MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 5171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010483	AG	3	6	67	72	50 %	0 %	50 %	0 %	170287808
2	NC_010483	CA	3	6	713	718	50 %	0 %	0 %	50 %	170287808
3	NC_010483	AC	3	6	1651	1656	50 %	0 %	0 %	50 %	170287809
4	NC_010483	AG	3	6	1913	1918	50 %	0 %	50 %	0 %	170287809
5	NC_010483	AG	3	6	2638	2643	50 %	0 %	50 %	0 %	170287810
6	NC_010483	TC	3	6	2776	2781	0 %	50 %	0 %	50 %	170287810
7	NC_010483	CT	3	6	3412	3417	0 %	50 %	0 %	50 %	170287811
8	NC_010483	CT	3	6	3896	3901	0 %	50 %	0 %	50 %	170287811
9	NC_010483	AG	3	6	4205	4210	50 %	0 %	50 %	0 %	170287811
10	NC_010483	TC	3	6	4682	4687	0 %	50 %	0 %	50 %	170287812
11	NC_010483	AG	3	6	5000	5005	50 %	0 %	50 %	0 %	170287812
12	NC_010483	TC	3	6	7080	7085	0 %	50 %	0 %	50 %	170287814
13	NC_010483	GA	3	6	7185	7190	50 %	0 %	50 %	0 %	170287814
14	NC_010483	CG	3	6	7513	7518	0 %	0 %	50 %	50 %	170287815
15	NC_010483	GC	3	6	7738	7743	0 %	0 %	50 %	50 %	170287815
16	NC_010483	GA	3	6	7827	7832	50 %	0 %	50 %	0 %	170287816
17	NC_010483	GA	3	6	7864	7869	50 %	0 %	50 %	0 %	170287816
18	NC_010483	CT	3	6	8168	8173	0 %	50 %	0 %	50 %	170287816
19	NC_010483	TC	3	6	8339	8344	0 %	50 %	0 %	50 %	170287816
20	NC_010483	CT	4	8	8409	8416	0 %	50 %	0 %	50 %	170287816
21	NC_010483	CT	3	6	8609	8614	0 %	50 %	0 %	50 %	170287816
22	NC_010483	GA	3	6	8618	8623	50 %	0 %	50 %	0 %	170287816
23	NC_010483	CT	3	6	8717	8722	0 %	50 %	0 %	50 %	170287816
24	NC_010483	TC	3	6	9030	9035	0 %	50 %	0 %	50 %	170287816
25	NC_010483	CT	3	6	9161	9166	0 %	50 %	0 %	50 %	170287816
26	NC_010483	AT	3	6	9356	9361	50 %	50 %	0 %	0 %	170287816
27	NC_010483	CA	3	6	9969	9974	50 %	0 %	0 %	50 %	170287817
28	NC_010483	CA	3	6	10326	10331	50 %	0 %	0 %	50 %	170287817
29	NC_010483	GA	3	6	10494	10499	50 %	0 %	50 %	0 %	170287817
30	NC_010483	AG	3	6	10681	10686	50 %	0 %	50 %	0 %	170287817
31	NC_010483	GT	3	6	10725	10730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010483	AC	4	8	11333	11340	50 %	0 %	0 %	50 %	170287818
33	NC_010483	AC	3	6	11718	11723	50 %	0 %	0 %	50 %	170287818
34	NC_010483	AT	3	6	11793	11798	50 %	50 %	0 %	0 %	170287818
35	NC_010483	CT	3	6	12925	12930	0 %	50 %	0 %	50 %	170287820
36	NC_010483	GA	3	6	12983	12988	50 %	0 %	50 %	0 %	170287820
37	NC_010483	CT	3	6	13615	13620	0 %	50 %	0 %	50 %	170287821
38	NC_010483	TC	3	6	13787	13792	0 %	50 %	0 %	50 %	170287821
39	NC_010483	AG	3	6	14367	14372	50 %	0 %	50 %	0 %	170287822
40	NC_010483	AC	3	6	15049	15054	50 %	0 %	0 %	50 %	170287823
41	NC_010483	AG	3	6	15280	15285	50 %	0 %	50 %	0 %	170287823
42	NC_010483	GA	3	6	16084	16089	50 %	0 %	50 %	0 %	170287824
43	NC_010483	AC	3	6	16175	16180	50 %	0 %	0 %	50 %	170287824
44	NC_010483	AG	3	6	16778	16783	50 %	0 %	50 %	0 %	170287825
45	NC_010483	GC	3	6	16790	16795	0 %	0 %	50 %	50 %	170287825
46	NC_010483	AG	3	6	16919	16924	50 %	0 %	50 %	0 %	170287825
47	NC_010483	TC	3	6	16949	16954	0 %	50 %	0 %	50 %	170287825
48	NC_010483	CT	3	6	17969	17974	0 %	50 %	0 %	50 %	170287826
49	NC_010483	GA	3	6	18185	18190	50 %	0 %	50 %	0 %	170287826
50	NC_010483	GA	3	6	18301	18306	50 %	0 %	50 %	0 %	170287826
51	NC_010483	GA	3	6	18607	18612	50 %	0 %	50 %	0 %	170287826
52	NC_010483	TG	3	6	19711	19716	0 %	50 %	50 %	0 %	170287826
53	NC_010483	AG	3	6	20007	20012	50 %	0 %	50 %	0 %	170287827
54	NC_010483	AG	4	8	20015	20022	50 %	0 %	50 %	0 %	170287827
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56	NC_010483	AT	3	6	20882	20887	50 %	50 %	0 %	0 %	170287827
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60	NC_010483	GA	3	6	22318	22323	50 %	0 %	50 %	0 %	170287829
