MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 plasmid pSMS35_130

Total Repeats: 369

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010488	TGAT	2	8	141	148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010488	GAGG	2	8	421	428	25 %	0 %	75 %	0 %	170650844
3	NC_010488	TCTG	2	8	542	549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_010488	AATG	2	8	585	592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010488	CTGT	2	8	1225	1232	0 %	50 %	25 %	25 %	170650780
6	NC_010488	TCGG	2	8	1322	1329	0 %	25 %	50 %	25 %	170650780
7	NC_010488	GGTA	2	8	1365	1372	25 %	25 %	50 %	0 %	170650780
8	NC_010488	AGAA	2	8	1800	1807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010488	GCCA	2	8	1992	1999	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010488	AGTC	2	8	2236	2243	25 %	25 %	25 %	25 %	170650796
11	NC_010488	TCTG	2	8	2301	2308	0 %	50 %	25 %	25 %	170650796
12	NC_010488	GCCT	2	8	2662	2669	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010488	TGGC	2	8	2719	2726	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010488	GAAC	2	8	2757	2764	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010488	TAAT	2	8	3144	3151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010488	ATGA	2	8	3395	3402	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010488	TTTA	2	8	3418	3425	25 %	75 %	0 %	0 %	170650855
18	NC_010488	ATTC	2	8	3581	3588	25 %	50 %	0 %	25 %	170650855
19	NC_010488	ATAA	2	8	3849	3856	75 %	25 %	0 %	0 %	170650855
20	NC_010488	AAAT	2	8	3896	3903	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010488	TCCA	2	8	4235	4242	25 %	25 %	0 %	50 %	170650817
22	NC_010488	CATT	2	8	4329	4336	25 %	50 %	0 %	25 %	170650817
23	NC_010488	CCCT	2	8	4344	4351	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_010488	GGCA	2	8	4607	4614	25 %	0 %	50 %	25 %	170650904
25	NC_010488	GGCC	2	8	5219	5226	0 %	0 %	50 %	50 %	170650820
26	NC_010488	CAGC	2	8	5339	5346	25 %	0 %	25 %	50 %	170650820
27	NC_010488	CCAC	2	8	5427	5434	25 %	0 %	0 %	75 %	170650820
28	NC_010488	ACGG	2	8	6285	6292	25 %	0 %	50 %	25 %	170650784
29	NC_010488	CAGC	2	8	6369	6376	25 %	0 %	25 %	50 %	170650784
30	NC_010488	CAGG	2	8	8847	8854	25 %	0 %	50 %	25 %	170650784
31	NC_010488	GCCC	2	8	8867	8874	0 %	0 %	25 %	75 %	170650784
32	NC_010488	CCGG	2	8	9003	9010	0 %	0 %	50 %	50 %	170650784
33	NC_010488	CCAG	2	8	9207	9214	25 %	0 %	25 %	50 %	170650784
34	NC_010488	GCGA	2	8	9708	9715	25 %	0 %	50 %	25 %	170650784
35	NC_010488	GACG	2	8	9830	9837	25 %	0 %	50 %	25 %	170650784
36	NC_010488	CGGA	2	8	9947	9954	25 %	0 %	50 %	25 %	170650784
37	NC_010488	TGCG	2	8	10214	10221	0 %	25 %	50 %	25 %	170650784
38	NC_010488	GTCC	2	8	10737	10744	0 %	25 %	25 %	50 %	170650784
39	NC_010488	ATCA	2	8	10813	10820	50 %	25 %	0 %	25 %	170650784
40	NC_010488	TCCG	2	8	10936	10943	0 %	25 %	25 %	50 %	170650784
41	NC_010488	CAGC	2	8	12150	12157	25 %	0 %	25 %	50 %	170650889
42	NC_010488	CAGA	2	8	12726	12733	50 %	0 %	25 %	25 %	170650889
43	NC_010488	TGTC	2	8	12833	12840	0 %	50 %	25 %	25 %	170650889
