MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ6

Total Repeats: 270

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010480	TGGC	2	8	73	80	0 %	25 %	50 %	25 %	170079554
2	NC_010480	GCTG	2	8	134	141	0 %	25 %	50 %	25 %	170079554
3	NC_010480	ATTT	2	8	605	612	25 %	75 %	0 %	0 %	170079554
4	NC_010480	GGAT	2	8	3579	3586	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010480	GGCG	2	8	5980	5987	0 %	0 %	75 %	25 %	170079560
6	NC_010480	AGCC	2	8	6186	6193	25 %	0 %	25 %	50 %	170079560
7	NC_010480	ACGA	2	8	6378	6385	50 %	0 %	25 %	25 %	170079560
8	NC_010480	GGCA	2	8	6634	6641	25 %	0 %	50 %	25 %	170079560
9	NC_010480	ATTT	2	8	7215	7222	25 %	75 %	0 %	0 %	170079560
10	NC_010480	AGAA	2	8	8728	8735	75 %	0 %	25 %	0 %	170079561
11	NC_010480	CTGC	2	8	8750	8757	0 %	25 %	25 %	50 %	170079561
12	NC_010480	TGAT	2	8	9300	9307	25 %	50 %	25 %	0 %	170079561
13	NC_010480	ACTG	2	8	10153	10160	25 %	25 %	25 %	25 %	170079561
14	NC_010480	TTAC	2	8	12167	12174	25 %	50 %	0 %	25 %	170079564
15	NC_010480	TCAT	2	8	12918	12925	25 %	50 %	0 %	25 %	170079566
16	NC_010480	GTTG	2	8	12951	12958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010480	AATG	2	8	13186	13193	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010480	TTGA	2	8	13395	13402	25 %	50 %	25 %	0 %	170079567
19	NC_010480	TACA	2	8	14073	14080	50 %	25 %	0 %	25 %	170079567
20	NC_010480	TGAC	2	8	14449	14456	25 %	25 %	25 %	25 %	170079567
21	NC_010480	TTTA	2	8	15346	15353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010480	GCTC	2	8	15610	15617	0 %	25 %	25 %	50 %	170079569
23	NC_010480	ATGG	2	8	15781	15788	25 %	25 %	50 %	0 %	170079569
24	NC_010480	CTAT	2	8	15932	15939	25 %	50 %	0 %	25 %	170079569
25	NC_010480	GAAG	2	8	15948	15955	50 %	0 %	50 %	0 %	170079569
26	NC_010480	TTAA	2	8	16069	16076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010480	CAGG	2	8	16220	16227	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010480	TTTG	2	8	16344	16351	0 %	75 %	25 %	0 %	170079570
29	NC_010480	ACCC	2	8	16848	16855	25 %	0 %	0 %	75 %	170079570
30	NC_010480	AGAA	2	8	17828	17835	75 %	0 %	25 %	0 %	170079570
31	NC_010480	GAAG	2	8	19050	19057	50 %	0 %	50 %	0 %	170079570
32	NC_010480	CGCC	2	8	19191	19198	0 %	0 %	25 %	75 %	170079570
33	NC_010480	TTTA	2	8	20453	20460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010480	CAAC	2	8	20538	20545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010480	GATA	2	8	21440	21447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010480	AAAT	2	8	23426	23433	75 %	25 %	0 %	0 %	170079575
37	NC_010480	AAAC	2	8	24288	24295	75 %	0 %	0 %	25 %	170079575
38	NC_010480	GATG	2	8	24762	24769	25 %	25 %	50 %	0 %	170079575
39	NC_010480	GTTT	2	8	24839	24846	0 %	75 %	25 %	0 %	170079575
40	NC_010480	TCAA	2	8	25171	25178	50 %	25 %	0 %	25 %	170079576
41	NC_010480	TAAA	2	8	27703	27710	75 %	25 %	0 %	0 %	170079583
42	NC_010480	CTTC	2	8	27713	27720	0 %	50 %	0 %	50 %	170079583
43	NC_010480	ATAA	2	8	27772	27779	75 %	25 %	0 %	0 %	170079583
44	NC_010480	GTTG	2	8	28184	28191	0 %	50 %	50 %	0 %	170079584
45	NC_010480	CAAA	2	8	28233	28240	75 %	0 %	0 %	25 %	170079584
46	NC_010480	CCGA	2	8	28852	28859	25 %	0 %	25 %	50 %	170079584
47	NC_010480	AACT	2	8	29144	29151	50 %	25 %	0 %	25 %	170079584