61	NC_010483	GA	4	8	22344	22351	50 %	0 %	50 %	0 %	170287829
62	NC_010483	GA	3	6	22391	22396	50 %	0 %	50 %	0 %	170287829
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73	NC_010483	TC	3	6	26557	26562	0 %	50 %	0 %	50 %	170287838
74	NC_010483	CT	3	6	26564	26569	0 %	50 %	0 %	50 %	170287838
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80	NC_010483	TA	3	6	28419	28424	50 %	50 %	0 %	0 %	170287839
81	NC_010483	AG	3	6	28457	28462	50 %	0 %	50 %	0 %	170287839
82	NC_010483	CT	3	6	28852	28857	0 %	50 %	0 %	50 %	170287840
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89	NC_010483	AG	3	6	32837	32842	50 %	0 %	50 %	0 %	170287844
90	NC_010483	CT	3	6	33554	33559	0 %	50 %	0 %	50 %	170287845
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100	NC_010483	CA	4	8	36031	36038	50 %	0 %	0 %	50 %	170287848
101	NC_010483	GA	3	6	36078	36083	50 %	0 %	50 %	0 %	170287848
102	NC_010483	GA	3	6	36227	36232	50 %	0 %	50 %	0 %	170287848
103	NC_010483	AG	3	6	36492	36497	50 %	0 %	50 %	0 %	170287848
104	NC_010483	GA	3	6	36787	36792	50 %	0 %	50 %	0 %	170287848
105	NC_010483	AG	3	6	37695	37700	50 %	0 %	50 %	0 %	170287849
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108	NC_010483	CA	3	6	38734	38739	50 %	0 %	0 %	50 %	170287850
109	NC_010483	TC	3	6	38799	38804	0 %	50 %	0 %	50 %	170287850
110	NC_010483	CA	3	6	39568	39573	50 %	0 %	0 %	50 %	170287851
111	NC_010483	AC	3	6	39747	39752	50 %	0 %	0 %	50 %	170287851
112	NC_010483	AC	3	6	39885	39890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010483	TA	3	6	40068	40073	50 %	50 %	0 %	0 %	170287852
114	NC_010483	GC	3	6	40307	40312	0 %	0 %	50 %	50 %	170287852
115	NC_010483	CT	3	6	40346	40351	0 %	50 %	0 %	50 %	170287852
116	NC_010483	AC	3	6	41509	41514	50 %	0 %	0 %	50 %	170287853
117	NC_010483	AC	3	6	41994	41999	50 %	0 %	0 %	50 %	170287853
118	NC_010483	AC	3	6	42730	42735	50 %	0 %	0 %	50 %	170287854
119	NC_010483	GA	3	6	42885	42890	50 %	0 %	50 %	0 %	170287854
120	NC_010483	TC	3	6	42960	42965	0 %	50 %	0 %	50 %	170287854
121	NC_010483	GA	3	6	43715	43720	50 %	0 %	50 %	0 %	170287856
122	NC_010483	GT	3	6	43889	43894	0 %	50 %	50 %	0 %	170287856
123	NC_010483	CT	3	6	44005	44010	0 %	50 %	0 %	50 %	170287856
124	NC_010483	TA	3	6	44040	44045	50 %	50 %	0 %	0 %	170287856
125	NC_010483	AG	3	6	44165	44170	50 %	0 %	50 %	0 %	170287856
126	NC_010483	AG	3	6	44833	44838	50 %	0 %	50 %	0 %	170287857
127	NC_010483	AG	3	6	45707	45712	50 %	0 %	50 %	0 %	170287857
128	NC_010483	GA	3	6	45908	45913	50 %	0 %	50 %	0 %	170287857
129	NC_010483	CT	3	6	46421	46426	0 %	50 %	0 %	50 %	170287858
130	NC_010483	GA	3	6	47050	47055	50 %	0 %	50 %	0 %	170287858
131	NC_010483	AG	3	6	48052	48057	50 %	0 %	50 %	0 %	170287860
132	NC_010483	TC	3	6	49557	49562	0 %	50 %	0 %	50 %	170287861
133	NC_010483	GT	3	6	49731	49736	0 %	50 %	50 %	0 %	170287861
134	NC_010483	TC	3	6	50205	50210	0 %	50 %	0 %	50 %	170287861
135	NC_010483	AC	3	6	50661	50666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_010483	TA	3	6	50670	50675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010483	GA	3	6	51143	51148	50 %	0 %	50 %	0 %	170287862
138	NC_010483	GA	4	8	51166	51173	50 %	0 %	50 %	0 %	170287862
139	NC_010483	GA	3	6	51366	51371	50 %	0 %	50 %	0 %	170287862
140	NC_010483	AG	3	6	51637	51642	50 %	0 %	50 %	0 %	170287862
141	NC_010483	GA	3	6	51884	51889	50 %	0 %	50 %	0 %	170287863
142	NC_010483	AG	3	6	52092	52097	50 %	0 %	50 %	0 %	170287864
143	NC_010483	CT	3	6	52511	52516	0 %	50 %	0 %	50 %	170287864
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