290642	0 %	0 %	40 %	60 %	170682509
168	NC_010498	AGATC	2	10	291103	291112	40 %	20 %	20 %	20 %	170682509
169	NC_010498	GAAAT	2	10	291786	291795	60 %	20 %	20 %	0 %	170682924
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171	NC_010498	GATGC	2	10	301680	301689	20 %	20 %	40 %	20 %	170681335
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173	NC_010498	TTTAT	2	10	302889	302898	20 %	80 %	0 %	0 %	170681243
174	NC_010498	GTGAT	2	10	304883	304892	20 %	40 %	40 %	0 %	170681970
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179	NC_010498	GTTCT	2	10	311403	311412	0 %	60 %	20 %	20 %	170682597
180	NC_010498	GGCTT	2	10	311541	311550	0 %	40 %	40 %	20 %	170682597
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198	NC_010498	AATGC	2	10	349894	349903	40 %	20 %	20 %	20 %	170679990
199	NC_010498	AGCAG	2	10	349946	349955	40 %	0 %	40 %	20 %	170679990
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201	NC_010498	GCAGG	2	10	351539	351548	20 %	0 %	60 %	20 %	170681227
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203	NC_010498	ACCGC	2	10	356248	356257	20 %	0 %	20 %	60 %	170680230
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241	NC_010498	GCAAC	2	10	425916	425925	40 %	0 %	20 %	40 %	170680000
242	NC_010498	CAAAG	2	10	427159	427168	60 %	0 %	20 %	20 %	170683904
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244	NC_010498	CTTTC	2	10	434196	434205	0 %	60 %	0 %	40 %	170683106
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246	NC_010498	GCGCT	2	10	436001	436010	0 %	20 %	40 %	40 %	170682477
247	NC_010498	TCTTT	2	10	436609	436618	0 %	80 %	0 %	20 %	170682477
248	NC_010498	TCGCG	2	10	444236	444245	0 %	20 %	40 %	40 %	170680647
249	NC_010498	TCGCT	2	10	444339	444348	0 %	40 %	20 %	40 %	170680647
250	NC_010498	CAAAG	2	10	444835	444844	60 %	0 %	20 %	20 %	170681194
251	NC_010498	CCTGG	2	10	446207	446216	0 %	20 %	40 %	40 %	170681194
252	NC_010498	CCGCT	2	10	448208	448217	0 %	20 %	20 %	60 %	170681654
253	NC_010498	TGGCG	2	10	452291	452300	0 %	20 %	60 %	20 %	170680742
254	NC_010498	CTTGC	2	10	452935	452944	0 %	40 %	20 %	40 %	170680742
255	NC_010498	TGACC	2	10	454011	454020	20 %	20 %	20 %	40 %	170684249
256	NC_010498	AGTTC	2	10	455609	455618	20 %	40 %	20 %	20 %	170680575
257	NC_010498	TCGTT	2	10	457709	457718	0 %	60 %	20 %	20 %	170682659
258	NC_010498	TGGCG	2	10	458574	458583	0 %	20 %	60 %	20 %	170682659
259	NC_010498	CTCGT	2	10	459204	459213	0 %	40 %	20 %	40 %	170680845
260	NC_010498	GGCGC	2	10	460135	460144	0 %	0 %	60 %	40 %	170680144
261	NC_010498	AGCGT	2	10	464623	464632	20 %	20 %	40 %	20 %	170680644
262	NC_010498	AAGGC	2	10	466477	466486	40 %	0 %	40 %	20 %	170683582
263	NC_010498	TGCCG	2	10	470116	470125	0 %	20 %	40 %	40 %	170681172
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293	NC_010498	AGGTG	2	10	534751	534760	20 %	20 %	60 %	0 %	170682853
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373	NC_010498	TTAAT	2	10	663378	663387	40 %	60 %	0 %	0 %	170683720
374	NC_010498	ACCAA	2	10	663631	663640	60 %	0 %	0 %	40 %	170683720
375	NC_010498	TACCA	2	10	665943	665952	40 %	20 %	0 %	40 %	170680649
376	NC_010498	CGCAC	2	10	672636	672645	20 %	0 %	20 %	60 %	170680305
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379	NC_010498	AATCA	2	10	684841	684850	60 %	20 %	0 %	20 %	170684012
380	NC_010498	ACCGC	2	10	684866	684875	20 %	0 %	20 %	60 %	170684012
381	NC_010498	ACCAT	2	10	685876	685885	40 %	20 %	0 %	40 %	170680355
382	NC_010498	CGTTG	2	10	689580	689589	0 %	40 %	40 %	20 %	170681081
383	NC_010498	GGAAC	2	10	697485	697494	40 %	0 %	40 %	20 %	170683596
384	NC_010498	AGTGA	2	10	697795	697804	40 %	20 %	40 %	0 %	170683596
385	NC_010498	CGCGA	2	10	702485	702494	20 %	0 %	40 %	40 %	170682186
386	NC_010498	ACGAT	2	10	704603	704612	40 %	20 %	20 %	20 %	170681159
387	NC_010498	GCGAT	2	10	704699	704708	20 %	20 %	40 %	20 %	170681159
388	NC_010498	CTGGT	2	10	705748	705757	0 %	40 %	40 %	20 %	170681669
389	NC_010498	CGTGA	2	10	708941	708950	20 %	20 %	40 %	20 %	170680096
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