MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Korarchaeum cryptofilum OPF8 chromosome

Total Repeats: 1141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010482	TGCGA	2	10	1618	1627	20 %	20 %	40 %	20 %	170289629
2	NC_010482	TTTAA	2	10	2466	2475	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010482	CCCTA	2	10	4920	4929	20 %	20 %	0 %	60 %	170289633
4	NC_010482	CGATA	2	10	5340	5349	40 %	20 %	20 %	20 %	170289633
5	NC_010482	AGGGA	2	10	7717	7726	40 %	0 %	60 %	0 %	170289635
6	NC_010482	ACTCA	2	10	9276	9285	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_010482	AGATG	2	10	10632	10641	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010482	ATCCC	2	10	11192	11201	20 %	20 %	0 %	60 %	170289640
9	NC_010482	AGTCC	2	10	11410	11419	20 %	20 %	20 %	40 %	170289640
10	NC_010482	CCTTC	2	10	12416	12425	0 %	40 %	0 %	60 %	170289640
11	NC_010482	AACTG	2	10	13981	13990	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_010482	GGGGA	2	10	14352	14361	20 %	0 %	80 %	0 %	170289642
13	NC_010482	GGATA	2	10	14639	14648	40 %	20 %	40 %	0 %	170289642
14	NC_010482	ATCCT	2	10	14849	14858	20 %	40 %	0 %	40 %	170289643
15	NC_010482	AGCTC	2	10	16853	16862	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_010482	CTAAC	2	10	20306	20315	40 %	20 %	0 %	40 %	170289647
17	NC_010482	TTCCC	2	10	22246	22255	0 %	40 %	0 %	60 %	170289649
18	NC_010482	GCTGA	2	10	23097	23106	20 %	20 %	40 %	20 %	170289650
19	NC_010482	ATCCT	2	10	24798	24807	20 %	40 %	0 %	40 %	170289651
20	NC_010482	ACCCT	2	10	25202	25211	20 %	20 %	0 %	60 %	170289651
21	NC_010482	AATAT	2	10	26723	26732	60 %	40 %	0 %	0 %	170289651
22	NC_010482	TCCTC	2	10	28044	28053	0 %	40 %	0 %	60 %	170289653
23	NC_010482	GTAGG	2	10	30882	30891	20 %	20 %	60 %	0 %	170289654
24	NC_010482	ATTGA	2	10	31239	31248	40 %	40 %	20 %	0 %	170289654
25	NC_010482	TCCGA	2	10	33225	33234	20 %	20 %	20 %	40 %	170289656
26	NC_010482	AGGGG	2	10	34478	34487	20 %	0 %	80 %	0 %	170289657
27	NC_010482	AGATG	2	10	35839	35848	40 %	20 %	40 %	0 %	170289658
28	NC_010482	ATCTT	2	10	36240	36249	20 %	60 %	0 %	20 %	170289659
29	NC_010482	CTATC	2	10	36869	36878	20 %	40 %	0 %	40 %	170289660
30	NC_010482	ATGGC	2	10	37795	37804	20 %	20 %	40 %	20 %	170289661
31	NC_010482	TCCTC	2	10	38353	38362	0 %	40 %	0 %	60 %	170289662
32	NC_010482	CCCGT	2	10	40057	40066	0 %	20 %	20 %	60 %	170289663
33	NC_010482	AGAGG	2	10	41535	41544	40 %	0 %	60 %	0 %	170289666
34	NC_010482	GCTGA	2	10	41770	41779	20 %	20 %	40 %	20 %	170289666
35	NC_010482	TGAGG	2	10	42296	42305	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010482	GCCTA	2	10	43500	43509	20 %	20 %	20 %	40 %	170289669
37	NC_010482	AGAGG	2	10	45187	45196	40 %	0 %	60 %	0 %	170289671
38	NC_010482	GGGAT	2	10	46671	46680	20 %	20 %	60 %	0 %	170289672
39	NC_010482	ATGAG	2	10	47327	47336	40 %	20 %	40 %	0 %	170289673
40	NC_010482	ATTTA	2	10	47690	47699	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010482	TCACT	2	10	50788	50797	20 %	40 %	0 %	40 %	170289677
42	NC_010482	CACCC	2	10	54648	54657	20 %	0 %	0 %	80 %	170289683
43	NC_010482	ATCTC	2	10	57999	58008	20 %	40 %	0 %	40 %	170289686
44	NC_010482	TAAGC	2	10	58083	58092	40 %	20 %	20 %	20 %	170289686
45	NC_010482	AGGAG	2	10	58300	58309	40 %	0 %	60 %	0 %	170289686
46	NC_010482	TAGAT	2	10	58520	58529	40 %	40 %	20 %	0 %	170289686
47	NC_010482	ATTTT	2	10	59531	59540	20 %	80 %	0 %	0 %	170289687
48	NC_010482	TAGCA	2	10	60806	60815	40 %	20 %	20 %	20 %	170289688
