MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ6

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010480	GGAT	2	8	3579	3586	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010480	GTTG	2	8	12951	12958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010480	AATG	2	8	13186	13193	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010480	TTTA	2	8	15346	15353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010480	TTAA	2	8	16069	16076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010480	CAGG	2	8	16220	16227	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010480	TTTA	2	8	20453	20460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010480	CAAC	2	8	20538	20545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010480	GATA	2	8	21440	21447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010480	ATCT	2	8	35761	35768	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010480	TAAA	2	8	39146	39153	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010480	TGCG	2	8	56783	56790	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010480	ACCT	2	8	57399	57406	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010480	ACCT	2	8	58036	58043	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010480	AGAT	2	8	58978	58985	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010480	ATTG	2	8	59793	59800	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010480	CTAA	2	8	60859	60866	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010480	TGAT	2	8	63060	63067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010480	ATTT	3	12	63220	63231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010480	AGCA	2	8	63508	63515	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010480	CAAT	2	8	65046	65053	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010480	GATG	2	8	68463	68470	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010480	GACG	2	8	68479	68486	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010480	AATA	2	8	69162	69169	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010480	CAAA	2	8	70478	70485	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010480	TCTT	2	8	77253	77260	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010480	CAGG	2	8	77919	77926	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010480	CATT	2	8	81421	81428	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010480	TGGT	2	8	87059	87066	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010480	TTTA	2	8	91587	91594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010480	ATGA	2	8	91679	91686	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010480	CCTG	2	8	92503	92510	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010480	CGGT	2	8	101575	101582	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010480	AGCG	2	8	101734	101741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010480	AATT	2	8	112317	112324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010480	TTTG	2	8	112831	112838	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010480	GTCT	2	8	114046	114053	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010480	GGCT	2	8	116566	116573	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010480	CTTG	2	8	121536	121543	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010480	TTAC	2	8	121563	121570	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.