MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 259

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010483	GT	3	6	10725	10730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010483	AC	3	6	39885	39890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010483	AC	3	6	50661	50666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010483	TA	3	6	50670	50675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010483	TA	4	8	68490	68497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010483	CT	4	8	68505	68512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010483	TG	3	6	68564	68569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010483	TC	5	10	110565	110574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010483	AC	3	6	110593	110598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010483	AC	3	6	115285	115290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010483	TC	3	6	115313	115318	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010483	CA	3	6	127796	127801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010483	GA	3	6	127937	127942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010483	AT	3	6	129800	129805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010483	AC	3	6	136860	136865	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010483	TG	3	6	137060	137065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010483	AG	3	6	157522	157527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010483	AT	3	6	162553	162558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010483	CT	3	6	179602	179607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010483	GT	3	6	179706	179711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010483	TG	3	6	179749	179754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010483	AC	3	6	180022	180027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010483	TG	3	6	219993	219998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010483	CT	3	6	233175	233180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010483	AC	3	6	266397	266402	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010483	TG	3	6	268409	268414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010483	GA	3	6	268427	268432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010483	AT	3	6	268450	268455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010483	AC	3	6	268461	268466	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010483	AG	3	6	268567	268572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010483	GA	3	6	269448	269453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010483	AT	3	6	280234	280239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010483	TA	3	6	280587	280592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010483	TA	4	8	283821	283828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010483	GA	3	6	283918	283923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010483	TA	3	6	291552	291557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010483	TC	3	6	291805	291810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010483	AT	3	6	292005	292010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010483	AG	3	6	292090	292095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010483	AG	3	6	304874	304879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010483	TG	3	6	309989	309994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010483	AC	3	6	314760	314765	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010483	CT	3	6	322881	322886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010483	AC	4	8	353274	353281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010483	CT	3	6	362502	362507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010483	AG	3	6	387617	387622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010483	GT	3	6	410612	410617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010483	TC	3	6	421686	421691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010483	TC	3	6	436489	436494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010483	TC	3	6	454992	454997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010483	TC	3	6	475217	475222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010483	GA	3	6	512173	512178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010483	AC	4	8	513375	513382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010483	GA	3	6	535984	535989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010483	TG	3	6	543699	543704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010483	CT	3	6	544077	544082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010483	TG	3	6	544083	544088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010483	GA	3	6	545224	545229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010483	AT	3	6	550716	550721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010483	AG	3	6	558691	558696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010483	AC	3	6	559037	559042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010483	AC	3	6	559100	559105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010483	AG	3	6	559107	559112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010483	GT	3	6	559287	559292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010483	AC	3	6	559484	559489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010483	AT	3	6	559558	559563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010483	AT	3	6	563398	563403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010483	AT	3	6	563428	563433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010483	TA	5	10	567028	567037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010483	AT	3	6	580650	580655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010483	AC	3	6	591345	591350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010483	AC	3	6	591408	591413	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010483	AG	3	6	591415	591420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010483	GT	3	6	591595	591600	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010483	AT	3	6	591866	591871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010483	TC	3	6	592394	592399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010483	CT	3	6	592415	592420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010483	AC	3	6	611925	611930	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010483	TC	3	6	616337	616342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010483	GA	3	6	621123	621128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010483	AC	3	6	623938	623943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010483	AC	3	6	628002	628007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_010483	AC	3	6	644358	644363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010483	AT	3	6	662848	662853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010483	CA	3	6	666332	666337	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010483	TA	3	6	676573	676578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010483	AT	3	6	676579	676584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010483	AT	3	6	684489	684494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010483	TC	4	8	713925	713932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010483	CT	3	6	725200	725205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_010483	GA	4	8	739443	739450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010483	TC	3	6	744427	744432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010483	CT	3	6	757210	757215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010483	AT	3	6	763693	763698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010483	TC	3	6	768602	768607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010483	GC	3	6	772889	772894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_010483	GC	3	6	773058	773063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_010483	AG	3	6	784315	784320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010483	GC	3	6	785556	785561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_010483	TG	3	6	787448	787453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010483	GT	3	6	788836	788841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010483	GT	3	6	789005	789010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010483	AC	3	6	789648	789653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010483	TC	3	6	818979	818984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010483	CA	3	6	819080	819085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010483	TG	3	6	821721	821726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010483	AT	3	6	821863	821868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010483	GA	3	6	826123	826128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010483	GC	3	6	828649	828654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010483	AC	3	6	848111	848116	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_010483	CA	3	6	917447	917452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_010483	AT	3	6	930480	930485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010483	AT	3	6	930495	930500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010483	AC	3	6	933801	933806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_010483	AG	3	6	943511	943516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010483	CT	3	6	943527	943532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010483	GA	3	6	956173	956178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010483	TG	3	6	974786	974791	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010483	GT	3	6	975192	975197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010483	AG	3	6	975472	975477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010483	AC	3	6	976403	976408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010483	AG	3	6	976410	976415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010483	GT	3	6	976590	976595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010483	AC	3	6	976787	976792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010483	AT	3	6	981510	981515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010483	CT	3	6	997673	997678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010483	CT	3	6	997690	997695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_010483	CT	3	6	997778	997783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_010483	AT	3	6	1003292	1003297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010483	AG	3	6	1003566	1003571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010483	AG	3	6	1006082	1006087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010483	TG	3	6	1010836	1010841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010483	TA	3	6	1034207	1034212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010483	GA	3	6	1038535	1038540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010483	TA	3	6	1051268	1051273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010483	AT	3	6	1051282	1051287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010483	TG	3	6	1061531	1061536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010483	AC	3	6	1061729	1061734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_010483	CT	3	6	1061909	1061914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010483	TG	3	6	1061915	1061920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010483	TG	3	6	1063196	1063201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010483	TG	3	6	1063263	1063268	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010483	TG	3	6	1063330	1063335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010483	TG	3	6	1063397	1063402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010483	TG	4	8	1063857	1063864	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010483	AG	3	6	1078131	1078136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010483	CT	3	6	1079436	1079441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_010483	CT	3	6	1079648	1079653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_010483	AT	3	6	1083754	1083759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010483	GA	3	6	1116614	1116619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010483	AG	3	6	1116826	1116831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010483	AT	3	6	1124848	1124853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.