49	NC_010482	TCCAA	2	10	61758	61767	40 %	20 %	0 %	40 %	170289689
50	NC_010482	CCCCT	2	10	63212	63221	0 %	20 %	0 %	80 %	170289691
51	NC_010482	TCCCC	2	10	64169	64178	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
52	NC_010482	GGCCT	2	10	64428	64437	0 %	20 %	40 %	40 %	170289693
53	NC_010482	GAGAG	2	10	65413	65422	40 %	0 %	60 %	0 %	170289693
54	NC_010482	ACGAT	2	10	65558	65567	40 %	20 %	20 %	20 %	170289693
55	NC_010482	AGGGA	2	10	66551	66560	40 %	0 %	60 %	0 %	170289694
56	NC_010482	ATAAG	2	10	67865	67874	60 %	20 %	20 %	0 %	170289695
57	NC_010482	TATCC	2	10	68800	68809	20 %	40 %	0 %	40 %	170289697
58	NC_010482	GCTCA	2	10	69007	69016	20 %	20 %	20 %	40 %	170289697
59	NC_010482	TATCT	2	10	69862	69871	20 %	60 %	0 %	20 %	170289697
60	NC_010482	GGAAG	2	10	70392	70401	40 %	0 %	60 %	0 %	170289698
61	NC_010482	CCGGG	2	10	74890	74899	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
62	NC_010482	GGTAG	2	10	76698	76707	20 %	20 %	60 %	0 %	170289703
63	NC_010482	CTCTC	2	10	77682	77691	0 %	40 %	0 %	60 %	170289704
64	NC_010482	ATGGG	2	10	78550	78559	20 %	20 %	60 %	0 %	170289705
65	NC_010482	ACCTC	2	10	79122	79131	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
66	NC_010482	GAGGG	2	10	79444	79453	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010482	TAAAA	2	10	82079	82088	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010482	ACCTC	2	10	82188	82197	20 %	20 %	0 %	60 %	170289709
69	NC_010482	TCTAT	2	10	82962	82971	20 %	60 %	0 %	20 %	170289710
70	NC_010482	ATCAT	2	10	84898	84907	40 %	40 %	0 %	20 %	170289711
71	NC_010482	TCCTC	2	10	86347	86356	0 %	40 %	0 %	60 %	170289713
72	NC_010482	GTCCA	2	10	87928	87937	20 %	20 %	20 %	40 %	170289714
73	NC_010482	TCCGG	2	10	88700	88709	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_010482	CTCCC	2	10	91170	91179	0 %	20 %	0 %	80 %	170289717
75	NC_010482	AATTT	2	10	91757	91766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010482	TTCAG	2	10	93230	93239	20 %	40 %	20 %	20 %	170289719
77	NC_010482	TGGTG	2	10	93945	93954	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010482	TGCCC	2	10	94508	94517	0 %	20 %	20 %	60 %	170289720
79	NC_010482	ATGAG	2	10	97882	97891	40 %	20 %	40 %	0 %	170289723
80	NC_010482	CTCTC	2	10	98083	98092	0 %	40 %	0 %	60 %	170289724
81	NC_010482	CGTAA	2	10	100149	100158	40 %	20 %	20 %	20 %	170289726
82	NC_010482	ATATA	2	10	100804	100813	60 %	40 %	0 %	0 %	170289727
83	NC_010482	GATCA	2	10	101050	101059	40 %	20 %	20 %	20 %	170289727
84	NC_010482	TCCCT	2	10	102560	102569	0 %	40 %	0 %	60 %	170289728
85	NC_010482	TATGC	2	10	103129	103138	20 %	40 %	20 %	20 %	170289729
86	NC_010482	ATATA	2	10	103148	103157	60 %	40 %	0 %	0 %	170289729
87	NC_010482	AATCA	2	10	105666	105675	60 %	20 %	0 %	20 %	170289731
88	NC_010482	TAACA	2	10	106544	106553	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_010482	TGAGG	2	10	111562	111571	20 %	20 %	60 %	0 %	170289735
90	NC_010482	TAGGA	2	10	113466	113475	40 %	20 %	40 %	0 %	170289736
91	NC_010482	CTTTC	2	10	115289	115298	0 %	60 %	0 %	40 %	170289738
92	NC_010482	AGGGA	2	10	117349	117358	40 %	0 %	60 %	0 %	170289741
93	NC_010482	GATAA	2	10	117769	117778	60 %	20 %	20 %	0 %	170289741
94	NC_010482	GGGGA	2	10	118615	118624	20 %	0 %	80 %	0 %	170289741
95	NC_010482	GAGAA	2	10	118639	118648	60 %	0 %	40 %	0 %	170289741
96	NC_010482	CCTCA	2	10	118881	118890	20 %	20 %	0 %	60 %	170289742
97	NC_010482	GCTCT	2	10	121637	121646	0 %	40 %	20 %	40 %	170289744
