MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010483	AAATGT	2	12	50607	50618	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010483	ATCTTC	2	12	127612	127623	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010483	TAAAAA	2	12	136874	136885	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010483	AGGATC	2	12	179934	179945	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010483	TATCTT	2	12	403974	403985	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010483	AATATA	2	12	421359	421370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010483	GCAACA	2	12	421750	421761	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010483	GTTGTG	2	12	436445	436456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010483	ACTTTT	2	12	535937	535948	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010483	TCCCCT	2	12	701846	701857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_010483	TTTTTG	2	12	773444	773455	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010483	GCTACG	2	12	787743	787754	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010483	CGAGCC	2	12	788640	788651	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010483	TGCAAA	2	12	848076	848087	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010483	GGTGAA	2	12	975130	975141	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010483	GAAGGA	2	12	1012063	1012074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010483	TCACAG	2	12	1062649	1062660	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010483	TCTGGC	2	12	1079424	1079435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010483	TTTTTC	2	12	1140036	1140047	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_010483	CCGCTA	2	12	1194175	1194186	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010483	TGTTTT	2	12	1199649	1199660	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010483	TTCAAA	2	12	1429308	1429319	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_010483	AACCTG	2	12	1503736	1503747	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010483	TATAAC	2	12	1503994	1504005	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010483	TCGAGT	2	12	1505994	1506005	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_010483	AACCTG	2	12	1513737	1513748	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010483	TATAAC	2	12	1513995	1514006	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_010483	AATAAG	2	12	1525572	1525583	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010483	AAACAG	2	12	1541180	1541191	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_010483	TTATTT	2	12	1543748	1543759	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010483	TCACAA	2	12	1626746	1626757	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010483	CTTTTT	2	12	1635392	1635403	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010483	TTGAAA	2	12	1726432	1726443	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010483	CGAGGA	2	12	1739471	1739482	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010483	AGTGAA	2	12	1764856	1764867	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010483	ATTTTT	2	12	1805500	1805511	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010483	CTCGAA	2	12	1821262	1821273	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.