MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Korarchaeum cryptofilum OPF8 chromosome

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010482	ATATTG	2	12	9179	9190	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010482	CTCCGA	2	12	64270	64281	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010482	ATTTAT	2	12	100451	100462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010482	CGCATA	2	12	172008	172019	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010482	TTTATT	2	12	182814	182825	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010482	AAATTC	2	12	186633	186644	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010482	TCATTC	2	12	282076	282087	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010482	CTTCAT	2	12	285978	285989	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010482	ATTTTT	2	12	358338	358349	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010482	TTTTTA	2	12	360676	360687	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010482	TTAACC	2	12	387114	387125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010482	ATTAGA	2	12	424697	424708	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010482	AAGCTG	2	12	433817	433828	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010482	TTCCTC	2	12	445950	445961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010482	CCCGGC	2	12	448403	448414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_010482	ATATAA	2	12	507106	507117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010482	GTTTTC	2	12	540408	540419	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010482	TAAAAA	2	12	541647	541658	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010482	GCCCAG	2	12	596291	596302	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010482	GCTCCT	2	12	596453	596464	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010482	TTTAAA	2	12	674414	674425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010482	TTCCTC	2	12	689113	689124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010482	AAATTT	2	12	730820	730831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010482	AATGGG	2	12	738681	738692	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010482	GATCGG	2	12	798441	798452	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_010482	TTCCCA	2	12	799159	799170	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010482	TTAAAG	2	12	830047	830058	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010482	AGAGAT	2	12	851357	851368	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010482	TAATAT	2	12	934840	934851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010482	TCTCCC	2	12	971610	971621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_010482	ATATTT	2	12	1104941	1104952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010482	ATCGAG	2	12	1141972	1141983	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010482	CCCGGC	2	12	1270835	1270846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_010482	GCCCCT	2	12	1326630	1326641	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_010482	AGAGGG	2	12	1330411	1330422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010482	CCCGGC	2	12	1340776	1340787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_010482	ATTTAA	2	12	1341005	1341016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010482	ATAAAT	2	12	1391871	1391882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010482	CTGAAG	2	12	1398031	1398042	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010482	GGAGGG	2	12	1526818	1526829	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.