98	NC_010482	CCAGC	2	10	122845	122854	20 %	0 %	20 %	60 %	170289744
99	NC_010482	AGAGG	2	10	123012	123021	40 %	0 %	60 %	0 %	170289744
100	NC_010482	ATGAG	2	10	123083	123092	40 %	20 %	40 %	0 %	170289744
101	NC_010482	GGGAA	2	10	124201	124210	40 %	0 %	60 %	0 %	170289746
102	NC_010482	CATAC	2	10	124652	124661	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_010482	TGAGG	2	10	124712	124721	20 %	20 %	60 %	0 %	170289747
104	NC_010482	TGAGG	2	10	126675	126684	20 %	20 %	60 %	0 %	170289750
105	NC_010482	CCAGA	2	10	127743	127752	40 %	0 %	20 %	40 %	170289752
106	NC_010482	CCTTC	2	10	129123	129132	0 %	40 %	0 %	60 %	170289754
107	NC_010482	AGGGA	2	10	131539	131548	40 %	0 %	60 %	0 %	170289758
108	NC_010482	TACTT	2	10	131978	131987	20 %	60 %	0 %	20 %	170289758
109	NC_010482	TCCCT	2	10	132504	132513	0 %	40 %	0 %	60 %	170289759
110	NC_010482	AGAGG	2	10	136475	136484	40 %	0 %	60 %	0 %	170289761
111	NC_010482	ATAAA	2	10	137277	137286	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010482	AGAGG	2	10	138817	138826	40 %	0 %	60 %	0 %	170289766
113	NC_010482	GCCTA	2	10	140255	140264	20 %	20 %	20 %	40 %	170289767
114	NC_010482	ATGGG	2	10	140377	140386	20 %	20 %	60 %	0 %	170289767
115	NC_010482	CTCTT	2	10	143308	143317	0 %	60 %	0 %	40 %	170289771
116	NC_010482	GCTCT	2	10	143810	143819	0 %	40 %	20 %	40 %	170289772
117	NC_010482	TGGGA	2	10	144165	144174	20 %	20 %	60 %	0 %	170289772
118	NC_010482	ACTCA	2	10	146386	146395	40 %	20 %	0 %	40 %	170289773
119	NC_010482	CTATC	2	10	146618	146627	20 %	40 %	0 %	40 %	170289773
120	NC_010482	CTGAG	2	10	147101	147110	20 %	20 %	40 %	20 %	170289773
121	NC_010482	CCTCT	2	10	147439	147448	0 %	40 %	0 %	60 %	170289774
122	NC_010482	TGAAA	2	10	149158	149167	60 %	20 %	20 %	0 %	170289776
123	NC_010482	GCACT	2	10	151070	151079	20 %	20 %	20 %	40 %	170289778
124	NC_010482	TATCC	2	10	151922	151931	20 %	40 %	0 %	40 %	170289778
125	NC_010482	TCCCT	2	10	153059	153068	0 %	40 %	0 %	60 %	170289780
126	NC_010482	TAAGT	2	10	153685	153694	40 %	40 %	20 %	0 %	170289781
127	NC_010482	GGTAG	2	10	156418	156427	20 %	20 %	60 %	0 %	170289784
128	NC_010482	CTTCC	2	10	158371	158380	0 %	40 %	0 %	60 %	170289785
129	NC_010482	AAGTT	2	10	159486	159495	40 %	40 %	20 %	0 %	170289786
130	NC_010482	CTATC	2	10	159838	159847	20 %	40 %	0 %	40 %	170289786
131	NC_010482	AGTTG	2	10	160646	160655	20 %	40 %	40 %	0 %	170289787
132	NC_010482	AGGGG	2	10	161872	161881	20 %	0 %	80 %	0 %	170289789
133	NC_010482	AGTGG	2	10	162454	162463	20 %	20 %	60 %	0 %	170289789
134	NC_010482	GGAGG	2	10	165007	165016	20 %	0 %	80 %	0 %	170289791
135	NC_010482	CTGAT	2	10	165247	165256	20 %	40 %	20 %	20 %	170289791
136	NC_010482	TCTCC	2	10	167462	167471	0 %	40 %	0 %	60 %	170289793
137	NC_010482	TCTCC	2	10	169387	169396	0 %	40 %	0 %	60 %	170289794
138	NC_010482	ACGTG	2	10	169456	169465	20 %	20 %	40 %	20 %	170289794
139	NC_010482	GGGAG	2	10	173164	173173	20 %	0 %	80 %	0 %	170289799
140	NC_010482	TTTTG	2	10	174592	174601	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010482	GTCAG	2	10	177354	177363	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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231	NC_010482	TCATA	2	10	283917	283926	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
232	NC_010482	GTGCG	2	10	285722	285731	0 %	20 %	60 %	20 %	170289898
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239	NC_010482	GAGCT	2	10	290414	290423	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
