MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 1534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010483	CTC	2	6	38	43	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_010483	TCC	2	6	53	58	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_010483	CCT	2	6	10716	10721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_010483	TCT	2	6	10856	10861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010483	AGG	2	6	11036	11041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010483	TCC	2	6	26124	26129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_010483	CTC	2	6	34843	34848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_010483	AGG	2	6	34881	34886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010483	GTA	2	6	39915	39920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010483	TTC	2	6	42207	42212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010483	AAT	2	6	42227	42232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010483	GAA	2	6	43396	43401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010483	TGG	2	6	44771	44776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010483	AGG	2	6	44789	44794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010483	TGG	2	6	46109	46114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010483	GGT	2	6	46131	46136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010483	ACA	2	6	50627	50632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010483	GAA	2	6	50757	50762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010483	CCT	2	6	58508	58513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_010483	AGG	2	6	58567	58572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010483	TAT	2	6	68576	68581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010483	AAG	2	6	68592	68597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010483	CTC	2	6	77110	77115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_010483	TTA	2	6	77117	77122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010483	CCT	2	6	78521	78526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_010483	TTC	2	6	79184	79189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010483	AGA	2	6	79219	79224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010483	AAC	2	6	80257	80262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010483	CCT	2	6	84274	84279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_010483	TCA	2	6	92588	92593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010483	TCT	2	6	92642	92647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010483	TAA	2	6	92734	92739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010483	GGT	2	6	93823	93828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010483	CTT	2	6	95874	95879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010483	TCA	2	6	98254	98259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010483	ACC	2	6	100587	100592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_010483	ATG	2	6	100612	100617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010483	CCT	2	6	101827	101832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_010483	TCC	2	6	102610	102615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_010483	CTG	2	6	102646	102651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010483	CTC	2	6	102738	102743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_010483	TCT	2	6	102764	102769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010483	ATT	2	6	105280	105285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010483	TGT	2	6	105315	105320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010483	TGA	2	6	105335	105340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010483	CCT	2	6	108848	108853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_010483	CCA	2	6	113273	113278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_010483	AAC	2	6	114372	114377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010483	ATT	2	6	114385	114390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010483	GAA	2	6	114445	114450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010483	CCT	2	6	115174	115179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_010483	AAT	2	6	115220	115225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010483	CCT	2	6	121748	121753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_010483	AGG	2	6	121869	121874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010483	GGT	2	6	127594	127599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010483	GGA	2	6	127663	127668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010483	CTT	2	6	127901	127906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010483	CCA	2	6	128020	128025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_010483	TCT	2	6	128204	128209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010483	GAA	2	6	128238	128243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010483	ACC	2	6	129775	129780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_010483	CCT	2	6	131067	131072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_010483	CCG	2	6	136889	136894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_010483	TCC	2	6	136912	136917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_010483	CCG	2	6	136931	136936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_010483	TCC	2	6	136976	136981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_010483	GTG	2	6	137471	137476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010483	CTC	2	6	138287	138292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_010483	ATC	2	6	140327	140332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010483	ACC	2	6	140818	140823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_010483	ATC	2	6	140870	140875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010483	CCA	2	6	143829	143834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_010483	GAG	2	6	143862	143867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010483	AAG	2	6	143899	143904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010483	AAC	2	6	148323	148328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010483	ATC	2	6	154233	154238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010483	CCT	2	6	154239	154244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_010483	TCA	2	6	154258	154263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010483	CAA	2	6	154281	154286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010483	AGT	2	6	154315	154320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010483	GGT	3	9	154344	154352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010483	AGG	2	6	156250	156255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010483	TCC	2	6	157424	157429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_010483	GCA	2	6	158808	158813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010483	ACC	2	6	160836	160841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_010483	GTT	2	6	160845	160850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010483	TCT	2	6	171746	171751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010483	ACC	2	6	171773	171778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010483	CCG	2	6	171796	171801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_010483	GGA	2	6	171872	171877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010483	GAA	2	6	179608	179613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010483	GAA	2	6	179731	179736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010483	GGA	2	6	179818	179823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010483	GGA	2	6	179906	179911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010483	GTG	2	6	180011	180016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010483	GGA	2	6	180089	180094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010483	CAC	2	6	192916	192921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_010483	GAG	2	6	192959	192964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010483	TCA	2	6	192991	192996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010483	GCC	2	6	193099	193104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_010483	TGG	2	6	193120	193125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010483	TCT	3	9	193166	193174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010483	CTC	2	6	193281	193286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_010483	TAC	2	6	196831	196836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010483	CTT	2	6	201259	201264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010483	CCT	2	6	204576	204581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_010483	GAA	2	6	215790	215795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010483	GAG	2	6	220012	220017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010483	TGA	2	6	225415	225420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010483	CCT	2	6	227965	227970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_010483	CCT	2	6	229870	229875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_010483	CCT	2	6	232932	232937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_010483	AGA	2	6	233040	233045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010483	TCT	2	6	233064	233069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010483	CCA	2	6	233139	233144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_010483	CTC	2	6	233206	233211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_010483	CCA	2	6	233270	233275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_010483	TTA	2	6	234772	234777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010483	AGA	2	6	237440	237445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010483	TAC	2	6	237463	237468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010483	ACC	2	6	240239	240244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_010483	CTC	2	6	251507	251512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_010483	TAC	2	6	251524	251529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010483	TGA	2	6	251572	251577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010483	GGT	2	6	251639	251644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010483	AGG	2	6	255068	255073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010483	TAT	3	9	257093	257101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010483	CCG	2	6	257141	257146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_010483	CCT	2	6	257784	257789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_010483	TCC	2	6	258447	258452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_010483	TAA	2	6	258521	258526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010483	CGG	2	6	260440	260445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010483	AGG	2	6	266405	266410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010483	CCT	2	6	268361	268366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_010483	AAC	2	6	268537	268542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010483	CAA	2	6	268608	268613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010483	CAC	2	6	268648	268653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_010483	GAA	2	6	268799	268804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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