44	NC_010488	AGTC	2	8	13317	13324	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_010488	ATTT	2	8	13431	13438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010488	ATTT	2	8	13462	13469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010488	TTTC	2	8	13472	13479	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010488	GTCA	2	8	13508	13515	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010488	GATT	2	8	13563	13570	25 %	50 %	25 %	0 %	170650825
50	NC_010488	TATT	2	8	14929	14936	25 %	75 %	0 %	0 %	170650902
51	NC_010488	ACTG	2	8	15971	15978	25 %	25 %	25 %	25 %	170650902
52	NC_010488	ACCG	2	8	16098	16105	25 %	0 %	25 %	50 %	170650902
53	NC_010488	CATC	2	8	16130	16137	25 %	25 %	0 %	50 %	170650902
54	NC_010488	GGAC	2	8	16583	16590	25 %	0 %	50 %	25 %	170650902
55	NC_010488	GGCT	2	8	16760	16767	0 %	25 %	50 %	25 %	170650902
56	NC_010488	CTGG	2	8	16842	16849	0 %	25 %	50 %	25 %	170650902
57	NC_010488	TTCA	2	8	17643	17650	25 %	50 %	0 %	25 %	170650902
58	NC_010488	CTCC	2	8	17658	17665	0 %	25 %	0 %	75 %	170650800
59	NC_010488	GCGG	2	8	17699	17706	0 %	0 %	75 %	25 %	170650800
60	NC_010488	CCCT	2	8	19030	19037	0 %	25 %	0 %	75 %	170650880
61	NC_010488	ATCC	2	8	19130	19137	25 %	25 %	0 %	50 %	170650880
62	NC_010488	ATCC	2	8	19355	19362	25 %	25 %	0 %	50 %	170650880
63	NC_010488	CCTG	2	8	19663	19670	0 %	25 %	25 %	50 %	170650781
64	NC_010488	ATTT	2	8	21259	21266	25 %	75 %	0 %	0 %	170650828
65	NC_010488	GTCA	2	8	21398	21405	25 %	25 %	25 %	25 %	170650840
66	NC_010488	CCTG	2	8	21638	21645	0 %	25 %	25 %	50 %	170650771
67	NC_010488	GTTT	2	8	21963	21970	0 %	75 %	25 %	0 %	170650771
68	NC_010488	CAGG	2	8	22361	22368	25 %	0 %	50 %	25 %	170650771
69	NC_010488	TGAC	2	8	22459	22466	25 %	25 %	25 %	25 %	170650771
70	NC_010488	CAGT	2	8	22686	22693	25 %	25 %	25 %	25 %	170650771
71	NC_010488	ATGA	2	8	23150	23157	50 %	25 %	25 %	0 %	170650771
72	NC_010488	TTAA	2	8	24762	24769	50 %	50 %	0 %	0 %	170650772
73	NC_010488	TCAG	2	8	24951	24958	25 %	25 %	25 %	25 %	170650772
74	NC_010488	GTCC	2	8	25545	25552	0 %	25 %	25 %	50 %	170650911
75	NC_010488	CGTC	2	8	25781	25788	0 %	25 %	25 %	50 %	170650911
76	NC_010488	CTGA	2	8	25902	25909	25 %	25 %	25 %	25 %	170650911
77	NC_010488	GACG	2	8	26420	26427	25 %	0 %	50 %	25 %	170650832
78	NC_010488	GGCT	2	8	26814	26821	0 %	25 %	50 %	25 %	170650810
79	NC_010488	GGAA	2	8	27302	27309	50 %	0 %	50 %	0 %	170650779
80	NC_010488	GGAC	2	8	27705	27712	25 %	0 %	50 %	25 %	170650779
81	NC_010488	AGCC	2	8	27942	27949	25 %	0 %	25 %	50 %	170650779
82	NC_010488	GGTG	2	8	28320	28327	0 %	25 %	75 %	0 %	170650779
83	NC_010488	ACGG	2	8	28678	28685	25 %	0 %	50 %	25 %	170650779
84	NC_010488	ATTC	2	8	29250	29257	25 %	50 %	0 %	25 %	170650779
85	NC_010488	GATG	2	8	29402	29409	25 %	25 %	50 %	0 %	170650779
86	NC_010488	TCAT	2	8	29524	29531	25 %	50 %	0 %	25 %	170650779
87	NC_010488	GACT	2	8	29852	29859	25 %	25 %	25 %	25 %	170650873
88	NC_010488	ATTT	2	8	29997	30004	25 %	75 %	0 %	0 %	170650873
89	NC_010488	TTAA	2	8	30215	30222	50 %	50 %	0 %	0 %	170650794
90	NC_010488	CGGA	2	8	30478	30485	25 %	0 %	50 %	25 %	170650794
91	NC_010488	AATA	2	8	30707	30714	75 %	25 %	0 %	0 %	170650794
92	NC_010488	ATTT	2	8	30937	30944	25 %	75 %	0 %	0 %	170650806
93	NC_010488	AGGA	2	8	31179	31186	50 %	0 %	50 %	0 %	170650884
94	NC_010488	GCAT	2	8	31216	31223	25 %	25 %	25 %	25 %	170650884
95	NC_010488	CTTC	2	8	31384	31391	0 %	50 %	0 %	50 %	170650891
96	NC_010488	TGCC	2	8	31459	31466	0 %	25 %	25 %	50 %	170650891
