MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 plasmid pSMS35_130

Total Repeats: 165

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010488	GA	3	6	203	208	50 %	0 %	50 %	0 %	170650844
2	NC_010488	TG	3	6	482	487	0 %	50 %	50 %	0 %	170650844
3	NC_010488	CT	4	8	2126	2133	0 %	50 %	0 %	50 %	170650796
4	NC_010488	TG	3	6	2191	2196	0 %	50 %	50 %	0 %	170650796
5	NC_010488	AT	3	6	3819	3824	50 %	50 %	0 %	0 %	170650855
6	NC_010488	AT	3	6	3867	3872	50 %	50 %	0 %	0 %	170650855
7	NC_010488	CA	3	6	4628	4633	50 %	0 %	0 %	50 %	170650904
8	NC_010488	GA	3	6	7292	7297	50 %	0 %	50 %	0 %	170650784
9	NC_010488	TG	3	6	8123	8128	0 %	50 %	50 %	0 %	170650784
10	NC_010488	CT	3	6	8244	8249	0 %	50 %	0 %	50 %	170650784
11	NC_010488	TG	3	6	8744	8749	0 %	50 %	50 %	0 %	170650784
12	NC_010488	CT	3	6	9335	9340	0 %	50 %	0 %	50 %	170650784
13	NC_010488	GC	4	8	10049	10056	0 %	0 %	50 %	50 %	170650784
14	NC_010488	GT	3	6	10652	10657	0 %	50 %	50 %	0 %	170650784
15	NC_010488	AG	4	8	11617	11624	50 %	0 %	50 %	0 %	170650889
16	NC_010488	CA	3	6	12034	12039	50 %	0 %	0 %	50 %	170650889
17	NC_010488	AT	3	6	12994	12999	50 %	50 %	0 %	0 %	170650889
18	NC_010488	GA	3	6	14577	14582	50 %	0 %	50 %	0 %	170650886
19	NC_010488	TA	3	6	14605	14610	50 %	50 %	0 %	0 %	170650886
20	NC_010488	TG	3	6	16159	16164	0 %	50 %	50 %	0 %	170650902
21	NC_010488	AC	3	6	16343	16348	50 %	0 %	0 %	50 %	170650902
22	NC_010488	CG	3	6	16780	16785	0 %	0 %	50 %	50 %	170650902
23	NC_010488	GT	3	6	18133	18138	0 %	50 %	50 %	0 %	170650800
24	NC_010488	TG	3	6	18891	18896	0 %	50 %	50 %	0 %	170650800
25	NC_010488	AT	3	6	19111	19116	50 %	50 %	0 %	0 %	170650880
26	NC_010488	GA	3	6	19850	19855	50 %	0 %	50 %	0 %	170650781
27	NC_010488	TG	3	6	22409	22414	0 %	50 %	50 %	0 %	170650771
28	NC_010488	TC	3	6	24121	24126	0 %	50 %	0 %	50 %	170650862
29	NC_010488	AC	3	6	24464	24469	50 %	0 %	0 %	50 %	170650862
30	NC_010488	CG	3	6	27456	27461	0 %	0 %	50 %	50 %	170650779
31	NC_010488	TG	3	6	27505	27510	0 %	50 %	50 %	0 %	170650779
32	NC_010488	GC	3	6	27924	27929	0 %	0 %	50 %	50 %	170650779
33	NC_010488	CA	3	6	28130	28135	50 %	0 %	0 %	50 %	170650779
34	NC_010488	CT	3	6	28393	28398	0 %	50 %	0 %	50 %	170650779
35	NC_010488	GC	3	6	28399	28404	0 %	0 %	50 %	50 %	170650779
36	NC_010488	AC	3	6	28987	28992	50 %	0 %	0 %	50 %	170650779
37	NC_010488	TG	3	6	29107	29112	0 %	50 %	50 %	0 %	170650779
38	NC_010488	CG	3	6	29423	29428	0 %	0 %	50 %	50 %	170650779
39	NC_010488	GC	3	6	32254	32259	0 %	0 %	50 %	50 %	170650812
40	NC_010488	GC	3	6	33317	33322	0 %	0 %	50 %	50 %	170650906
41	NC_010488	AT	3	6	34261	34266	50 %	50 %	0 %	0 %	170650797
42	NC_010488	AG	3	6	34473	34478	50 %	0 %	50 %	0 %	170650797
43	NC_010488	CT	3	6	35325	35330	0 %	50 %	0 %	50 %	170650869
