MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 plasmid pSMS35_130

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010488	CTTCCT	2	12	4556	4567	0 %	50 %	0 %	50 %	170650904
2	NC_010488	GCCCCA	2	12	8052	8063	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	170650784
3	NC_010488	CCACAT	2	12	8358	8369	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	170650784
4	NC_010488	ACGGTT	2	12	12042	12053	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	170650889
5	NC_010488	CTTACA	2	12	14501	14512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650886
6	NC_010488	GTAACT	2	12	16872	16883	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	170650902
7	NC_010488	ACCTGC	2	12	17766	17777	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	170650800
8	NC_010488	CCTGCC	2	12	18868	18879	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	170650800
9	NC_010488	AACAGA	2	12	19162	19173	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	170650880
10	NC_010488	GTTGAC	2	12	19421	19432	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	170650781
11	NC_010488	CAACCA	2	12	24724	24735	50 %	0 %	0 %	50 %	170650772
12	NC_010488	ATCACT	2	12	24929	24940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650772
13	NC_010488	TTTCCA	2	12	29159	29170	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	170650779
14	NC_010488	TTCATT	2	12	36487	36498	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	170650851
15	NC_010488	CTGCCA	2	12	40810	40821	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	170650870
16	NC_010488	GGGAAG	2	12	41119	41130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170650870
17	NC_010488	TCCGGC	2	12	42880	42891	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	170650892
18	NC_010488	CCAGCG	2	12	43250	43261	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	170650892
19	NC_010488	CTCATC	2	12	44144	44155	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	170650898
20	NC_010488	GGCTGA	2	12	44331	44342	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	170650901
21	NC_010488	CTGAGT	2	12	44369	44380	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	170650901
22	NC_010488	GCAGTA	7	42	45397	45438	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170650786
23	NC_010488	TGCTGA	2	12	46739	46750	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	170650805
24	NC_010488	CCATCA	2	12	49178	49189	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	170650882
25	NC_010488	ATTACT	2	12	54878	54889	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	170650895
26	NC_010488	CAATGA	2	12	55081	55092	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	170650895
27	NC_010488	AACAGA	2	12	55427	55438	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	170650895
28	NC_010488	CATATC	2	12	57317	57328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650830
29	NC_010488	TCAATT	2	12	57559	57570	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	170650830
30	NC_010488	TGACAC	2	12	69103	69114	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	170650788
31	NC_010488	TGGATA	2	12	69301	69312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650788
32	NC_010488	AATATT	2	12	71547	71558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010488	ACATTC	2	12	73512	73523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650913
34	NC_010488	GCAGAA	2	12	78001	78012	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	170650767
35	NC_010488	CAGATT	2	12	78133	78144	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_010488	TATATC	2	12	80236	80247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	170650762
37	NC_010488	CACCAT	2	12	82887	82898	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	170650908
38	NC_010488	CAGCGC	2	12	84804	84815	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	170650847
39	NC_010488	GCGAAA	2	12	91419	91430	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	170650842
40	NC_010488	ATACTC	2	12	101352	101363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650838
41	NC_010488	TGCAGA	2	12	103585	103596	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170650888
42	NC_010488	GCGAGA	2	12	105032	105043	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	170650900
43	NC_010488	TCCAGT	2	12	109727	109738	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	170650811
44	NC_010488	AGCCCG	2	12	109908	109919	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	170650811
45	NC_010488	TTCGGG	2	12	120979	120990	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	170650807
46	NC_010488	TGGACG	2	12	123743	123754	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.