97	NC_010488	AAAC	2	8	31720	31727	75 %	0 %	0 %	25 %	170650891
98	NC_010488	CCCT	2	8	31869	31876	0 %	25 %	0 %	75 %	170650812
99	NC_010488	GCGT	2	8	32018	32025	0 %	25 %	50 %	25 %	170650812
100	NC_010488	AGGC	2	8	32858	32865	25 %	0 %	50 %	25 %	170650812
101	NC_010488	TGTT	2	8	32986	32993	0 %	75 %	25 %	0 %	170650812
102	NC_010488	CAGA	2	8	33176	33183	50 %	0 %	25 %	25 %	170650812
103	NC_010488	CTGG	2	8	33335	33342	0 %	25 %	50 %	25 %	170650906
104	NC_010488	GGCT	2	8	33345	33352	0 %	25 %	50 %	25 %	170650906
105	NC_010488	ACGG	2	8	33560	33567	25 %	0 %	50 %	25 %	170650906
106	NC_010488	CCAG	2	8	34028	34035	25 %	0 %	25 %	50 %	170650797
107	NC_010488	TGGT	2	8	34834	34841	0 %	50 %	50 %	0 %	170650856
108	NC_010488	AATA	2	8	34937	34944	75 %	25 %	0 %	0 %	170650824
109	NC_010488	GATA	2	8	35288	35295	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010488	CTGT	2	8	35766	35773	0 %	50 %	25 %	25 %	170650783
111	NC_010488	TATT	2	8	36252	36259	25 %	75 %	0 %	0 %	170650783
112	NC_010488	TAAT	2	8	36410	36417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010488	CTCC	2	8	36800	36807	0 %	25 %	0 %	75 %	170650851
114	NC_010488	AAAT	2	8	37122	37129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010488	ACTG	2	8	37888	37895	25 %	25 %	25 %	25 %	170650793
116	NC_010488	AAAT	2	8	38378	38385	75 %	25 %	0 %	0 %	170650799
117	NC_010488	TTTC	2	8	38410	38417	0 %	75 %	0 %	25 %	170650799
118	NC_010488	ATTG	2	8	38771	38778	25 %	50 %	25 %	0 %	170650799
119	NC_010488	CTGA	2	8	39154	39161	25 %	25 %	25 %	25 %	170650769
120	NC_010488	TCAG	2	8	39221	39228	25 %	25 %	25 %	25 %	170650769
121	NC_010488	CACT	2	8	40623	40630	25 %	25 %	0 %	50 %	170650801
122	NC_010488	CAGC	2	8	41304	41311	25 %	0 %	25 %	50 %	170650870
123	NC_010488	CCGC	2	8	41349	41356	0 %	0 %	25 %	75 %	170650870
124	NC_010488	ATGA	2	8	41439	41446	50 %	25 %	25 %	0 %	170650814
125	NC_010488	GTGA	2	8	41742	41749	25 %	25 %	50 %	0 %	170650814
126	NC_010488	TCTG	2	8	41938	41945	0 %	50 %	25 %	25 %	170650892
127	NC_010488	CCTT	2	8	42373	42380	0 %	50 %	0 %	50 %	170650892
128	NC_010488	GTTC	2	8	42839	42846	0 %	50 %	25 %	25 %	170650892
129	NC_010488	GCTT	2	8	43812	43819	0 %	50 %	25 %	25 %	170650892
130	NC_010488	TCTG	2	8	44571	44578	0 %	50 %	25 %	25 %	170650901
131	NC_010488	CAGT	2	8	44973	44980	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_010488	ACTG	2	8	46173	46180	25 %	25 %	25 %	25 %	170650791
133	NC_010488	CTGG	2	8	46453	46460	0 %	25 %	50 %	25 %	170650805
134	NC_010488	CGGG	2	8	47214	47221	0 %	0 %	75 %	25 %	170650805
135	NC_010488	AGCG	2	8	47326	47333	25 %	0 %	50 %	25 %	170650805
136	NC_010488	TACT	2	8	47862	47869	25 %	50 %	0 %	25 %	170650777
137	NC_010488	TGAC	2	8	48043	48050	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_010488	AAAT	2	8	48056	48063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010488	AAAT	2	8	48082	48089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010488	CAGT	2	8	48314	48321	25 %	25 %	25 %	25 %	170650821
141	NC_010488	GGCA	2	8	48383	48390	25 %	0 %	50 %	25 %	170650821
142	NC_010488	GCCC	2	8	48601	48608	0 %	0 %	25 %	75 %	170650850
143	NC_010488	AACA	2	8	48687	48694	75 %	0 %	0 %	25 %	170650850
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.