MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 plasmid pSMS35_8

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010485	AAT	2	6	7	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010485	ATT	2	6	73	78	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010485	TTA	2	6	93	98	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010485	ATC	2	6	194	199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010485	TCA	2	6	254	259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650745
6	NC_010485	AGC	2	6	387	392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650745
7	NC_010485	AGA	2	6	410	415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170650745
8	NC_010485	AGA	2	6	445	450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170650745
9	NC_010485	ACA	2	6	638	643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010485	AGT	2	6	755	760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650750
11	NC_010485	TGC	2	6	823	828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650750
12	NC_010485	CTG	2	6	831	836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650750
13	NC_010485	TCT	2	6	896	901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650750
14	NC_010485	GCT	2	6	959	964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650750
15	NC_010485	CTG	2	6	1055	1060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650750
16	NC_010485	TCC	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650750
17	NC_010485	CAT	2	6	1254	1259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650750
18	NC_010485	TGC	2	6	1297	1302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650750
19	NC_010485	CCT	2	6	1431	1436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650750
20	NC_010485	GTT	2	6	1443	1448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650750
21	NC_010485	TTC	2	6	1550	1555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650750
22	NC_010485	CCG	2	6	1556	1561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650750
23	NC_010485	TCC	2	6	2008	2013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650750
24	NC_010485	CGG	2	6	2014	2019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650750
25	NC_010485	TTC	2	6	2060	2065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650750
26	NC_010485	CTT	2	6	2097	2102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650750
27	NC_010485	CAG	2	6	2152	2157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650750
28	NC_010485	ATC	2	6	2210	2215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650750
29	NC_010485	GAC	2	6	2234	2239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650744
30	NC_010485	CCA	2	6	2284	2289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650744
31	NC_010485	CGG	2	6	2384	2389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650744
32	NC_010485	CGC	2	6	2442	2447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650744
33	NC_010485	GTT	2	6	2461	2466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650744
34	NC_010485	TCA	3	9	2499	2507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650744
35	NC_010485	GCT	2	6	2653	2658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650749
36	NC_010485	CAG	2	6	2859	2864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650741
37	NC_010485	GCA	2	6	3545	3550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010485	GAT	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010485	AGT	2	6	3611	3616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010485	CTG	2	6	3664	3669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010485	GCA	2	6	3754	3759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010485	AAG	2	6	3786	3791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010485	AGA	3	9	3834	3842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010485	CAA	2	6	3896	3901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010485	TAC	2	6	4004	4009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650742
46	NC_010485	TAT	2	6	4082	4087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650742
47	NC_010485	AAT	2	6	4220	4225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170650742
48	NC_010485	AAT	2	6	4325	4330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170650742
49	NC_010485	CAT	2	6	4344	4349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650746
50	NC_010485	ACA	2	6	4457	4462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650746
51	NC_010485	TCT	2	6	4491	4496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650746
52	NC_010485	CAT	2	6	4560	4565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650746
53	NC_010485	AGC	2	6	4723	4728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650746
54	NC_010485	TTC	2	6	4906	4911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650746
55	NC_010485	ATT	3	9	4945	4953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650746
56	NC_010485	TCC	2	6	5042	5047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650746
57	NC_010485	TGG	2	6	5076	5081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170650746
58	NC_010485	GAC	2	6	5094	5099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650746
59	NC_010485	TCA	2	6	5144	5149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650746
60	NC_010485	GCA	3	9	5297	5305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650746
61	NC_010485	TGC	2	6	5350	5355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650746
62	NC_010485	CGT	2	6	5429	5434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650746
63	NC_010485	CCT	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650746
64	NC_010485	CTT	2	6	5472	5477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650746
65	NC_010485	TCT	2	6	5489	5494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650746
66	NC_010485	ATT	2	6	5539	5544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650746
67	NC_010485	TTC	2	6	5705	5710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650746
68	NC_010485	CCA	2	6	5780	5785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650746
69	NC_010485	CCG	2	6	5786	5791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650746
70	NC_010485	ATC	2	6	5848	5853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650746
71	NC_010485	CGC	2	6	5984	5989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_010485	CAG	2	6	6389	6394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650747
73	NC_010485	AGC	2	6	6525	6530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650747
74	NC_010485	TGA	2	6	6607	6612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010485	CGG	2	6	6687	6692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650748
76	NC_010485	CTG	2	6	6712	6717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650748
77	NC_010485	AAC	2	6	6764	6769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650748
78	NC_010485	ACA	2	6	6838	6843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650748
79	NC_010485	ATG	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650748
80	NC_010485	GCA	2	6	6924	6929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650748
81	NC_010485	CAG	2	6	6937	6942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650748
82	NC_010485	GCA	2	6	7007	7012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650748
83	NC_010485	GCT	2	6	7038	7043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650748
84	NC_010485	GCA	2	6	7156	7161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010485	CAA	2	6	7177	7182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010485	GAC	2	6	7277	7282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010485	CGC	2	6	7362	7367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_010485	CTT	2	6	7478	7483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010485	TTC	2	6	7492	7497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010485	GGC	2	6	7710	7715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010485	GAA	2	6	7809	7814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010485	ATT	2	6	7923	7928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010485	AAC	2	6	8044	8049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010485	CAA	2	6	8065	8070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010485	GAA	3	9	8133	8141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010485	CAA	2	6	8209	8214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010485	TTC	2	6	8236	8241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010485	CAA	2	6	8460	8465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010485	GTA	2	6	8522	8527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010485	TCA	2	6	8577	8582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010485	TGA	2	6	8625	8630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010485	TAA	2	6	8635	8640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010485	AAG	2	6	8818	8823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010485	ATC	2	6	8889	8894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.