48	NC_010480	CGCC	2	8	29307	29314	0 %	0 %	25 %	75 %	170079584
49	NC_010480	TCAA	2	8	29621	29628	50 %	25 %	0 %	25 %	170079584
50	NC_010480	GTGA	2	8	29908	29915	25 %	25 %	50 %	0 %	170079584
51	NC_010480	GATG	2	8	30846	30853	25 %	25 %	50 %	0 %	170079584
52	NC_010480	CAAA	2	8	30971	30978	75 %	0 %	0 %	25 %	170079584
53	NC_010480	CTCC	2	8	30983	30990	0 %	25 %	0 %	75 %	170079584
54	NC_010480	TCTG	2	8	31544	31551	0 %	50 %	25 %	25 %	170079585
55	NC_010480	CATA	2	8	33178	33185	50 %	25 %	0 %	25 %	170079587
56	NC_010480	AATC	2	8	33331	33338	50 %	25 %	0 %	25 %	170079587
57	NC_010480	TTGA	2	8	33946	33953	25 %	50 %	25 %	0 %	170079588
58	NC_010480	AGCC	2	8	34360	34367	25 %	0 %	25 %	50 %	170079588
59	NC_010480	TTGA	2	8	34891	34898	25 %	50 %	25 %	0 %	170079588
60	NC_010480	ATCT	2	8	35761	35768	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010480	CAAC	2	8	36346	36353	50 %	0 %	0 %	50 %	170079590
62	NC_010480	CAGT	2	8	36575	36582	25 %	25 %	25 %	25 %	170079590
63	NC_010480	GCCG	2	8	37205	37212	0 %	0 %	50 %	50 %	170079591
64	NC_010480	AATT	2	8	37786	37793	50 %	50 %	0 %	0 %	170079591
65	NC_010480	AGGC	2	8	38034	38041	25 %	0 %	50 %	25 %	170079592
66	NC_010480	ATAA	2	8	38124	38131	75 %	25 %	0 %	0 %	170079592
67	NC_010480	TAAA	2	8	39146	39153	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010480	TGTT	2	8	39666	39673	0 %	75 %	25 %	0 %	170079593
69	NC_010480	ATAG	2	8	40089	40096	50 %	25 %	25 %	0 %	170079594
70	NC_010480	GTTG	2	8	40140	40147	0 %	50 %	50 %	0 %	170079594
71	NC_010480	CTGT	2	8	40494	40501	0 %	50 %	25 %	25 %	170079594
72	NC_010480	CGAT	2	8	41277	41284	25 %	25 %	25 %	25 %	170079595
73	NC_010480	CAAG	2	8	41680	41687	50 %	0 %	25 %	25 %	170079595
74	NC_010480	GATT	2	8	42304	42311	25 %	50 %	25 %	0 %	170079595
75	NC_010480	TGCA	2	8	42775	42782	25 %	25 %	25 %	25 %	170079595
76	NC_010480	TGCT	2	8	43128	43135	0 %	50 %	25 %	25 %	170079596
77	NC_010480	GCTG	2	8	43178	43185	0 %	25 %	50 %	25 %	170079596
78	NC_010480	TGCT	2	8	43331	43338	0 %	50 %	25 %	25 %	170079596
79	NC_010480	TTGC	2	8	43344	43351	0 %	50 %	25 %	25 %	170079596
80	NC_010480	TGTT	2	8	43477	43484	0 %	75 %	25 %	0 %	170079596
81	NC_010480	GTTG	2	8	44064	44071	0 %	50 %	50 %	0 %	170079596
82	NC_010480	CTCC	2	8	44564	44571	0 %	25 %	0 %	75 %	170079597
83	NC_010480	AAAC	2	8	44983	44990	75 %	0 %	0 %	25 %	170079597
84	NC_010480	GATC	2	8	46304	46311	25 %	25 %	25 %	25 %	170079597
85	NC_010480	CTGA	2	8	46733	46740	25 %	25 %	25 %	25 %	170079598
86	NC_010480	TGGC	2	8	47065	47072	0 %	25 %	50 %	25 %	170079599
87	NC_010480	AGAT	2	8	47356	47363	50 %	25 %	25 %	0 %	170079599
88	NC_010480	GGAA	2	8	47484	47491	50 %	0 %	50 %	0 %	170079599
89	NC_010480	GCAG	2	8	48543	48550	25 %	0 %	50 %	25 %	170079600
90	NC_010480	TGGG	2	8	48832	48839	0 %	25 %	75 %	0 %	170079600
91	NC_010480	TCTT	2	8	49311	49318	0 %	75 %	0 %	25 %	170079601
92	NC_010480	TTTC	2	8	49319	49326	0 %	75 %	0 %	25 %	170079601
93	NC_010480	AGCC	2	8	49995	50002	25 %	0 %	25 %	50 %	170079601
94	NC_010480	TCGG	2	8	50244	50251	0 %	25 %	50 %	25 %	170079601
95	NC_010480	CTGC	2	8	50556	50563	0 %	25 %	25 %	50 %	170079601
96	NC_010480	AGCC	2	8	50790	50797	25 %	0 %	25 %	50 %	170079601
97	NC_010480	GTTT	2	8	50825	50832	0 %	75 %	25 %	0 %	170079601
98	NC_010480	CTTC	2	8	50866	50873	0 %	50 %	0 %	50 %	170079601
