MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 4718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010483	TAAT	2	8	23	30	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010483	TCGG	2	8	173	180	0 %	25 %	50 %	25 %	170287808
3	NC_010483	TTCG	2	8	400	407	0 %	50 %	25 %	25 %	170287808
4	NC_010483	GAAC	2	8	529	536	50 %	0 %	25 %	25 %	170287808
5	NC_010483	AAGA	2	8	877	884	75 %	0 %	25 %	0 %	170287808
6	NC_010483	GAAG	2	8	1027	1034	50 %	0 %	50 %	0 %	170287808
7	NC_010483	AACA	2	8	1316	1323	75 %	0 %	0 %	25 %	170287808
8	NC_010483	TTCC	2	8	1606	1613	0 %	50 %	0 %	50 %	170287809
9	NC_010483	CTTT	2	8	1757	1764	0 %	75 %	0 %	25 %	170287809
10	NC_010483	CCAT	2	8	1893	1900	25 %	25 %	0 %	50 %	170287809
11	NC_010483	GATC	2	8	2478	2485	25 %	25 %	25 %	25 %	170287810
12	NC_010483	GATC	2	8	2583	2590	25 %	25 %	25 %	25 %	170287810
13	NC_010483	TTTC	2	8	2763	2770	0 %	75 %	0 %	25 %	170287810
14	NC_010483	CTGA	2	8	2911	2918	25 %	25 %	25 %	25 %	170287810
15	NC_010483	GGGA	2	8	3728	3735	25 %	0 %	75 %	0 %	170287811
16	NC_010483	CGAT	2	8	3971	3978	25 %	25 %	25 %	25 %	170287811
17	NC_010483	TTTC	2	8	4040	4047	0 %	75 %	0 %	25 %	170287811
18	NC_010483	GAAC	2	8	5100	5107	50 %	0 %	25 %	25 %	170287812
19	NC_010483	AAGA	2	8	5528	5535	75 %	0 %	25 %	0 %	170287812
20	NC_010483	CTTC	2	8	5864	5871	0 %	50 %	0 %	50 %	170287813
21	NC_010483	ATCA	2	8	7555	7562	50 %	25 %	0 %	25 %	170287815
22	NC_010483	GTTT	2	8	8379	8386	0 %	75 %	25 %	0 %	170287816
23	NC_010483	AAAC	2	8	8841	8848	75 %	0 %	0 %	25 %	170287816
24	NC_010483	TCCT	2	8	8910	8917	0 %	50 %	0 %	50 %	170287816
25	NC_010483	CTTT	2	8	9039	9046	0 %	75 %	0 %	25 %	170287816
26	NC_010483	GAAA	2	8	10842	10849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010483	CTCC	2	8	11530	11537	0 %	25 %	0 %	75 %	170287818
28	NC_010483	AAAG	2	8	11555	11562	75 %	0 %	25 %	0 %	170287818
29	NC_010483	AGAT	2	8	12312	12319	50 %	25 %	25 %	0 %	170287819
30	NC_010483	AGAA	2	8	12406	12413	75 %	0 %	25 %	0 %	170287819
31	NC_010483	GAAA	2	8	12570	12577	75 %	0 %	25 %	0 %	170287819
32	NC_010483	CGAT	2	8	12727	12734	25 %	25 %	25 %	25 %	170287820
33	NC_010483	TTGA	2	8	12806	12813	25 %	50 %	25 %	0 %	170287820
34	NC_010483	GTTC	2	8	12997	13004	0 %	50 %	25 %	25 %	170287820
35	NC_010483	ACAA	2	8	13531	13538	75 %	0 %	0 %	25 %	170287821
36	NC_010483	CAAG	2	8	14197	14204	50 %	0 %	25 %	25 %	170287822
37	NC_010483	AAAG	2	8	14287	14294	75 %	0 %	25 %	0 %	170287822
38	NC_010483	GGAG	2	8	14722	14729	25 %	0 %	75 %	0 %	170287822
39	NC_010483	GGAG	2	8	14936	14943	25 %	0 %	75 %	0 %	170287822
40	NC_010483	CATT	2	8	15020	15027	25 %	50 %	0 %	25 %	170287823
41	NC_010483	CTCA	2	8	15400	15407	25 %	25 %	0 %	50 %	170287823
42	NC_010483	GGAG	2	8	15852	15859	25 %	0 %	75 %	0 %	170287823
43	NC_010483	CTTT	2	8	16073	16080	0 %	75 %	0 %	25 %	170287824
44	NC_010483	TTTG	2	8	17084	17091	0 %	75 %	25 %	0 %	170287825
45	NC_010483	GGAA	2	8	17444	17451	50 %	0 %	50 %	0 %	170287825
46	NC_010483	CACT	2	8	17552	17559	25 %	25 %	0 %	50 %	170287825
47	NC_010483	TCTT	2	8	18708	18715	0 %	75 %	0 %	25 %	170287826
