MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ6

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010480	TC	3	6	1333	1338	0 %	50 %	0 %	50 %	170079555
2	NC_010480	TG	3	6	3728	3733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010480	TC	3	6	4406	4411	0 %	50 %	0 %	50 %	170079557
4	NC_010480	AG	3	6	5104	5109	50 %	0 %	50 %	0 %	170079559
5	NC_010480	GC	3	6	5493	5498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010480	AG	4	8	5501	5508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010480	TC	3	6	6462	6467	0 %	50 %	0 %	50 %	170079560
8	NC_010480	GA	3	6	6581	6586	50 %	0 %	50 %	0 %	170079560
9	NC_010480	GA	3	6	7615	7620	50 %	0 %	50 %	0 %	170079560
10	NC_010480	TC	3	6	9784	9789	0 %	50 %	0 %	50 %	170079561
11	NC_010480	TC	3	6	10692	10697	0 %	50 %	0 %	50 %	170079561
12	NC_010480	TG	3	6	13086	13091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010480	CT	3	6	13642	13647	0 %	50 %	0 %	50 %	170079567
14	NC_010480	AG	3	6	15030	15035	50 %	0 %	50 %	0 %	170079568
15	NC_010480	CG	3	6	15432	15437	0 %	0 %	50 %	50 %	170079569
16	NC_010480	TA	3	6	16099	16104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010480	GA	3	6	16446	16451	50 %	0 %	50 %	0 %	170079570
18	NC_010480	AC	3	6	19576	19581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010480	GA	3	6	19723	19728	50 %	0 %	50 %	0 %	170079571
20	NC_010480	GA	3	6	20074	20079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010480	TC	4	8	21581	21588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010480	AC	3	6	22412	22417	50 %	0 %	0 %	50 %	170079575
23	NC_010480	AT	3	6	23394	23399	50 %	50 %	0 %	0 %	170079575
24	NC_010480	TG	3	6	23601	23606	0 %	50 %	50 %	0 %	170079575
25	NC_010480	GC	3	6	24666	24671	0 %	0 %	50 %	50 %	170079575
26	NC_010480	AG	3	6	26034	26039	50 %	0 %	50 %	0 %	170079578
27	NC_010480	AT	4	8	27822	27829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010480	TA	3	6	27836	27841	50 %	50 %	0 %	0 %	170079584
29	NC_010480	CT	3	6	27849	27854	0 %	50 %	0 %	50 %	170079584
30	NC_010480	AC	3	6	28541	28546	50 %	0 %	0 %	50 %	170079584
31	NC_010480	CA	3	6	28704	28709	50 %	0 %	0 %	50 %	170079584
32	NC_010480	TC	3	6	31452	31457	0 %	50 %	0 %	50 %	170079585
33	NC_010480	GA	4	8	31815	31822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010480	TC	4	8	31844	31851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010480	TG	3	6	32712	32717	0 %	50 %	50 %	0 %	170079586
36	NC_010480	TC	3	6	33741	33746	0 %	50 %	0 %	50 %	170079588
37	NC_010480	CT	3	6	34415	34420	0 %	50 %	0 %	50 %	170079588
38	NC_010480	TG	3	6	34681	34686	0 %	50 %	50 %	0 %	170079588
39	NC_010480	TC	3	6	34782	34787	0 %	50 %	0 %	50 %	170079588
40	NC_010480	GA	3	6	35511	35516	50 %	0 %	50 %	0 %	170079589
41	NC_010480	AT	3	6	42786	42791	50 %	50 %	0 %	0 %	170079595
42	NC_010480	CA	3	6	44426	44431	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010480	GA	3	6	45761	45766	50 %	0 %	50 %	0 %	170079597
44	NC_010480	CT	3	6	46082	46087	0 %	50 %	0 %	50 %	170079597
45	NC_010480	AG	3	6	47935	47940	50 %	0 %	50 %	0 %	170079600
46	NC_010480	TC	3	6	49325	49330	0 %	50 %	0 %	50 %	170079601
47	NC_010480	AT	3	6	52082	52087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010480	CT	3	6	53471	53476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010480	CA	3	6	54274	54279	50 %	0 %	0 %	50 %	170079606
50	NC_010480	GC	3	6	54490	54495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010480	GA	3	6	54581	54586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010480	GA	3	6	55469	55474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010480	TA	3	6	56015	56020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010480	TG	3	6	58448	58453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010480	GA	3	6	60043	60048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010480	AG	3	6	60260	60265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010480	GA	3	6	61325	61330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010480	GA	4	8	61537	61544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010480	CA	3	6	62675	62680	50 %	0 %	0 %	50 %	170079607
60	NC_010480	AC	3	6	64319	64324	50 %	0 %	0 %	50 %	170079609
61	NC_010480	AT	3	6	64808	64813	50 %	50 %	0 %	0 %	170079609
62	NC_010480	GT	3	6	66708	66713	0 %	50 %	50 %	0 %	170079611
