MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ5

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010479	GCGGGA	2	12	29	40	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	170079514
2	NC_010479	GGCGAT	2	12	7431	7442	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	170079525
3	NC_010479	CCTGAA	2	12	10773	10784	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	170079529
4	NC_010479	ATTTGT	2	12	14195	14206	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	170079532
5	NC_010479	GGTGAT	2	12	15438	15449	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	170079535
6	NC_010479	CAACAG	2	12	15496	15507	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	170079535
7	NC_010479	AATTAG	2	12	15821	15832	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170079535
8	NC_010479	GCCCAG	2	12	15994	16005	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	170079535
9	NC_010479	AAATCC	2	12	16488	16499	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	170079536
10	NC_010479	TAAAAA	2	12	19359	19370	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010479	AATATA	2	12	21044	21055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079540
12	NC_010479	TATGAT	2	12	26529	26540	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	170079546
13	NC_010479	AGTTGG	2	12	29644	29655	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	170079548
14	NC_010479	GGAAGG	2	12	33512	33523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079551
15	NC_010479	TTTGAA	2	12	34426	34437	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	170079551
16	NC_010479	CCGGAG	2	12	35957	35968	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	170079551
17	NC_010479	CAAAGG	2	12	36066	36077	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	170079551
18	NC_010479	TAAAAA	2	12	36313	36324	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170079552
19	NC_010479	AGAAAA	2	12	37624	37635	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	170079552

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.