99	NC_010480	GCTG	2	8	51671	51678	0 %	25 %	50 %	25 %	170079601
100	NC_010480	CTCG	2	8	51746	51753	0 %	25 %	25 %	50 %	170079601
101	NC_010480	CAAG	2	8	51780	51787	50 %	0 %	25 %	25 %	170079601
102	NC_010480	TTGC	2	8	51871	51878	0 %	50 %	25 %	25 %	170079601
103	NC_010480	ACAA	2	8	52762	52769	75 %	0 %	0 %	25 %	170079604
104	NC_010480	GTTT	2	8	52875	52882	0 %	75 %	25 %	0 %	170079604
105	NC_010480	GTTC	2	8	53721	53728	0 %	50 %	25 %	25 %	170079605
106	NC_010480	GAAG	2	8	54413	54420	50 %	0 %	50 %	0 %	170079606
107	NC_010480	TGCG	2	8	56783	56790	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_010480	ACCT	2	8	57399	57406	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_010480	ACCT	2	8	58036	58043	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010480	AGAT	2	8	58978	58985	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010480	ATTG	2	8	59793	59800	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010480	CTAA	2	8	60859	60866	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_010480	GATA	2	8	61950	61957	50 %	25 %	25 %	0 %	170079607
114	NC_010480	AGAC	2	8	62895	62902	50 %	0 %	25 %	25 %	170079608
115	NC_010480	TGAT	2	8	63060	63067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010480	ATTT	3	12	63220	63231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010480	AGCA	2	8	63508	63515	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010480	GACC	2	8	64280	64287	25 %	0 %	25 %	50 %	170079609
119	NC_010480	TAAA	2	8	64573	64580	75 %	25 %	0 %	0 %	170079609
120	NC_010480	ATCC	2	8	64841	64848	25 %	25 %	0 %	50 %	170079609
121	NC_010480	CAAT	2	8	65046	65053	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010480	CTTA	2	8	65260	65267	25 %	50 %	0 %	25 %	170079610
123	NC_010480	AGTG	2	8	66684	66691	25 %	25 %	50 %	0 %	170079611
124	NC_010480	ACAA	2	8	68183	68190	75 %	0 %	0 %	25 %	170079612
125	NC_010480	GATG	2	8	68463	68470	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010480	GACG	2	8	68479	68486	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_010480	TCTG	2	8	68822	68829	0 %	50 %	25 %	25 %	170079613
128	NC_010480	AATA	2	8	69162	69169	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010480	GTCC	2	8	69752	69759	0 %	25 %	25 %	50 %	170079614
130	NC_010480	TGGA	2	8	70059	70066	25 %	25 %	50 %	0 %	170079615
131	NC_010480	CAAA	2	8	70478	70485	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_010480	ATCA	2	8	70663	70670	50 %	25 %	0 %	25 %	170079616
133	NC_010480	TCAG	2	8	71169	71176	25 %	25 %	25 %	25 %	170079617
134	NC_010480	AGCG	2	8	71245	71252	25 %	0 %	50 %	25 %	170079617
135	NC_010480	GTTT	3	12	71583	71594	0 %	75 %	25 %	0 %	170079618
136	NC_010480	ATTG	2	8	72991	72998	25 %	50 %	25 %	0 %	170079618
137	NC_010480	TTCT	2	8	73659	73666	0 %	75 %	0 %	25 %	170079618
138	NC_010480	TGAT	2	8	73823	73830	25 %	50 %	25 %	0 %	170079618
139	NC_010480	AGAT	2	8	74020	74027	50 %	25 %	25 %	0 %	170079618
140	NC_010480	ATTT	2	8	74544	74551	25 %	75 %	0 %	0 %	170079618
141	NC_010480	GCTT	2	8	74813	74820	0 %	50 %	25 %	25 %	170079618
142	NC_010480	TTAA	2	8	74909	74916	50 %	50 %	0 %	0 %	170079618
143	NC_010480	TTTC	2	8	75293	75300	0 %	75 %	0 %	25 %	170079618
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.