48	NC_010483	GAAG	2	8	19387	19394	50 %	0 %	50 %	0 %	170287826
49	NC_010483	GAAA	2	8	19594	19601	75 %	0 %	25 %	0 %	170287826
50	NC_010483	CGTT	2	8	20849	20856	0 %	50 %	25 %	25 %	170287827
51	NC_010483	AACC	2	8	21408	21415	50 %	0 %	0 %	50 %	170287828
52	NC_010483	GAAG	2	8	21515	21522	50 %	0 %	50 %	0 %	170287828
53	NC_010483	AAAG	2	8	21721	21728	75 %	0 %	25 %	0 %	170287828
54	NC_010483	AAGA	2	8	22418	22425	75 %	0 %	25 %	0 %	170287829
55	NC_010483	GAAA	2	8	22494	22501	75 %	0 %	25 %	0 %	170287830
56	NC_010483	ATAA	2	8	22549	22556	75 %	25 %	0 %	0 %	170287830
57	NC_010483	GAAG	2	8	22675	22682	50 %	0 %	50 %	0 %	170287830
58	NC_010483	TGTA	2	8	23159	23166	25 %	50 %	25 %	0 %	170287831
59	NC_010483	GCGG	2	8	23331	23338	0 %	0 %	75 %	25 %	170287831
60	NC_010483	AGGA	2	8	23655	23662	50 %	0 %	50 %	0 %	170287832
61	NC_010483	TCGT	2	8	23895	23902	0 %	50 %	25 %	25 %	170287832
62	NC_010483	ATCT	2	8	24087	24094	25 %	50 %	0 %	25 %	170287832
63	NC_010483	TAAG	2	8	24150	24157	50 %	25 %	25 %	0 %	170287832
64	NC_010483	AAAG	2	8	24172	24179	75 %	0 %	25 %	0 %	170287832
65	NC_010483	GAAG	2	8	24387	24394	50 %	0 %	50 %	0 %	170287833
66	NC_010483	AAGA	2	8	24517	24524	75 %	0 %	25 %	0 %	170287834
67	NC_010483	AGAA	2	8	24772	24779	75 %	0 %	25 %	0 %	170287834
68	NC_010483	GATG	2	8	25326	25333	25 %	25 %	50 %	0 %	170287835
69	NC_010483	GAAA	2	8	25873	25880	75 %	0 %	25 %	0 %	170287837
70	NC_010483	GTAT	2	8	26745	26752	25 %	50 %	25 %	0 %	170287838
71	NC_010483	CACC	2	8	26977	26984	25 %	0 %	0 %	75 %	170287838
72	NC_010483	TCCT	2	8	27170	27177	0 %	50 %	0 %	50 %	170287838
73	NC_010483	TTCC	2	8	27391	27398	0 %	50 %	0 %	50 %	170287839
74	NC_010483	GATC	2	8	28701	28708	25 %	25 %	25 %	25 %	170287840
75	NC_010483	AAAG	2	8	28982	28989	75 %	0 %	25 %	0 %	170287840
76	NC_010483	AACA	2	8	29318	29325	75 %	0 %	0 %	25 %	170287841
77	NC_010483	AGAA	2	8	29395	29402	75 %	0 %	25 %	0 %	170287841
78	NC_010483	TTCG	2	8	30506	30513	0 %	50 %	25 %	25 %	170287842
79	NC_010483	GAAC	2	8	30657	30664	50 %	0 %	25 %	25 %	170287843
80	NC_010483	GAAA	2	8	30813	30820	75 %	0 %	25 %	0 %	170287843
81	NC_010483	CCTC	2	8	30945	30952	0 %	25 %	0 %	75 %	170287843
82	NC_010483	GATG	2	8	31074	31081	25 %	25 %	50 %	0 %	170287843
83	NC_010483	CTTC	2	8	31173	31180	0 %	50 %	0 %	50 %	170287843
84	NC_010483	ATGA	2	8	31713	31720	50 %	25 %	25 %	0 %	170287844
85	NC_010483	CGCC	2	8	31898	31905	0 %	0 %	25 %	75 %	170287844
86	NC_010483	AAAT	2	8	32332	32339	75 %	25 %	0 %	0 %	170287844
87	NC_010483	GAGC	2	8	32357	32364	25 %	0 %	50 %	25 %	170287844
88	NC_010483	GAAC	2	8	32552	32559	50 %	0 %	25 %	25 %	170287844
89	NC_010483	TTTC	2	8	32897	32904	0 %	75 %	0 %	25 %	170287844
90	NC_010483	AAAG	2	8	33402	33409	75 %	0 %	25 %	0 %	170287845
91	NC_010483	TTTG	2	8	33896	33903	0 %	75 %	25 %	0 %	170287845
92	NC_010483	TTCT	2	8	34234	34241	0 %	75 %	0 %	25 %	170287846
93	NC_010483	AACC	2	8	34461	34468	50 %	0 %	0 %	50 %	170287846
94	NC_010483	CGAA	2	8	34965	34972	50 %	0 %	25 %	25 %	170287847
95	NC_010483	GATC	2	8	35281	35288	25 %	25 %	25 %	25 %	170287847
