MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 plasmid pSMS35_130

Total Repeats: 1766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010488	GGC	2	6	76	81	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010488	TGT	2	6	86	91	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010488	CCG	2	6	114	119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_010488	CGA	2	6	235	240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650844
5	NC_010488	ACA	2	6	352	357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650844
6	NC_010488	GTT	2	6	474	479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650844
7	NC_010488	CGC	2	6	517	522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650844
8	NC_010488	AGT	2	6	599	604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010488	GGC	2	6	657	662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010488	AGG	2	6	769	774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010488	GAT	2	6	796	801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010488	GTT	2	6	805	810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010488	ATT	2	6	883	888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010488	AGG	2	6	892	897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010488	ACG	2	6	970	975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650780
16	NC_010488	ACG	2	6	1090	1095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650780
17	NC_010488	GCG	2	6	1252	1257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650780
18	NC_010488	GCA	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650780
19	NC_010488	GGC	2	6	1291	1296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650780
20	NC_010488	GCA	2	6	1436	1441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650780
21	NC_010488	GCA	2	6	1533	1538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650780
22	NC_010488	TTG	2	6	1744	1749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650780
23	NC_010488	TTG	2	6	1855	1860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010488	TCT	2	6	1889	1894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010488	CCT	2	6	2319	2324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_010488	TAC	2	6	2357	2362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010488	TAG	2	6	2463	2468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010488	CTG	2	6	2574	2579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010488	TGT	2	6	2589	2594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010488	GCA	2	6	2618	2623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010488	AGA	2	6	2683	2688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010488	ATC	2	6	2727	2732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010488	CTG	2	6	2741	2746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010488	CAA	2	6	2747	2752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010488	CCA	2	6	2820	2825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010488	ACC	2	6	2897	2902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_010488	TCT	2	6	2966	2971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010488	AAT	2	6	3088	3093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010488	AAT	2	6	3112	3117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010488	ATT	2	6	3160	3165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650792
41	NC_010488	GGT	2	6	3235	3240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170650792
42	NC_010488	CTG	3	9	3241	3249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650792
43	NC_010488	AAT	2	6	3299	3304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170650792
44	NC_010488	TGA	2	6	3323	3328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650792
45	NC_010488	TGT	2	6	3483	3488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650855
46	NC_010488	GCA	2	6	3511	3516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650855
47	NC_010488	TGT	2	6	3526	3531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650855
48	NC_010488	TCA	2	6	3679	3684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650855
49	NC_010488	ACC	2	6	3694	3699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650855
50	NC_010488	AAC	2	6	3803	3808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650855
51	NC_010488	GCA	2	6	3934	3939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010488	ATT	2	6	4076	4081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010488	GCT	2	6	4110	4115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010488	CTG	2	6	4177	4182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650817
55	NC_010488	TAT	2	6	4364	4369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010488	AAT	2	6	4377	4382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010488	CCT	2	6	4444	4449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_010488	TTC	2	6	4454	4459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010488	AAT	2	6	4771	4776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170650904
60	NC_010488	CCA	2	6	4782	4787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650904
61	NC_010488	GCC	2	6	4870	4875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650904
62	NC_010488	GCT	2	6	4891	4896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650904
63	NC_010488	TGG	2	6	4932	4937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170650904
64	NC_010488	GTG	2	6	4939	4944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170650904
65	NC_010488	TGA	2	6	4949	4954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650904
66	NC_010488	ATC	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650904
67	NC_010488	TCA	2	6	5210	5215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650820
68	NC_010488	CCG	2	6	5228	5233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650820
69	NC_010488	TGG	2	6	5243	5248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170650820
70	NC_010488	CAG	2	6	5274	5279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650820
71	NC_010488	CAG	2	6	5349	5354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650820
72	NC_010488	CAT	2	6	5400	5405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650820
73	NC_010488	GCC	2	6	5464	5469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650820
74	NC_010488	TGA	2	6	5726	5731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650820
75	NC_010488	TCA	2	6	5831	5836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650820
76	NC_010488	CTG	2	6	5911	5916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
77	NC_010488	GCA	2	6	5928	5933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
78	NC_010488	GCA	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
79	NC_010488	CGG	2	6	6149	6154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650784
80	NC_010488	TGT	2	6	6231	6236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650784
81	NC_010488	ACC	2	6	6311	6316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650784
82	NC_010488	CCT	2	6	6354	6359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650784
83	NC_010488	CAC	2	6	6447	6452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650784
84	NC_010488	CGG	2	6	6507	6512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650784
85	NC_010488	GCC	2	6	6638	6643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650784
86	NC_010488	TGC	2	6	6800	6805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
87	NC_010488	CTG	2	6	6988	6993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
88	NC_010488	TCC	2	6	7193	7198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650784
89	NC_010488	CCA	2	6	7254	7259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650784
90	NC_010488	CAT	2	6	7386	7391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650784
91	NC_010488	CTG	2	6	7549	7554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
92	NC_010488	ATG	2	6	7748	7753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650784
93	NC_010488	GCA	2	6	7763	7768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
94	NC_010488	CTG	2	6	7777	7782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
95	NC_010488	CCA	2	6	7899	7904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650784
96	NC_010488	GCA	2	6	8088	8093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
97	NC_010488	CAC	2	6	8155	8160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650784
98	NC_010488	GCG	2	6	8256	8261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650784
99	NC_010488	CCT	2	6	8268	8273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650784
100	NC_010488	GAA	2	6	8292	8297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170650784
101	NC_010488	ACG	2	6	8316	8321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
102	NC_010488	CAG	2	6	8332	8337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
103	NC_010488	GCA	2	6	8438	8443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
