MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 plasmid pSMS35_130

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010488	TGAT	2	8	141	148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010488	TCTG	2	8	542	549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010488	AATG	2	8	585	592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010488	AGAA	2	8	1800	1807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010488	GCCA	2	8	1992	1999	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010488	GCCT	2	8	2662	2669	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010488	TGGC	2	8	2719	2726	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_010488	GAAC	2	8	2757	2764	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010488	TAAT	2	8	3144	3151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010488	ATGA	2	8	3395	3402	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010488	AAAT	2	8	3896	3903	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010488	CCCT	2	8	4344	4351	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_010488	AGTC	2	8	13317	13324	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010488	ATTT	2	8	13431	13438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010488	ATTT	2	8	13462	13469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010488	TTTC	2	8	13472	13479	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010488	GTCA	2	8	13508	13515	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010488	GATA	2	8	35288	35295	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010488	TAAT	2	8	36410	36417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010488	AAAT	2	8	37122	37129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010488	CAGT	2	8	44973	44980	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010488	TGAC	2	8	48043	48050	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010488	AAAT	2	8	48056	48063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010488	AAAT	2	8	48082	48089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010488	CCGT	2	8	49500	49507	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010488	TTGA	2	8	50300	50307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010488	AGAA	2	8	51334	51341	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010488	AAGG	2	8	52323	52330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010488	AAAT	2	8	52397	52404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010488	AGTT	2	8	53589	53596	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010488	TAAA	2	8	58903	58910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010488	GTCT	2	8	59533	59540	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010488	CAGC	2	8	60428	60435	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010488	CCAA	2	8	60827	60834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010488	TCCA	2	8	60870	60877	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010488	ACAA	2	8	61141	61148	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010488	TTAA	2	8	61149	61156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010488	ATTG	2	8	65925	65932	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010488	CAGC	2	8	66295	66302	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010488	GACG	2	8	66758	66765	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010488	CTGG	2	8	66935	66942	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010488	CCGT	2	8	66972	66979	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010488	AGAC	2	8	68545	68552	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010488	AAGT	2	8	68893	68900	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010488	AGTG	2	8	70117	70124	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010488	CTGT	2	8	70163	70170	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010488	TTTG	2	8	71182	71189	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010488	AACA	2	8	71437	71444	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010488	AAAG	2	8	71579	71586	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010488	TTAC	2	8	71742	71749	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010488	AAAT	2	8	73879	73886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010488	GTTT	2	8	75254	75261	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010488	GTTT	2	8	75322	75329	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010488	TGAT	2	8	75851	75858	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010488	ATTT	2	8	75859	75866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010488	CTTC	2	8	75969	75976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010488	TTTA	2	8	76088	76095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010488	TGTA	2	8	76163	76170	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010488	GCCC	2	8	80042	80049	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_010488	GAAA	2	8	80087	80094	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010488	GTTT	2	8	80589	80596	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010488	AAGG	2	8	80745	80752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010488	GTTC	2	8	82795	82802	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010488	AGCC	2	8	82818	82825	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010488	CTGG	2	8	86532	86539	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010488	CGGC	2	8	86768	86775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010488	TTTA	2	8	95988	95995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010488	CTCC	2	8	96008	96015	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_010488	TCAT	2	8	97092	97099	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010488	CAAG	2	8	97265	97272	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010488	AATC	2	8	100459	100466	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_010488	GCCA	2	8	102824	102831	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010488	GACT	2	8	106510	106517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010488	GAAA	2	8	108583	108590	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010488	ATCA	2	8	115685	115692	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010488	CACC	2	8	117495	117502	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_010488	GCCG	2	8	123282	123289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010488	CCAG	2	8	123701	123708	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010488	CGGC	2	8	124256	124263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010488	CGTG	2	8	124419	124426	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010488	GCCC	2	8	125607	125614	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_010488	GACT	2	8	127922	127929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010488	GCAG	2	8	128178	128185	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_010488	CAGC	2	8	128448	128455	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010488	GCGG	2	8	128606	128613	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.