MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ6

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010480	TC	3	6	1333	1338	0 %	50 %	0 %	50 %	170079555
2	NC_010480	TC	3	6	4406	4411	0 %	50 %	0 %	50 %	170079557
3	NC_010480	AG	3	6	5104	5109	50 %	0 %	50 %	0 %	170079559
4	NC_010480	TC	3	6	6462	6467	0 %	50 %	0 %	50 %	170079560
5	NC_010480	GA	3	6	6581	6586	50 %	0 %	50 %	0 %	170079560
6	NC_010480	GA	3	6	7615	7620	50 %	0 %	50 %	0 %	170079560
7	NC_010480	TC	3	6	9784	9789	0 %	50 %	0 %	50 %	170079561
8	NC_010480	TC	3	6	10692	10697	0 %	50 %	0 %	50 %	170079561
9	NC_010480	CT	3	6	13642	13647	0 %	50 %	0 %	50 %	170079567
10	NC_010480	AG	3	6	15030	15035	50 %	0 %	50 %	0 %	170079568
11	NC_010480	CG	3	6	15432	15437	0 %	0 %	50 %	50 %	170079569
12	NC_010480	GA	3	6	16446	16451	50 %	0 %	50 %	0 %	170079570
13	NC_010480	GA	3	6	19723	19728	50 %	0 %	50 %	0 %	170079571
14	NC_010480	AC	3	6	22412	22417	50 %	0 %	0 %	50 %	170079575
15	NC_010480	AT	3	6	23394	23399	50 %	50 %	0 %	0 %	170079575
16	NC_010480	TG	3	6	23601	23606	0 %	50 %	50 %	0 %	170079575
17	NC_010480	GC	3	6	24666	24671	0 %	0 %	50 %	50 %	170079575
18	NC_010480	AG	3	6	26034	26039	50 %	0 %	50 %	0 %	170079578
19	NC_010480	TA	3	6	27836	27841	50 %	50 %	0 %	0 %	170079584
20	NC_010480	CT	3	6	27849	27854	0 %	50 %	0 %	50 %	170079584
21	NC_010480	AC	3	6	28541	28546	50 %	0 %	0 %	50 %	170079584
22	NC_010480	CA	3	6	28704	28709	50 %	0 %	0 %	50 %	170079584
23	NC_010480	TC	3	6	31452	31457	0 %	50 %	0 %	50 %	170079585
24	NC_010480	TG	3	6	32712	32717	0 %	50 %	50 %	0 %	170079586
25	NC_010480	TC	3	6	33741	33746	0 %	50 %	0 %	50 %	170079588
26	NC_010480	CT	3	6	34415	34420	0 %	50 %	0 %	50 %	170079588
27	NC_010480	TG	3	6	34681	34686	0 %	50 %	50 %	0 %	170079588
28	NC_010480	TC	3	6	34782	34787	0 %	50 %	0 %	50 %	170079588
29	NC_010480	GA	3	6	35511	35516	50 %	0 %	50 %	0 %	170079589
30	NC_010480	AT	3	6	42786	42791	50 %	50 %	0 %	0 %	170079595
31	NC_010480	GA	3	6	45761	45766	50 %	0 %	50 %	0 %	170079597
32	NC_010480	CT	3	6	46082	46087	0 %	50 %	0 %	50 %	170079597
33	NC_010480	AG	3	6	47935	47940	50 %	0 %	50 %	0 %	170079600
34	NC_010480	TC	3	6	49325	49330	0 %	50 %	0 %	50 %	170079601
35	NC_010480	CA	3	6	54274	54279	50 %	0 %	0 %	50 %	170079606
36	NC_010480	CA	3	6	62675	62680	50 %	0 %	0 %	50 %	170079607
37	NC_010480	AC	3	6	64319	64324	50 %	0 %	0 %	50 %	170079609
38	NC_010480	AT	3	6	64808	64813	50 %	50 %	0 %	0 %	170079609
39	NC_010480	GT	3	6	66708	66713	0 %	50 %	50 %	0 %	170079611
40	NC_010480	CT	3	6	70587	70592	0 %	50 %	0 %	50 %	170079616
41	NC_010480	AG	3	6	71655	71660	50 %	0 %	50 %	0 %	170079618
42	NC_010480	AG	3	6	71758	71763	50 %	0 %	50 %	0 %	170079618
43	NC_010480	CT	3	6	71901	71906	0 %	50 %	0 %	50 %	170079618
44	NC_010480	AG	3	6	71910	71915	50 %	0 %	50 %	0 %	170079618
45	NC_010480	AT	3	6	72533	72538	50 %	50 %	0 %	0 %	170079618
46	NC_010480	CT	3	6	72939	72944	0 %	50 %	0 %	50 %	170079618
47	NC_010480	TC	4	8	73246	73253	0 %	50 %	0 %	50 %	170079618
48	NC_010480	CT	3	6	73467	73472	0 %	50 %	0 %	50 %	170079618