44	NC_010488	TA	3	6	36107	36112	50 %	50 %	0 %	0 %	170650783
45	NC_010488	CT	3	6	36114	36119	0 %	50 %	0 %	50 %	170650783
46	NC_010488	CA	3	6	36301	36306	50 %	0 %	0 %	50 %	170650783
47	NC_010488	TC	3	6	36548	36553	0 %	50 %	0 %	50 %	170650851
48	NC_010488	GA	3	6	36612	36617	50 %	0 %	50 %	0 %	170650851
49	NC_010488	CA	4	8	37858	37865	50 %	0 %	0 %	50 %	170650793
50	NC_010488	TA	4	8	37926	37933	50 %	50 %	0 %	0 %	170650793
51	NC_010488	AC	3	6	40366	40371	50 %	0 %	0 %	50 %	170650845
52	NC_010488	AC	4	8	40377	40384	50 %	0 %	0 %	50 %	170650845
53	NC_010488	CT	3	6	40759	40764	0 %	50 %	0 %	50 %	170650870
54	NC_010488	GA	3	6	41591	41596	50 %	0 %	50 %	0 %	170650814
55	NC_010488	CA	3	6	41957	41962	50 %	0 %	0 %	50 %	170650892
56	NC_010488	CG	3	6	43234	43239	0 %	0 %	50 %	50 %	170650892
57	NC_010488	TG	3	6	43382	43387	0 %	50 %	50 %	0 %	170650892
58	NC_010488	CT	3	6	43910	43915	0 %	50 %	0 %	50 %	170650898
59	NC_010488	GC	3	6	44503	44508	0 %	0 %	50 %	50 %	170650901
60	NC_010488	GC	3	6	45561	45566	0 %	0 %	50 %	50 %	170650786
61	NC_010488	CG	3	6	45675	45680	0 %	0 %	50 %	50 %	170650791
62	NC_010488	CA	3	6	45954	45959	50 %	0 %	0 %	50 %	170650791
63	NC_010488	GC	3	6	46145	46150	0 %	0 %	50 %	50 %	170650791
64	NC_010488	TC	3	6	47352	47357	0 %	50 %	0 %	50 %	170650805
65	NC_010488	CG	3	6	47527	47532	0 %	0 %	50 %	50 %	170650805
66	NC_010488	GT	3	6	48370	48375	0 %	50 %	50 %	0 %	170650821
67	NC_010488	GT	3	6	49595	49600	0 %	50 %	50 %	0 %	170650827
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69	NC_010488	TA	3	6	50698	50703	50 %	50 %	0 %	0 %	170650843
70	NC_010488	GA	3	6	52540	52545	50 %	0 %	50 %	0 %	170650903
71	NC_010488	CA	3	6	53016	53021	50 %	0 %	0 %	50 %	170650858
72	NC_010488	TC	3	6	53706	53711	0 %	50 %	0 %	50 %	170650790
73	NC_010488	CG	3	6	54527	54532	0 %	0 %	50 %	50 %	170650790
74	NC_010488	GC	3	6	55072	55077	0 %	0 %	50 %	50 %	170650895
75	NC_010488	GA	3	6	57205	57210	50 %	0 %	50 %	0 %	170650830
76	NC_010488	TA	3	6	57699	57704	50 %	50 %	0 %	0 %	170650830
77	NC_010488	AT	3	6	57811	57816	50 %	50 %	0 %	0 %	170650830
78	NC_010488	AT	3	6	58006	58011	50 %	50 %	0 %	0 %	170650830
79	NC_010488	TA	3	6	58143	58148	50 %	50 %	0 %	0 %	170650830
80	NC_010488	TA	4	8	58181	58188	50 %	50 %	0 %	0 %	170650830
81	NC_010488	TA	3	6	59389	59394	50 %	50 %	0 %	0 %	170650905
82	NC_010488	TC	3	6	59818	59823	0 %	50 %	0 %	50 %	170650861
83	NC_010488	AT	3	6	60613	60618	50 %	50 %	0 %	0 %	170650834
84	NC_010488	AT	3	6	60652	60657	50 %	50 %	0 %	0 %	170650834
85	NC_010488	AG	3	6	61644	61649	50 %	0 %	50 %	0 %	170650804
86	NC_010488	GA	3	6	62667	62672	50 %	0 %	50 %	0 %	170650819
87	NC_010488	AT	3	6	62922	62927	50 %	50 %	0 %	0 %	170650819
88	NC_010488	AT	3	6	63060	63065	50 %	50 %	0 %	0 %	170650819
