MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 plasmid pSMS35_4

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010486	GAG	2	6	441	446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170650755
2	NC_010486	AAG	2	6	590	595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170650755
3	NC_010486	CTC	2	6	618	623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650755
4	NC_010486	CAG	2	6	624	629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650755
5	NC_010486	TAT	2	6	650	655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650755
6	NC_010486	GAT	2	6	663	668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650755
7	NC_010486	ATT	2	6	728	733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650755
8	NC_010486	TGT	2	6	1027	1032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010486	CTT	2	6	1038	1043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010486	GAA	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010486	ATG	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010486	CCT	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650752
13	NC_010486	CGC	2	6	1175	1180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650752
14	NC_010486	GAT	2	6	1221	1226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650752
15	NC_010486	GCA	2	6	1253	1258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650752
16	NC_010486	TGA	2	6	1389	1394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650752
17	NC_010486	ACA	2	6	1457	1462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650752
18	NC_010486	TCT	2	6	1619	1624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650752
19	NC_010486	TGT	2	6	1676	1681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650752
20	NC_010486	CAG	2	6	1705	1710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650752
21	NC_010486	GTG	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170650752
22	NC_010486	GCT	2	6	1998	2003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650752
23	NC_010486	ACG	2	6	2023	2028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650752
24	NC_010486	TCC	2	6	2036	2041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650752
25	NC_010486	CTG	2	6	2116	2121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650752
26	NC_010486	GCC	2	6	2252	2257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650752
27	NC_010486	GAT	2	6	2300	2305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650752
28	NC_010486	CAT	2	6	2392	2397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650752
29	NC_010486	GAT	2	6	2455	2460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650752
30	NC_010486	CGG	2	6	2522	2527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650752
31	NC_010486	CGC	2	6	2613	2618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650752
32	NC_010486	ATG	2	6	2772	2777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650752
33	NC_010486	GTT	2	6	2803	2808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650752
34	NC_010486	CAG	2	6	2835	2840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650752
35	NC_010486	ATG	2	6	2864	2869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650752
36	NC_010486	TTC	2	6	3032	3037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650752
37	NC_010486	TCA	2	6	3173	3178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650752
38	NC_010486	GCA	2	6	3203	3208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650752
39	NC_010486	GAT	2	6	3241	3246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650752
40	NC_010486	GAT	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650752
41	NC_010486	CAT	2	6	3448	3453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650753
42	NC_010486	AGA	2	6	3471	3476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170650753
43	NC_010486	GCA	2	6	3557	3562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650753
44	NC_010486	GGA	2	6	3586	3591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170650753
45	NC_010486	CGC	2	6	3721	3726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650754
46	NC_010486	TCG	2	6	3959	3964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650754

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.