MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 plasmid pSMS35_130

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010488	CGGGG	2	10	396	405	0 %	0 %	80 %	20 %	170650844
2	NC_010488	AAAGT	2	10	2042	2051	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010488	CTTTA	2	10	2052	2061	20 %	60 %	0 %	20 %	170650796
4	NC_010488	TGTTT	2	10	3357	3366	0 %	80 %	20 %	0 %	170650792
5	NC_010488	GACCA	2	10	5749	5758	40 %	0 %	20 %	40 %	170650820
6	NC_010488	CGTGT	2	10	5806	5815	0 %	40 %	40 %	20 %	170650820
7	NC_010488	CAGGT	2	10	6088	6097	20 %	20 %	40 %	20 %	170650784
8	NC_010488	CCGGT	2	10	6697	6706	0 %	20 %	40 %	40 %	170650784
9	NC_010488	CGCTG	2	10	7956	7965	0 %	20 %	40 %	40 %	170650784
10	NC_010488	AGGTC	2	10	10875	10884	20 %	20 %	40 %	20 %	170650784
11	NC_010488	CAGCA	2	10	12264	12273	40 %	0 %	20 %	40 %	170650889
12	NC_010488	CCGTG	2	10	12716	12725	0 %	20 %	40 %	40 %	170650889
13	NC_010488	CTGCG	2	10	15872	15881	0 %	20 %	40 %	40 %	170650902
14	NC_010488	CCCAG	2	10	17471	17480	20 %	0 %	20 %	60 %	170650902
15	NC_010488	GAACA	2	10	19968	19977	60 %	0 %	20 %	20 %	170650897
16	NC_010488	AGAAA	2	10	20518	20527	80 %	0 %	20 %	0 %	170650822
17	NC_010488	AAATC	2	10	20596	20605	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010488	CAGAC	2	10	22554	22563	40 %	0 %	20 %	40 %	170650771
19	NC_010488	TTCAC	2	10	22874	22883	20 %	40 %	0 %	40 %	170650771
20	NC_010488	GCACT	2	10	23039	23048	20 %	20 %	20 %	40 %	170650771
21	NC_010488	TTTTC	2	10	24790	24799	0 %	80 %	0 %	20 %	170650772
22	NC_010488	GGACT	2	10	25360	25369	20 %	20 %	40 %	20 %	170650911
23	NC_010488	CAGAA	2	10	25423	25432	60 %	0 %	20 %	20 %	170650911
24	NC_010488	GCTTC	2	10	26052	26061	0 %	40 %	20 %	40 %	170650911
25	NC_010488	CGGTA	2	10	27542	27551	20 %	20 %	40 %	20 %	170650779
26	NC_010488	TCAGA	2	10	29000	29009	40 %	20 %	20 %	20 %	170650779
27	NC_010488	AACTG	2	10	30371	30380	40 %	20 %	20 %	20 %	170650794
28	NC_010488	CATTT	2	10	31422	31431	20 %	60 %	0 %	20 %	170650891
29	NC_010488	GCTCT	2	10	32008	32017	0 %	40 %	20 %	40 %	170650812
30	NC_010488	CCGGG	2	10	32843	32852	0 %	0 %	60 %	40 %	170650812
31	NC_010488	TGTCC	2	10	32942	32951	0 %	40 %	20 %	40 %	170650812
32	NC_010488	CACGG	2	10	33359	33368	20 %	0 %	40 %	40 %	170650906
33	NC_010488	CGCTT	2	10	34207	34216	0 %	40 %	20 %	40 %	170650797
34	NC_010488	GTGAT	2	10	40012	40021	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010488	GAATG	2	10	40940	40949	40 %	20 %	40 %	0 %	170650870
36	NC_010488	TCTGC	2	10	40998	41007	0 %	40 %	20 %	40 %	170650870
37	NC_010488	TCAGT	2	10	41828	41837	20 %	40 %	20 %	20 %	170650814
38	NC_010488	CACTT	2	10	43140	43149	20 %	40 %	0 %	40 %	170650892
39	NC_010488	CGGCG	2	10	46123	46132	0 %	0 %	60 %	40 %	170650791
40	NC_010488	CCCGG	2	10	47382	47391	0 %	0 %	40 %	60 %	170650805
41	NC_010488	CTTCC	2	10	48783	48792	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
42	NC_010488	TCGTA	2	10	50316	50325	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_010488	CGTCG	2	10	50961	50970	0 %	20 %	40 %	40 %	170650843
44	NC_010488	GGCAC	2	10	52700	52709	20 %	0 %	40 %	40 %	170650858
45	NC_010488	GAAGG	2	10	55289	55298	40 %	0 %	60 %	0 %	170650895
46	NC_010488	ATATT	2	10	57162	57171	40 %	60 %	0 %	0 %	170650830
47	NC_010488	ATAAA	2	10	57410	57419	80 %	20 %	0 %	0 %	170650830
48	NC_010488	ACAAT	2	10	58679	58688	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_010488	CTATC	2	10	59511	59520	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_010488	TAAGG	2	10	60280	60289	40 %	20 %	40 %	0 %	170650883
51	NC_010488	GAGAA	2	10	61632	61641	60 %	0 %	40 %	0 %	170650804
52	NC_010488	ATCAC	2	10	63431	63440	40 %	20 %	0 %	40 %	170650876
53	NC_010488	GCAAA	2	10	65046	65055	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_010488	CAGAG	2	10	65990	65999	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_010488	AGACC	2	10	66021	66030	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_010488	GTTCA	2	10	66197	66206	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_010488	AGCTG	2	10	70171	70180	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_010488	TTATG	2	10	70286	70295	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010488	ATTTC	2	10	72226	72235	20 %	60 %	0 %	20 %	170650860