63	NC_010480	GT	3	6	68472	68477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010480	AG	3	6	68665	68670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010480	CT	3	6	70587	70592	0 %	50 %	0 %	50 %	170079616
66	NC_010480	AG	3	6	71655	71660	50 %	0 %	50 %	0 %	170079618
67	NC_010480	AG	3	6	71758	71763	50 %	0 %	50 %	0 %	170079618
68	NC_010480	CT	3	6	71901	71906	0 %	50 %	0 %	50 %	170079618
69	NC_010480	AG	3	6	71910	71915	50 %	0 %	50 %	0 %	170079618
70	NC_010480	AT	3	6	72533	72538	50 %	50 %	0 %	0 %	170079618
71	NC_010480	CT	3	6	72939	72944	0 %	50 %	0 %	50 %	170079618
72	NC_010480	TC	4	8	73246	73253	0 %	50 %	0 %	50 %	170079618
73	NC_010480	CT	3	6	73467	73472	0 %	50 %	0 %	50 %	170079618
74	NC_010480	CT	3	6	73856	73861	0 %	50 %	0 %	50 %	170079618
75	NC_010480	TA	3	6	74262	74267	50 %	50 %	0 %	0 %	170079618
76	NC_010480	TA	3	6	74349	74354	50 %	50 %	0 %	0 %	170079618
77	NC_010480	TC	3	6	76209	76214	0 %	50 %	0 %	50 %	170079619
78	NC_010480	GA	3	6	77997	78002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010480	CT	3	6	79800	79805	0 %	50 %	0 %	50 %	170079622
80	NC_010480	TC	3	6	80006	80011	0 %	50 %	0 %	50 %	170079623
81	NC_010480	TC	3	6	80292	80297	0 %	50 %	0 %	50 %	170079623
82	NC_010480	CT	3	6	81328	81333	0 %	50 %	0 %	50 %	170079624
83	NC_010480	TA	3	6	82074	82079	50 %	50 %	0 %	0 %	170079625
84	NC_010480	TA	3	6	82212	82217	50 %	50 %	0 %	0 %	170079625
85	NC_010480	GA	3	6	82946	82951	50 %	0 %	50 %	0 %	170079625
86	NC_010480	AG	3	6	83567	83572	50 %	0 %	50 %	0 %	170079625
87	NC_010480	CT	4	8	84533	84540	0 %	50 %	0 %	50 %	170079625
88	NC_010480	TC	3	6	84921	84926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010480	TA	3	6	85487	85492	50 %	50 %	0 %	0 %	170079626
90	NC_010480	CA	3	6	86144	86149	50 %	0 %	0 %	50 %	170079626
91	NC_010480	TC	3	6	87140	87145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010480	TG	3	6	88032	88037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010480	CT	3	6	88699	88704	0 %	50 %	0 %	50 %	170079630
94	NC_010480	AT	3	6	91983	91988	50 %	50 %	0 %	0 %	170079632
95	NC_010480	CA	3	6	92684	92689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010480	CA	3	6	92935	92940	50 %	0 %	0 %	50 %	170079634
97	NC_010480	TA	3	6	93107	93112	50 %	50 %	0 %	0 %	170079634
98	NC_010480	TC	3	6	96315	96320	0 %	50 %	0 %	50 %	170079639
99	NC_010480	CT	3	6	96750	96755	0 %	50 %	0 %	50 %	170079639
100	NC_010480	TC	3	6	101362	101367	0 %	50 %	0 %	50 %	170079639
101	NC_010480	CT	3	6	102348	102353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010480	AT	3	6	102908	102913	50 %	50 %	0 %	0 %	170079642
103	NC_010480	CA	3	6	103581	103586	50 %	0 %	0 %	50 %	170079642
104	NC_010480	TA	3	6	103611	103616	50 %	50 %	0 %	0 %	170079642
105	NC_010480	CA	3	6	104801	104806	50 %	0 %	0 %	50 %	170079642
106	NC_010480	AC	3	6	104891	104896	50 %	0 %	0 %	50 %	170079642
107	NC_010480	CA	3	6	105028	105033	50 %	0 %	0 %	50 %	170079642
108	NC_010480	AG	3	6	105205	105210	50 %	0 %	50 %	0 %	170079642
109	NC_010480	GA	3	6	105852	105857	50 %	0 %	50 %	0 %	170079642
110	NC_010480	CT	3	6	106053	106058	0 %	50 %	0 %	50 %	170079643
111	NC_010480	TC	3	6	108003	108008	0 %	50 %	0 %	50 %	170079646
112	NC_010480	CA	3	6	108936	108941	50 %	0 %	0 %	50 %	170079645
113	NC_010480	GT	3	6	109256	109261	0 %	50 %	50 %	0 %	170079645
114	NC_010480	CT	3	6	109465	109470	0 %	50 %	0 %	50 %	170079645
115	NC_010480	TC	5	10	110059	110068	0 %	50 %	0 %	50 %	170079645
116	NC_010480	AT	3	6	111283	111288	50 %	50 %	0 %	0 %	170079645
117	NC_010480	AT	3	6	111309	111314	50 %	50 %	0 %	0 %	170079645
118	NC_010480	GA	3	6	111752	111757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010480	CT	4	8	114409	114416	0 %	50 %	0 %	50 %	170079651
120	NC_010480	TA	3	6	117140	117145	50 %	50 %	0 %	0 %	170079655
121	NC_010480	TC	3	6	117867	117872	0 %	50 %	0 %	50 %	170079656
122	NC_010480	AC	3	6	118235	118240	50 %	0 %	0 %	50 %	170079656
123	NC_010480	TC	3	6	121556	121561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_010480	TC	3	6	121947	121952	0 %	50 %	0 %	50 %	170079658
125	NC_010480	CT	3	6	122038	122043	0 %	50 %	0 %	50 %	170079658
126	NC_010480	TC	3	6	122208	122213	0 %	50 %	0 %	50 %	170079658
127	NC_010480	CA	3	6	122477	122482	50 %	0 %	0 %	50 %	170079658
128	NC_010480	AG	3	6	123606	123611	50 %	0 %	50 %	0 %	170079660

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.