89	NC_010488	CG	3	6	63352	63357	0 %	0 %	50 %	50 %	170650876
90	NC_010488	TG	3	6	63859	63864	0 %	50 %	50 %	0 %	170650876
91	NC_010488	GC	3	6	64052	64057	0 %	0 %	50 %	50 %	170650778
92	NC_010488	AC	3	6	67207	67212	50 %	0 %	0 %	50 %	170650841
93	NC_010488	GC	4	8	67836	67843	0 %	0 %	50 %	50 %	170650872
94	NC_010488	TG	3	6	68676	68681	0 %	50 %	50 %	0 %	170650816
95	NC_010488	AC	3	6	68987	68992	50 %	0 %	0 %	50 %	170650881
96	NC_010488	TG	3	6	69409	69414	0 %	50 %	50 %	0 %	170650788
97	NC_010488	AT	3	6	69530	69535	50 %	50 %	0 %	0 %	170650788
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101	NC_010488	AT	3	6	72146	72151	50 %	50 %	0 %	0 %	170650860
102	NC_010488	TC	3	6	72197	72202	0 %	50 %	0 %	50 %	170650860
103	NC_010488	AT	3	6	73081	73086	50 %	50 %	0 %	0 %	170650913
104	NC_010488	AG	3	6	73179	73184	50 %	0 %	50 %	0 %	170650913
105	NC_010488	AT	3	6	74353	74358	50 %	50 %	0 %	0 %	170650768
106	NC_010488	TA	3	6	74627	74632	50 %	50 %	0 %	0 %	170650768
107	NC_010488	AC	3	6	77780	77785	50 %	0 %	0 %	50 %	170650767
108	NC_010488	AG	3	6	81985	81990	50 %	0 %	50 %	0 %	170650857
109	NC_010488	CA	3	6	83407	83412	50 %	0 %	0 %	50 %	170650908
110	NC_010488	TC	3	6	83859	83864	0 %	50 %	0 %	50 %	170650761
111	NC_010488	AT	3	6	84133	84138	50 %	50 %	0 %	0 %	170650761
112	NC_010488	GC	3	6	84567	84572	0 %	0 %	50 %	50 %	170650847
113	NC_010488	TC	3	6	85687	85692	0 %	50 %	0 %	50 %	170650765
114	NC_010488	CG	3	6	85805	85810	0 %	0 %	50 %	50 %	170650765
115	NC_010488	TC	3	6	87172	87177	0 %	50 %	0 %	50 %	170650874
116	NC_010488	CG	3	6	87290	87295	0 %	0 %	50 %	50 %	170650874
117	NC_010488	CA	3	6	87723	87728	50 %	0 %	0 %	50 %	170650787
118	NC_010488	AT	3	6	87924	87929	50 %	50 %	0 %	0 %	170650787
119	NC_010488	TC	3	6	89391	89396	0 %	50 %	0 %	50 %	170650853
120	NC_010488	CG	3	6	89509	89514	0 %	0 %	50 %	50 %	170650853
121	NC_010488	GC	3	6	90464	90469	0 %	0 %	50 %	50 %	170650836
122	NC_010488	GC	3	6	90575	90580	0 %	0 %	50 %	50 %	170650836
123	NC_010488	TC	3	6	92255	92260	0 %	50 %	0 %	50 %	170650833
124	NC_010488	CG	3	6	92373	92378	0 %	0 %	50 %	50 %	170650833
125	NC_010488	GC	3	6	94394	94399	0 %	0 %	50 %	50 %	170650766
126	NC_010488	GC	3	6	95665	95670	0 %	0 %	50 %	50 %	170650766
127	NC_010488	CG	3	6	97947	97952	0 %	0 %	50 %	50 %	170650912
128	NC_010488	CG	3	6	98217	98222	0 %	0 %	50 %	50 %	170650912
129	NC_010488	GC	4	8	98400	98407	0 %	0 %	50 %	50 %	170650912
130	NC_010488	CA	3	6	98493	98498	50 %	0 %	0 %	50 %	170650912
131	NC_010488	GC	3	6	99333	99338	0 %	0 %	50 %	50 %	170650773
132	NC_010488	CT	3	6	99693	99698	0 %	50 %	0 %	50 %	170650808
133	NC_010488	GC	3	6	99840	99845	0 %	0 %	50 %	50 %	170650808
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.