240	NC_010482	TCCTC	2	10	292118	292127	0 %	40 %	0 %	60 %	170289903
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242	NC_010482	CATCT	2	10	294639	294648	20 %	40 %	0 %	40 %	170289905
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249	NC_010482	ATCCC	2	10	302302	302311	20 %	20 %	0 %	60 %	170289914
250	NC_010482	ATGAG	2	10	302904	302913	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
251	NC_010482	TTATC	2	10	307034	307043	20 %	60 %	0 %	20 %	170289920
252	NC_010482	CAGGA	2	10	309547	309556	40 %	0 %	40 %	20 %	170289922
253	NC_010482	AGGCT	2	10	310217	310226	20 %	20 %	40 %	20 %	170289923
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255	NC_010482	TTACC	2	10	314538	314547	20 %	40 %	0 %	40 %	170289927
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257	NC_010482	AGTTG	2	10	314674	314683	20 %	40 %	40 %	0 %	170289927
258	NC_010482	AAAAT	2	10	316074	316083	80 %	20 %	0 %	0 %	170289928
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261	NC_010482	ATAAA	2	10	318166	318175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_010482	CCACC	2	10	318481	318490	20 %	0 %	0 %	80 %	170289933
263	NC_010482	CCTCC	2	10	319199	319208	0 %	20 %	0 %	80 %	170289934
264	NC_010482	TGCCA	2	10	319764	319773	20 %	20 %	20 %	40 %	170289934
265	NC_010482	CCCCT	2	10	319848	319857	0 %	20 %	0 %	80 %	170289934
266	NC_010482	CTATC	2	10	320166	320175	20 %	40 %	0 %	40 %	170289935
267	NC_010482	AGCGG	2	10	322912	322921	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
268	NC_010482	ATCCT	2	10	324202	324211	20 %	40 %	0 %	40 %	170289938
269	NC_010482	GATAA	2	10	325381	325390	60 %	20 %	20 %	0 %	170289939
270	NC_010482	GAGGG	2	10	325983	325992	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
271	NC_010482	AGTTC	2	10	326673	326682	20 %	40 %	20 %	20 %	170289940
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284	NC_010482	CCCTT	2	10	346813	346822	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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387	NC_010482	ATCCT	2	10	504820	504829	20 %	40 %	0 %	40 %	170290117
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397	NC_010482	TGAAG	2	10	524655	524664	40 %	20 %	40 %	0 %	170290134
398	NC_010482	AGGTG	2	10	524862	524871	20 %	20 %	60 %	0 %	170290134
399	NC_010482	GATGA	2	10	528441	528450	40 %	20 %	40 %	0 %	170290137
400	NC_010482	GATAG	2	10	530697	530706	40 %	20 %	40 %	0 %	170290139
401	NC_010482	TATCC	2	10	532288	532297	20 %	40 %	0 %	40 %	170290141
402	NC_010482	TGCCC	2	10	532755	532764	0 %	20 %	20 %	60 %	170290141
403	NC_010482	TCGCC	2	10	532872	532881	0 %	20 %	20 %	60 %	170290141
404	NC_010482	GAGGT	2	10	536562	536571	20 %	20 %	60 %	0 %	170290146
405	NC_010482	GAGAC	2	10	539371	539380	40 %	0 %	40 %	20 %	170290150
406	NC_010482	CATCC	2	10	539399	539408	20 %	20 %	0 %	60 %	170290150
407	NC_010482	ATATA	2	10	540500	540509	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
408	NC_010482	TATGA	2	10	541299	541308	40 %	40 %	20 %	0 %	170290151
409	NC_010482	ATAGA	2	10	542303	542312	60 %	20 %	20 %	0 %	170290152
410	NC_010482	GCTGT	2	10	542534	542543	0 %	40 %	40 %	20 %	170290152
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413	NC_010482	TCCTC	2	10	545079	545088	0 %	40 %	0 %	60 %	170290155
414	NC_010482	AGCTG	2	10	545254	545263	20 %	20 %	40 %	20 %	170290155
415	NC_010482	AGGTC	2	10	549717	549726	20 %	20 %	40 %	20 %	170290160
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417	NC_010482	GTGAG	2	10	551168	551177	20 %	20 %	60 %	0 %	170290162
