MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 plasmid pSMS35_8

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010485	TTAT	2	8	27	34	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010485	AATA	2	8	58	65	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010485	CTGA	2	8	570	577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_010485	AACC	2	8	598	605	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010485	TCTG	2	8	805	812	0 %	50 %	25 %	25 %	170650750
6	NC_010485	TCCT	2	8	1288	1295	0 %	50 %	0 %	50 %	170650750
7	NC_010485	CAGC	2	8	2365	2372	25 %	0 %	25 %	50 %	170650744
8	NC_010485	CTCA	2	8	3092	3099	25 %	25 %	0 %	50 %	170650741
9	NC_010485	TCCC	2	8	3857	3864	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_010485	TTTG	2	8	4021	4028	0 %	75 %	25 %	0 %	170650742
11	NC_010485	AAAG	2	8	4186	4193	75 %	0 %	25 %	0 %	170650742
12	NC_010485	TTTG	2	8	4269	4276	0 %	75 %	25 %	0 %	170650742
13	NC_010485	AGCA	2	8	4435	4442	50 %	0 %	25 %	25 %	170650746
14	NC_010485	TAAC	2	8	4466	4473	50 %	25 %	0 %	25 %	170650746
15	NC_010485	TTCA	2	8	4735	4742	25 %	50 %	0 %	25 %	170650746
16	NC_010485	CGTC	2	8	5065	5072	0 %	25 %	25 %	50 %	170650746
17	NC_010485	TTCA	2	8	5341	5348	25 %	50 %	0 %	25 %	170650746
18	NC_010485	CTGC	2	8	5523	5530	0 %	25 %	25 %	50 %	170650746
19	NC_010485	CTGC	2	8	5694	5701	0 %	25 %	25 %	50 %	170650746
20	NC_010485	CCAC	2	8	6049	6056	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_010485	GGAC	2	8	6277	6284	25 %	0 %	50 %	25 %	170650747
22	NC_010485	CAGG	2	8	6532	6539	25 %	0 %	50 %	25 %	170650747
23	NC_010485	ACTC	2	8	6965	6972	25 %	25 %	0 %	50 %	170650748
24	NC_010485	CTGA	2	8	8605	8612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010485	TAAA	2	8	8729	8736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010485	TTGC	2	8	8737	8744	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.