49	NC_010480	CT	3	6	73856	73861	0 %	50 %	0 %	50 %	170079618
50	NC_010480	TA	3	6	74262	74267	50 %	50 %	0 %	0 %	170079618
51	NC_010480	TA	3	6	74349	74354	50 %	50 %	0 %	0 %	170079618
52	NC_010480	TC	3	6	76209	76214	0 %	50 %	0 %	50 %	170079619
53	NC_010480	CT	3	6	79800	79805	0 %	50 %	0 %	50 %	170079622
54	NC_010480	TC	3	6	80006	80011	0 %	50 %	0 %	50 %	170079623
55	NC_010480	TC	3	6	80292	80297	0 %	50 %	0 %	50 %	170079623
56	NC_010480	CT	3	6	81328	81333	0 %	50 %	0 %	50 %	170079624
57	NC_010480	TA	3	6	82074	82079	50 %	50 %	0 %	0 %	170079625
58	NC_010480	TA	3	6	82212	82217	50 %	50 %	0 %	0 %	170079625
59	NC_010480	GA	3	6	82946	82951	50 %	0 %	50 %	0 %	170079625
60	NC_010480	AG	3	6	83567	83572	50 %	0 %	50 %	0 %	170079625
61	NC_010480	CT	4	8	84533	84540	0 %	50 %	0 %	50 %	170079625
62	NC_010480	TA	3	6	85487	85492	50 %	50 %	0 %	0 %	170079626
63	NC_010480	CA	3	6	86144	86149	50 %	0 %	0 %	50 %	170079626
64	NC_010480	CT	3	6	88699	88704	0 %	50 %	0 %	50 %	170079630
65	NC_010480	AT	3	6	91983	91988	50 %	50 %	0 %	0 %	170079632
66	NC_010480	CA	3	6	92935	92940	50 %	0 %	0 %	50 %	170079634
67	NC_010480	TA	3	6	93107	93112	50 %	50 %	0 %	0 %	170079634
68	NC_010480	TC	3	6	96315	96320	0 %	50 %	0 %	50 %	170079639
69	NC_010480	CT	3	6	96750	96755	0 %	50 %	0 %	50 %	170079639
70	NC_010480	TC	3	6	101362	101367	0 %	50 %	0 %	50 %	170079639
71	NC_010480	AT	3	6	102908	102913	50 %	50 %	0 %	0 %	170079642
72	NC_010480	CA	3	6	103581	103586	50 %	0 %	0 %	50 %	170079642
73	NC_010480	TA	3	6	103611	103616	50 %	50 %	0 %	0 %	170079642
74	NC_010480	CA	3	6	104801	104806	50 %	0 %	0 %	50 %	170079642
75	NC_010480	AC	3	6	104891	104896	50 %	0 %	0 %	50 %	170079642
76	NC_010480	CA	3	6	105028	105033	50 %	0 %	0 %	50 %	170079642
77	NC_010480	AG	3	6	105205	105210	50 %	0 %	50 %	0 %	170079642
78	NC_010480	GA	3	6	105852	105857	50 %	0 %	50 %	0 %	170079642
79	NC_010480	CT	3	6	106053	106058	0 %	50 %	0 %	50 %	170079643
80	NC_010480	TC	3	6	108003	108008	0 %	50 %	0 %	50 %	170079646
81	NC_010480	CA	3	6	108936	108941	50 %	0 %	0 %	50 %	170079645
82	NC_010480	GT	3	6	109256	109261	0 %	50 %	50 %	0 %	170079645
83	NC_010480	CT	3	6	109465	109470	0 %	50 %	0 %	50 %	170079645
84	NC_010480	TC	5	10	110059	110068	0 %	50 %	0 %	50 %	170079645
85	NC_010480	AT	3	6	111283	111288	50 %	50 %	0 %	0 %	170079645
86	NC_010480	AT	3	6	111309	111314	50 %	50 %	0 %	0 %	170079645
87	NC_010480	CT	4	8	114409	114416	0 %	50 %	0 %	50 %	170079651
88	NC_010480	TA	3	6	117140	117145	50 %	50 %	0 %	0 %	170079655
89	NC_010480	TC	3	6	117867	117872	0 %	50 %	0 %	50 %	170079656
90	NC_010480	AC	3	6	118235	118240	50 %	0 %	0 %	50 %	170079656
91	NC_010480	TC	3	6	121947	121952	0 %	50 %	0 %	50 %	170079658
92	NC_010480	CT	3	6	122038	122043	0 %	50 %	0 %	50 %	170079658
93	NC_010480	TC	3	6	122208	122213	0 %	50 %	0 %	50 %	170079658
94	NC_010480	CA	3	6	122477	122482	50 %	0 %	0 %	50 %	170079658
95	NC_010480	AG	3	6	123606	123611	50 %	0 %	50 %	0 %	170079660

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.