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421	NC_010482	CTTAT	2	10	557202	557211	20 %	60 %	0 %	20 %	170290169
422	NC_010482	CCCCT	2	10	559753	559762	0 %	20 %	0 %	80 %	170290173
423	NC_010482	AGCTC	2	10	561476	561485	20 %	20 %	20 %	40 %	170290174
424	NC_010482	TTCTC	2	10	563843	563852	0 %	60 %	0 %	40 %	170290176
425	NC_010482	TAAAT	2	10	564377	564386	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_010482	TCCTC	2	10	566939	566948	0 %	40 %	0 %	60 %	170290180
427	NC_010482	AATGG	2	10	568872	568881	40 %	20 %	40 %	0 %	170290182
428	NC_010482	CTCAT	2	10	577673	577682	20 %	40 %	0 %	40 %	170290190
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430	NC_010482	CTTAA	2	10	578908	578917	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
431	NC_010482	TATGC	2	10	581435	581444	20 %	40 %	20 %	20 %	170290193
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433	NC_010482	GAGGG	2	10	581851	581860	20 %	0 %	80 %	0 %	170290194
434	NC_010482	ATAGG	2	10	585057	585066	40 %	20 %	40 %	0 %	170290195
435	NC_010482	TCCTC	2	10	588873	588882	0 %	40 %	0 %	60 %	170290199
436	NC_010482	GCTCA	2	10	590140	590149	20 %	20 %	20 %	40 %	170290201
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438	NC_010482	TGAAG	2	10	595682	595691	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
439	NC_010482	GGATA	2	10	597695	597704	40 %	20 %	40 %	0 %	170290208
440	NC_010482	ATCCT	2	10	598868	598877	20 %	40 %	0 %	40 %	170290209
441	NC_010482	CCCAG	2	10	599142	599151	20 %	0 %	20 %	60 %	170290209
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445	NC_010482	ATGAG	2	10	603210	603219	40 %	20 %	40 %	0 %	170290214
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452	NC_010482	AGGAG	2	10	613347	613356	40 %	0 %	60 %	0 %	170290223
453	NC_010482	AGATC	2	10	614345	614354	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
454	NC_010482	TCCCC	2	10	615424	615433	0 %	20 %	0 %	80 %	170290225
455	NC_010482	TATCT	2	10	615468	615477	20 %	60 %	0 %	20 %	170290225
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472	NC_010482	TTAAC	2	10	626116	626125	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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477	NC_010482	GGAGA	2	10	628660	628669	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
478	NC_010482	ATCCA	2	10	631932	631941	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
479	NC_010482	ACTTC	2	10	632036	632045	20 %	40 %	0 %	40 %	170290239
480	NC_010482	GAGCT	2	10	632395	632404	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
481	NC_010482	CACTT	2	10	635261	635270	20 %	40 %	0 %	40 %	170290243
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483	NC_010482	TCCCT	2	10	636622	636631	0 %	40 %	0 %	60 %	170290244
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485	NC_010482	TCAGC	2	10	637684	637693	20 %	20 %	20 %	40 %	170290244
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492	NC_010482	GCTTT	2	10	652864	652873	0 %	60 %	20 %	20 %	170290262
493	NC_010482	ATGCA	2	10	653193	653202	40 %	20 %	20 %	20 %	170290262
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497	NC_010482	AGGAG	2	10	654899	654908	40 %	0 %	60 %	0 %	170290263
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499	NC_010482	GGATG	2	10	659351	659360	20 %	20 %	60 %	0 %	170290268
500	NC_010482	ATCTG	2	10	661268	661277	20 %	40 %	20 %	20 %	170290270

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