104	NC_010488	CAG	2	6	8461	8466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
105	NC_010488	CCA	2	6	8469	8474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650784
106	NC_010488	CTG	2	6	8527	8532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
107	NC_010488	ACC	2	6	8618	8623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650784
108	NC_010488	AGG	2	6	8628	8633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170650784
109	NC_010488	CGG	2	6	8751	8756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650784
110	NC_010488	CAA	2	6	8880	8885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650784
111	NC_010488	CCG	2	6	8930	8935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650784
112	NC_010488	GCT	2	6	9022	9027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
113	NC_010488	AGA	2	6	9034	9039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170650784
114	NC_010488	CAC	2	6	9046	9051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650784
115	NC_010488	CCT	2	6	9240	9245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650784
116	NC_010488	TGA	2	6	9411	9416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650784
117	NC_010488	TGG	2	6	9417	9422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170650784
118	NC_010488	CAG	2	6	9559	9564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
119	NC_010488	GAC	2	6	9651	9656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
120	NC_010488	CAG	2	6	9720	9725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
121	NC_010488	CAT	2	6	9760	9765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650784
122	NC_010488	ATG	2	6	9926	9931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650784
123	NC_010488	GCT	2	6	10017	10022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
124	NC_010488	CGG	2	6	10078	10083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650784
125	NC_010488	CTG	2	6	10171	10176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
126	NC_010488	GTT	2	6	10233	10238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650784
127	NC_010488	GCC	2	6	10352	10357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650784
128	NC_010488	TCC	2	6	10382	10387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650784
129	NC_010488	CAC	2	6	10471	10476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650784
130	NC_010488	TGC	2	6	10622	10627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
131	NC_010488	ACC	2	6	10640	10645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650784
132	NC_010488	TCA	2	6	10746	10751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650784
133	NC_010488	CAT	2	6	10846	10851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650784
134	NC_010488	TTA	2	6	10901	10906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650784
135	NC_010488	AGA	2	6	10958	10963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170650784
136	NC_010488	TGC	2	6	11040	11045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
137	NC_010488	TCA	3	9	11118	11126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650784
138	NC_010488	ATC	2	6	11130	11135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650889
139	NC_010488	TCC	2	6	11149	11154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650889
140	NC_010488	ACG	2	6	11190	11195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650889
141	NC_010488	CTG	3	9	11202	11210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650889
142	NC_010488	GAT	2	6	11219	11224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650889
143	NC_010488	CCA	2	6	11258	11263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650889
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145	NC_010488	CTT	2	6	11376	11381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650889
146	NC_010488	TCT	2	6	11452	11457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650889
147	NC_010488	AAC	2	6	11463	11468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650889
148	NC_010488	GAC	2	6	11504	11509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650889
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150	NC_010488	CAG	2	6	12066	12071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650889
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153	NC_010488	CCA	2	6	12380	12385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650889
154	NC_010488	CGC	2	6	12426	12431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650889
155	NC_010488	TAT	2	6	12509	12514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650889
156	NC_010488	GGC	2	6	12555	12560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650889
157	NC_010488	CAC	2	6	12645	12650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650889
158	NC_010488	GAC	2	6	12683	12688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650889
159	NC_010488	GAC	2	6	12845	12850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650889
160	NC_010488	TGT	2	6	12874	12879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650889
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162	NC_010488	AAG	2	6	12913	12918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170650889
163	NC_010488	GCT	2	6	12974	12979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650889
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165	NC_010488	ACC	2	6	13109	13114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650889
166	NC_010488	ATG	2	6	13294	13299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650889
167	NC_010488	GAA	2	6	13307	13312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_010488	ATT	2	6	13331	13336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_010488	ATG	2	6	13338	13343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_010488	TAA	2	6	13351	13356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_010488	GGC	2	6	13719	13724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650825
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182	NC_010488	TTA	2	6	14290	14295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_010488	TCA	2	6	14321	14326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650886
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189	NC_010488	ATC	2	6	14810	14815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
190	NC_010488	ATT	2	6	14828	14833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650902
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199	NC_010488	GCG	2	6	15338	15343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650902
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201	NC_010488	TCG	2	6	15455	15460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650902
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253	NC_010488	ATG	2	6	18360	18365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650800
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257	NC_010488	GCC	2	6	18561	18566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650800
258	NC_010488	GCA	2	6	18681	18686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650800
259	NC_010488	GCT	2	6	18718	18723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650800
260	NC_010488	TAA	2	6	18730	18735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170650800
261	NC_010488	GCC	2	6	18764	18769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650800
262	NC_010488	CGG	2	6	18862	18867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650800
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265	NC_010488	CAT	2	6	19019	19024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650800
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276	NC_010488	CTG	2	6	19869	19874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650897
277	NC_010488	CAT	2	6	19881	19886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650897
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279	NC_010488	TTA	2	6	20142	20147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_010488	ATT	2	6	20211	20216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_010488	TTA	2	6	20228	20233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_010488	TGA	2	6	20299	20304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650822
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288	NC_010488	TAA	2	6	20463	20468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170650822
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291	NC_010488	AAT	2	6	20580	20585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170650822
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491	NC_010488	CGA	2	6	35577	35582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
492	NC_010488	TTG	2	6	35794	35799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650783
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500	NC_010488	TTA	2	6	36679	36684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650851

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