60	NC_010488	GGCAG	2	10	74106	74115	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_010488	TAATA	2	10	74446	74455	60 %	40 %	0 %	0 %	170650768
62	NC_010488	TCCAG	2	10	75037	75046	20 %	20 %	20 %	40 %	170650768
63	NC_010488	TGTTT	2	10	75309	75318	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010488	TTATT	2	10	76063	76072	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010488	CTTTA	2	10	76366	76375	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_010488	TTATC	2	10	79454	79463	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_010488	AGGGG	2	10	79737	79746	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010488	AGTAA	2	10	80830	80839	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010488	TAAAA	2	10	80851	80860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010488	GCACT	2	10	81755	81764	20 %	20 %	20 %	40 %	170650857
71	NC_010488	TAAAA	2	10	84048	84057	80 %	20 %	0 %	0 %	170650761
72	NC_010488	TGCTC	2	10	85813	85822	0 %	40 %	20 %	40 %	170650765
73	NC_010488	AGGCC	2	10	86002	86011	20 %	0 %	40 %	40 %	170650765
74	NC_010488	TGCTC	2	10	87298	87307	0 %	40 %	20 %	40 %	170650874
75	NC_010488	AGGCC	2	10	87487	87496	20 %	0 %	40 %	40 %	170650874
76	NC_010488	TGCTC	2	10	89517	89526	0 %	40 %	20 %	40 %	170650853
77	NC_010488	AGGCC	2	10	89706	89715	20 %	0 %	40 %	40 %	170650853
78	NC_010488	GTTCG	2	10	91140	91149	0 %	40 %	40 %	20 %	170650836
79	NC_010488	TGCTC	2	10	92381	92390	0 %	40 %	20 %	40 %	170650833
80	NC_010488	AGGCC	2	10	92570	92579	20 %	0 %	40 %	40 %	170650833
81	NC_010488	CGGCC	2	10	93144	93153	0 %	0 %	40 %	60 %	170650766
82	NC_010488	TGGCT	2	10	94928	94937	0 %	40 %	40 %	20 %	170650766
83	NC_010488	CGCGC	2	10	95331	95340	0 %	0 %	40 %	60 %	170650766
84	NC_010488	GCCTT	2	10	99389	99398	0 %	40 %	20 %	40 %	170650773
85	NC_010488	GGGAG	2	10	99621	99630	20 %	0 %	80 %	0 %	170650808
86	NC_010488	TTAAA	2	10	100437	100446	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010488	TGCTC	2	10	102326	102335	0 %	40 %	20 %	40 %	170650795
88	NC_010488	AGGCC	2	10	102515	102524	20 %	0 %	40 %	40 %	170650795
89	NC_010488	GTTCG	2	10	102927	102936	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_010488	CACGG	2	10	103880	103889	20 %	0 %	40 %	40 %	170650888
91	NC_010488	TTCGC	2	10	104312	104321	0 %	40 %	20 %	40 %	170650782
92	NC_010488	CGCGG	2	10	104768	104777	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
93	NC_010488	GGCCT	2	10	105799	105808	0 %	20 %	40 %	40 %	170650879
94	NC_010488	GAGCA	2	10	105988	105997	40 %	0 %	40 %	20 %	170650879
95	NC_010488	CGTTC	2	10	110403	110412	0 %	40 %	20 %	40 %	170650811
96	NC_010488	TGTGC	2	10	110559	110568	0 %	40 %	40 %	20 %	170650811
97	NC_010488	TATTT	2	10	111163	111172	20 %	80 %	0 %	0 %	170650811
98	NC_010488	ATGAT	2	10	111880	111889	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010488	GAAAA	2	10	114288	114297	80 %	0 %	20 %	0 %	170650802
100	NC_010488	ATGCG	2	10	115405	115414	20 %	20 %	40 %	20 %	170650894
101	NC_010488	ACCCG	2	10	117033	117042	20 %	0 %	20 %	60 %	170650909
102	NC_010488	TGGTG	2	10	117703	117712	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010488	GGCCT	2	10	117913	117922	0 %	20 %	40 %	40 %	170650878
104	NC_010488	GAGCA	2	10	118102	118111	40 %	0 %	40 %	20 %	170650878
105	NC_010488	CGCGC	2	10	118823	118832	0 %	0 %	40 %	60 %	170650893
106	NC_010488	AGGGC	2	10	119681	119690	20 %	0 %	60 %	20 %	170650865
107	NC_010488	GAAGC	2	10	120100	120109	40 %	0 %	40 %	20 %	170650887
108	NC_010488	CCTTT	2	10	120841	120850	0 %	60 %	0 %	40 %	170650807
109	NC_010488	CGCGC	2	10	124311	124320	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
110	NC_010488	GGCCT	2	10	124908	124917	0 %	20 %	40 %	40 %	170650852
111	NC_010488	GAGCA	2	10	125097	125106	40 %	0 %	40 %	20 %	170650852
112	NC_010488	TGCTC	2	10	125632	125641	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_010488	AGGCC	2	10	125821	125830	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_010488	CCGTC	2	10	126027	126036	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_010488	CATCT	2	10	126695	126704	20 %	40 %	0 %	40 %	170650875
116	NC_010488	TGCTC	2	10	127492	127501	0 %	40 %	20 %	40 %	170650763
117	NC_010488	AGGCC	2	10	127681	127690	20 %	0 %	40 %	40 %	170650763

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.