96	NC_010483	ACCA	2	8	35418	35425	50 %	0 %	0 %	50 %	170287848
97	NC_010483	GAAC	2	8	36108	36115	50 %	0 %	25 %	25 %	170287848
98	NC_010483	CAGT	2	8	36419	36426	25 %	25 %	25 %	25 %	170287848
99	NC_010483	GAAG	2	8	36429	36436	50 %	0 %	50 %	0 %	170287848
100	NC_010483	GAAA	2	8	36954	36961	75 %	0 %	25 %	0 %	170287848
101	NC_010483	GGTG	2	8	37614	37621	0 %	25 %	75 %	0 %	170287849
102	NC_010483	AAGG	2	8	38213	38220	50 %	0 %	50 %	0 %	170287850
103	NC_010483	CTTC	2	8	39231	39238	0 %	50 %	0 %	50 %	170287851
104	NC_010483	CAAA	2	8	41940	41947	75 %	0 %	0 %	25 %	170287853
105	NC_010483	TTCT	2	8	43122	43129	0 %	75 %	0 %	25 %	170287854
106	NC_010483	ACGA	2	8	43511	43518	50 %	0 %	25 %	25 %	170287855
107	NC_010483	CTCC	2	8	43684	43691	0 %	25 %	0 %	75 %	170287856
108	NC_010483	GTGG	2	8	43731	43738	0 %	25 %	75 %	0 %	170287856
109	NC_010483	TCCA	2	8	43919	43926	25 %	25 %	0 %	50 %	170287856
110	NC_010483	ATAA	2	8	44670	44677	75 %	25 %	0 %	0 %	170287856
111	NC_010483	CTTC	2	8	45542	45549	0 %	50 %	0 %	50 %	170287857
112	NC_010483	AACG	2	8	45948	45955	50 %	0 %	25 %	25 %	170287857
113	NC_010483	TGCT	2	8	46201	46208	0 %	50 %	25 %	25 %	170287858
114	NC_010483	ACTC	2	8	46475	46482	25 %	25 %	0 %	50 %	170287858
115	NC_010483	ATGG	2	8	46758	46765	25 %	25 %	50 %	0 %	170287858
116	NC_010483	AAGG	2	8	46856	46863	50 %	0 %	50 %	0 %	170287858
117	NC_010483	GAAA	2	8	46952	46959	75 %	0 %	25 %	0 %	170287858
118	NC_010483	GAAA	2	8	47269	47276	75 %	0 %	25 %	0 %	170287859
119	NC_010483	CTGT	2	8	48669	48676	0 %	50 %	25 %	25 %	170287861
120	NC_010483	AAGA	2	8	48962	48969	75 %	0 %	25 %	0 %	170287861
121	NC_010483	TTCT	2	8	49235	49242	0 %	75 %	0 %	25 %	170287861
122	NC_010483	ACCA	2	8	49721	49728	50 %	0 %	0 %	50 %	170287861
123	NC_010483	GCGT	2	8	50190	50197	0 %	25 %	50 %	25 %	170287861
124	NC_010483	GAAG	2	8	50221	50228	50 %	0 %	50 %	0 %	170287861
125	NC_010483	TTTC	2	8	50484	50491	0 %	75 %	0 %	25 %	170287861
126	NC_010483	GTTT	2	8	50728	50735	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010483	AGAA	2	8	52057	52064	75 %	0 %	25 %	0 %	170287864
128	NC_010483	TCCC	2	8	52083	52090	0 %	25 %	0 %	75 %	170287864
129	NC_010483	GGAA	2	8	52118	52125	50 %	0 %	50 %	0 %	170287864
130	NC_010483	AGGT	2	8	52992	52999	25 %	25 %	50 %	0 %	170287864
131	NC_010483	CGGT	2	8	53343	53350	0 %	25 %	50 %	25 %	170287864
132	NC_010483	TCAC	2	8	53371	53378	25 %	25 %	0 %	50 %	170287864
133	NC_010483	AACA	2	8	53652	53659	75 %	0 %	0 %	25 %	170287864
134	NC_010483	ACCG	2	8	53800	53807	25 %	0 %	25 %	50 %	170287865
135	NC_010483	CTCA	2	8	54790	54797	25 %	25 %	0 %	50 %	170287866
136	NC_010483	TTCG	2	8	54808	54815	0 %	50 %	25 %	25 %	170287866
137	NC_010483	AACA	2	8	54907	54914	75 %	0 %	0 %	25 %	170287866
138	NC_010483	CTTT	2	8	55267	55274	0 %	75 %	0 %	25 %	170287866
139	NC_010483	CAAG	2	8	55415	55422	50 %	0 %	25 %	25 %	170287867
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141	NC_010483	ATCT	2	8	56276	56283	25 %	50 %	0 %	25 %	170287868
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