MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 plasmid pSMS35_130

Total Repeats: 1407

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010488	CGA	2	6	235	240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650844
2	NC_010488	ACA	2	6	352	357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650844
3	NC_010488	GTT	2	6	474	479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650844
4	NC_010488	CGC	2	6	517	522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650844
5	NC_010488	ACG	2	6	970	975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650780
6	NC_010488	ACG	2	6	1090	1095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650780
7	NC_010488	GCG	2	6	1252	1257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650780
8	NC_010488	GCA	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650780
9	NC_010488	GGC	2	6	1291	1296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650780
10	NC_010488	GCA	2	6	1436	1441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650780
11	NC_010488	GCA	2	6	1533	1538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650780
12	NC_010488	TTG	2	6	1744	1749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650780
13	NC_010488	ATT	2	6	3160	3165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650792
14	NC_010488	GGT	2	6	3235	3240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170650792
15	NC_010488	CTG	3	9	3241	3249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650792
16	NC_010488	AAT	2	6	3299	3304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170650792
17	NC_010488	TGA	2	6	3323	3328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650792
18	NC_010488	TGT	2	6	3483	3488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650855
19	NC_010488	GCA	2	6	3511	3516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650855
20	NC_010488	TGT	2	6	3526	3531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650855
21	NC_010488	TCA	2	6	3679	3684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650855
22	NC_010488	ACC	2	6	3694	3699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650855
23	NC_010488	AAC	2	6	3803	3808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650855
24	NC_010488	CTG	2	6	4177	4182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650817
25	NC_010488	AAT	2	6	4771	4776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170650904
26	NC_010488	CCA	2	6	4782	4787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650904
27	NC_010488	GCC	2	6	4870	4875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650904
28	NC_010488	GCT	2	6	4891	4896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650904
29	NC_010488	TGG	2	6	4932	4937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170650904
30	NC_010488	GTG	2	6	4939	4944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170650904
31	NC_010488	TGA	2	6	4949	4954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650904
32	NC_010488	ATC	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650904
33	NC_010488	TCA	2	6	5210	5215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650820
34	NC_010488	CCG	2	6	5228	5233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650820
35	NC_010488	TGG	2	6	5243	5248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170650820
36	NC_010488	CAG	2	6	5274	5279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650820
37	NC_010488	CAG	2	6	5349	5354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650820
38	NC_010488	CAT	2	6	5400	5405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650820
39	NC_010488	GCC	2	6	5464	5469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650820
40	NC_010488	TGA	2	6	5726	5731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650820
41	NC_010488	TCA	2	6	5831	5836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650820
42	NC_010488	CTG	2	6	5911	5916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
43	NC_010488	GCA	2	6	5928	5933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
44	NC_010488	GCA	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
45	NC_010488	CGG	2	6	6149	6154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650784
46	NC_010488	TGT	2	6	6231	6236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650784
47	NC_010488	ACC	2	6	6311	6316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650784
48	NC_010488	CCT	2	6	6354	6359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650784
49	NC_010488	CAC	2	6	6447	6452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650784
50	NC_010488	CGG	2	6	6507	6512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650784
51	NC_010488	GCC	2	6	6638	6643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650784
52	NC_010488	TGC	2	6	6800	6805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
53	NC_010488	CTG	2	6	6988	6993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
54	NC_010488	TCC	2	6	7193	7198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650784
55	NC_010488	CCA	2	6	7254	7259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650784
56	NC_010488	CAT	2	6	7386	7391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650784
57	NC_010488	CTG	2	6	7549	7554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
58	NC_010488	ATG	2	6	7748	7753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650784
59	NC_010488	GCA	2	6	7763	7768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
60	NC_010488	CTG	2	6	7777	7782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
61	NC_010488	CCA	2	6	7899	7904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650784
62	NC_010488	GCA	2	6	8088	8093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
63	NC_010488	CAC	2	6	8155	8160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650784
64	NC_010488	GCG	2	6	8256	8261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650784
65	NC_010488	CCT	2	6	8268	8273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650784
66	NC_010488	GAA	2	6	8292	8297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170650784
67	NC_010488	ACG	2	6	8316	8321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
68	NC_010488	CAG	2	6	8332	8337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
69	NC_010488	GCA	2	6	8438	8443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
70	NC_010488	CAG	2	6	8461	8466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
71	NC_010488	CCA	2	6	8469	8474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650784
72	NC_010488	CTG	2	6	8527	8532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
73	NC_010488	ACC	2	6	8618	8623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650784
74	NC_010488	AGG	2	6	8628	8633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170650784
75	NC_010488	CGG	2	6	8751	8756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650784
76	NC_010488	CAA	2	6	8880	8885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650784
77	NC_010488	CCG	2	6	8930	8935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650784
78	NC_010488	GCT	2	6	9022	9027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
79	NC_010488	AGA	2	6	9034	9039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170650784
80	NC_010488	CAC	2	6	9046	9051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650784
81	NC_010488	CCT	2	6	9240	9245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650784
82	NC_010488	TGA	2	6	9411	9416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650784
83	NC_010488	TGG	2	6	9417	9422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170650784
84	NC_010488	CAG	2	6	9559	9564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
85	NC_010488	GAC	2	6	9651	9656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
86	NC_010488	CAG	2	6	9720	9725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650784
