MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Korarchaeum cryptofilum OPF8 chromosome

Total Repeats: 20678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010482	AGG	2	6	145	150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289628
2	NC_010482	GCT	2	6	235	240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289628
3	NC_010482	ATG	2	6	358	363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289628
4	NC_010482	CAA	2	6	431	436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170289628
5	NC_010482	GAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289628
6	NC_010482	GGA	2	6	495	500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289628
7	NC_010482	ATA	2	6	613	618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289628
8	NC_010482	GCT	3	9	666	674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289628
9	NC_010482	CGA	2	6	770	775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289628
10	NC_010482	TGG	2	6	818	823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170289628
11	NC_010482	AAT	2	6	861	866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289628
12	NC_010482	GAT	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289628
13	NC_010482	TCC	2	6	1118	1123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289628
14	NC_010482	GGA	2	6	1125	1130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289628
15	NC_010482	GTG	2	6	1150	1155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170289628
16	NC_010482	TTG	2	6	1262	1267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289629
17	NC_010482	CAT	2	6	1313	1318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289629
18	NC_010482	ACA	2	6	1481	1486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170289629
19	NC_010482	GGA	2	6	1704	1709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289629
20	NC_010482	GTC	2	6	1750	1755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289629
21	NC_010482	TCG	2	6	1769	1774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289629
22	NC_010482	GCT	2	6	2210	2215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289630
23	NC_010482	TAT	2	6	2250	2255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289630
24	NC_010482	CAT	2	6	2333	2338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289630
25	NC_010482	TAT	2	6	2572	2577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289631
26	NC_010482	AAT	2	6	2604	2609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289631
27	NC_010482	CCT	2	6	2659	2664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289631
28	NC_010482	TAT	2	6	2788	2793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289631
29	NC_010482	GGA	2	6	3037	3042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289632
30	NC_010482	AGG	2	6	3047	3052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289632
31	NC_010482	TCG	2	6	3084	3089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289632
32	NC_010482	AGG	2	6	3120	3125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289632
33	NC_010482	ATA	2	6	3191	3196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289632
34	NC_010482	TGA	3	9	3199	3207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289632
35	NC_010482	GGC	2	6	3235	3240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170289632
36	NC_010482	ATA	2	6	3257	3262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289632
37	NC_010482	AAG	2	6	3326	3331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289632
38	NC_010482	ATA	2	6	3491	3496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289632
39	NC_010482	GTC	2	6	3549	3554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289633
40	NC_010482	TCT	2	6	3648	3653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289633
41	NC_010482	CCT	2	6	3851	3856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289633
42	NC_010482	TCA	2	6	3908	3913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289633
43	NC_010482	TCC	2	6	3995	4000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289633
44	NC_010482	GGA	2	6	4140	4145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289633
45	NC_010482	CGA	2	6	4148	4153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289633
46	NC_010482	CTC	3	9	4177	4185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289633
47	NC_010482	CTC	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289633
48	NC_010482	CTC	2	6	4305	4310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289633
49	NC_010482	CTC	2	6	4423	4428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289633
50	NC_010482	CCT	2	6	4469	4474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289633
51	NC_010482	GAT	2	6	4722	4727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289633
52	NC_010482	ATC	2	6	4776	4781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289633
53	NC_010482	GAT	2	6	4840	4845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289633
54	NC_010482	TCA	2	6	5081	5086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289633
55	NC_010482	ACG	2	6	5128	5133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289633
56	NC_010482	ATA	2	6	5422	5427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289633
57	NC_010482	ACC	2	6	5484	5489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289634
58	NC_010482	TCA	2	6	5513	5518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289634
59	NC_010482	TTA	2	6	5583	5588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289634
60	NC_010482	CCT	2	6	5634	5639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289634
61	NC_010482	GCA	2	6	5763	5768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289634
62	NC_010482	GCT	2	6	5780	5785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289634
63	NC_010482	TTA	2	6	5910	5915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289634
64	NC_010482	GCT	2	6	5944	5949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289634
65	NC_010482	GAT	2	6	5965	5970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289634
66	NC_010482	ATC	2	6	5977	5982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289634
67	NC_010482	ATG	2	6	6062	6067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289634
68	NC_010482	CCT	2	6	6343	6348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289634
69	NC_010482	GAC	2	6	6364	6369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289634
70	NC_010482	TCC	2	6	6446	6451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289634
71	NC_010482	GAG	2	6	6458	6463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289634
72	NC_010482	GAG	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289634
73	NC_010482	TCA	2	6	6677	6682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289634
74	NC_010482	AAG	2	6	6983	6988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289635
75	NC_010482	AGC	2	6	7123	7128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289635
76	NC_010482	ACT	2	6	7331	7336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289635
77	NC_010482	AAG	2	6	7550	7555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289635
78	NC_010482	GGA	2	6	7561	7566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289635
79	NC_010482	TAG	2	6	7629	7634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289635
80	NC_010482	TTC	2	6	7682	7687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289635
81	NC_010482	TCC	2	6	7694	7699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289635
82	NC_010482	TGA	2	6	7735	7740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289635
83	NC_010482	TAG	2	6	7767	7772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289635
84	NC_010482	TGA	2	6	7811	7816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289635
85	NC_010482	CAT	2	6	7872	7877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289636
86	NC_010482	GAT	2	6	8050	8055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289636
87	NC_010482	TGA	2	6	8247	8252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289636