87	NC_010488	CAT	2	6	9760	9765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650784
88	NC_010488	ATG	2	6	9926	9931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650784
89	NC_010488	GCT	2	6	10017	10022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
90	NC_010488	CGG	2	6	10078	10083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650784
91	NC_010488	CTG	2	6	10171	10176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
92	NC_010488	GTT	2	6	10233	10238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650784
93	NC_010488	GCC	2	6	10352	10357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650784
94	NC_010488	TCC	2	6	10382	10387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650784
95	NC_010488	CAC	2	6	10471	10476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650784
96	NC_010488	TGC	2	6	10622	10627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
97	NC_010488	ACC	2	6	10640	10645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650784
98	NC_010488	TCA	2	6	10746	10751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650784
99	NC_010488	CAT	2	6	10846	10851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650784
100	NC_010488	TTA	2	6	10901	10906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650784
101	NC_010488	AGA	2	6	10958	10963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170650784
102	NC_010488	TGC	2	6	11040	11045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650784
103	NC_010488	TCA	3	9	11118	11126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650784
104	NC_010488	ATC	2	6	11130	11135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650889
105	NC_010488	TCC	2	6	11149	11154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650889
106	NC_010488	ACG	2	6	11190	11195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650889
107	NC_010488	CTG	3	9	11202	11210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650889
108	NC_010488	GAT	2	6	11219	11224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650889
109	NC_010488	CCA	2	6	11258	11263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650889
110	NC_010488	TCT	2	6	11308	11313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650889
111	NC_010488	CTT	2	6	11376	11381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650889
112	NC_010488	TCT	2	6	11452	11457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650889
113	NC_010488	AAC	2	6	11463	11468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650889
114	NC_010488	GAC	2	6	11504	11509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650889
115	NC_010488	CCA	2	6	11984	11989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650889
116	NC_010488	CAG	2	6	12066	12071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650889
117	NC_010488	CCA	2	6	12308	12313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650889
118	NC_010488	GCC	2	6	12319	12324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650889
119	NC_010488	CCA	2	6	12380	12385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650889
120	NC_010488	CGC	2	6	12426	12431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650889
121	NC_010488	TAT	2	6	12509	12514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650889
122	NC_010488	GGC	2	6	12555	12560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650889
123	NC_010488	CAC	2	6	12645	12650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650889
124	NC_010488	GAC	2	6	12683	12688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650889
125	NC_010488	GAC	2	6	12845	12850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650889
126	NC_010488	TGT	2	6	12874	12879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650889
127	NC_010488	ACA	2	6	12907	12912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650889
128	NC_010488	AAG	2	6	12913	12918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170650889
129	NC_010488	GCT	2	6	12974	12979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650889
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132	NC_010488	ATG	2	6	13294	13299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650889
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240	NC_010488	ATA	2	6	20309	20314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170650822
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242	NC_010488	AAC	2	6	20380	20385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650822
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244	NC_010488	CAC	2	6	20412	20417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650822
245	NC_010488	TAA	2	6	20463	20468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170650822
246	NC_010488	AAT	2	6	20536	20541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170650822
247	NC_010488	AAC	2	6	20557	20562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650822
248	NC_010488	AAT	2	6	20580	20585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170650822
249	NC_010488	GTC	2	6	20662	20667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650828
250	NC_010488	CAT	2	6	20725	20730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650828
251	NC_010488	ATG	2	6	20915	20920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650828
252	NC_010488	GCT	2	6	20955	20960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650828
253	NC_010488	CTG	2	6	20970	20975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650828
254	NC_010488	CTG	2	6	21082	21087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650828
255	NC_010488	TTG	2	6	21168	21173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650828
256	NC_010488	ATA	2	6	21200	21205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170650828
257	NC_010488	AGC	2	6	21318	21323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650828
258	NC_010488	TCA	2	6	21366	21371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650840
259	NC_010488	TCA	2	6	21381	21386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650840
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261	NC_010488	TCA	2	6	21601	21606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650840
262	NC_010488	TCA	2	6	21717	21722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650771
263	NC_010488	TCA	2	6	21776	21781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650771
264	NC_010488	CTG	3	9	21850	21858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650771
265	NC_010488	TTC	2	6	21929	21934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650771
266	NC_010488	TCA	2	6	21995	22000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650771
267	NC_010488	CTG	2	6	22001	22006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650771
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269	NC_010488	CTT	2	6	22075	22080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650771
270	NC_010488	CTG	2	6	22146	22151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650771
271	NC_010488	GCC	2	6	22160	22165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650771
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273	NC_010488	CTT	2	6	22320	22325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650771
274	NC_010488	CTG	2	6	22401	22406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650771
275	NC_010488	CAG	2	6	22436	22441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650771
276	NC_010488	CTG	2	6	22722	22727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650771
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498	NC_010488	TTC	2	6	41203	41208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650870
499	NC_010488	GGC	2	6	41325	41330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650870
500	NC_010488	CCT	2	6	41419	41424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650814

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