88	NC_010482	CTC	2	6	8320	8325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289636
89	NC_010482	ACG	2	6	8383	8388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289636
90	NC_010482	CTC	2	6	8430	8435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289636
91	NC_010482	GAA	2	6	8523	8528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289636
92	NC_010482	CTA	2	6	8609	8614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289636
93	NC_010482	GAA	2	6	8712	8717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289636
94	NC_010482	GAT	2	6	8820	8825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289636
95	NC_010482	TAG	2	6	8868	8873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289636
96	NC_010482	GCG	2	6	8962	8967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170289636
97	NC_010482	GAT	2	6	9048	9053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289636
98	NC_010482	GAG	2	6	9133	9138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289636
99	NC_010482	CTC	2	6	9366	9371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289637
100	NC_010482	GCT	2	6	9469	9474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289637
101	NC_010482	CTA	2	6	9479	9484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289637
102	NC_010482	TCC	2	6	9493	9498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289637
103	NC_010482	GAG	2	6	9510	9515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289637
104	NC_010482	CTC	2	6	9655	9660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289637
105	NC_010482	TAG	2	6	9709	9714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289637
106	NC_010482	CCT	2	6	9909	9914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289637
107	NC_010482	CTC	2	6	10002	10007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289637
108	NC_010482	ATC	2	6	10075	10080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289637
109	NC_010482	CCT	2	6	10151	10156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289638
110	NC_010482	TTC	2	6	10230	10235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289638
111	NC_010482	TCC	3	9	10309	10317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289638
112	NC_010482	GGA	2	6	10370	10375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289638
113	NC_010482	CTC	2	6	10393	10398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289638
114	NC_010482	GAG	2	6	10837	10842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289639
115	NC_010482	ATA	2	6	10861	10866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289639
116	NC_010482	TCA	2	6	10873	10878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289639
117	NC_010482	ATC	2	6	10942	10947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289639
118	NC_010482	CTC	2	6	11045	11050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289639
119	NC_010482	ACC	2	6	11115	11120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289640
120	NC_010482	CCT	2	6	11156	11161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289640
121	NC_010482	TCT	2	6	11227	11232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289640
122	NC_010482	CTC	2	6	11285	11290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289640
123	NC_010482	GAG	2	6	11305	11310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289640
124	NC_010482	TAT	2	6	11384	11389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289640
125	NC_010482	AGC	3	9	11489	11497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289640
126	NC_010482	GAA	2	6	11504	11509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289640
127	NC_010482	CCT	2	6	11511	11516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289640
128	NC_010482	CTT	2	6	11540	11545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289640
129	NC_010482	CTC	2	6	11552	11557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289640
130	NC_010482	CTT	2	6	11782	11787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289640
131	NC_010482	TCT	2	6	11797	11802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289640
132	NC_010482	CCT	2	6	12055	12060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289640
133	NC_010482	TCT	2	6	12127	12132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289640
134	NC_010482	GCC	2	6	12143	12148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170289640
135	NC_010482	TGT	2	6	12184	12189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289640
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138	NC_010482	TTC	2	6	12372	12377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289640
139	NC_010482	TTC	2	6	12492	12497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289640
140	NC_010482	ATT	2	6	12624	12629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289640
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142	NC_010482	GCT	2	6	12737	12742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289640
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150	NC_010482	AGG	2	6	13603	13608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289641
151	NC_010482	TAC	2	6	13682	13687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289641
152	NC_010482	AGG	2	6	13719	13724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289641
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154	NC_010482	AGG	2	6	13770	13775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289641
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162	NC_010482	GGA	2	6	14339	14344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289642
163	NC_010482	ATA	2	6	14379	14384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289642
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239	NC_010482	TTA	2	6	20028	20033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289647
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241	NC_010482	AGC	2	6	20294	20299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289647
242	NC_010482	TGA	2	6	20373	20378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289647
243	NC_010482	CTA	2	6	20510	20515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289647
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245	NC_010482	TAT	2	6	20689	20694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289647
246	NC_010482	ACC	2	6	20724	20729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289647
247	NC_010482	ATA	2	6	20740	20745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289647
248	NC_010482	AGT	2	6	20811	20816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289647
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251	NC_010482	TAC	2	6	21205	21210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289647
252	NC_010482	GAA	2	6	21243	21248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289647
253	NC_010482	TTA	2	6	21289	21294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289648
254	NC_010482	TAA	2	6	21298	21303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289648
255	NC_010482	TCC	2	6	21354	21359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289648
256	NC_010482	CTC	2	6	21448	21453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289648
257	NC_010482	ATG	2	6	21462	21467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289648
258	NC_010482	TCC	2	6	21519	21524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289648
259	NC_010482	ACC	2	6	21537	21542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289649
260	NC_010482	TAT	3	9	21562	21570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289649
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284	NC_010482	ATA	2	6	23293	23298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289650
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286	NC_010482	AGG	2	6	23519	23524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289650
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