MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ5

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010479	TCCAG	2	10	312	321	20 %	20 %	20 %	40 %	170079514
2	NC_010479	CTTGC	2	10	3276	3285	0 %	40 %	20 %	40 %	170079518
3	NC_010479	GAACC	2	10	4158	4167	40 %	0 %	20 %	40 %	170079519
4	NC_010479	CTGCC	2	10	4629	4638	0 %	20 %	20 %	60 %	170079521
5	NC_010479	CAGTC	2	10	9064	9073	20 %	20 %	20 %	40 %	170079527
6	NC_010479	ACCGT	2	10	10499	10508	20 %	20 %	20 %	40 %	170079529
7	NC_010479	GCCTT	2	10	10597	10606	0 %	40 %	20 %	40 %	170079529
8	NC_010479	GCAAG	2	10	11423	11432	40 %	0 %	40 %	20 %	170079530
9	NC_010479	TCTAT	2	10	12820	12829	20 %	60 %	0 %	20 %	170079531
10	NC_010479	TCTGT	2	10	12836	12845	0 %	60 %	20 %	20 %	170079531
11	NC_010479	TTGAC	2	10	14102	14111	20 %	40 %	20 %	20 %	170079532
12	NC_010479	GCCAA	2	10	14682	14691	40 %	0 %	20 %	40 %	170079533
13	NC_010479	CATCC	2	10	18032	18041	20 %	20 %	0 %	60 %	170079538
14	NC_010479	CTTTA	2	10	19665	19674	20 %	60 %	0 %	20 %	170079539
15	NC_010479	GCGTC	2	10	24577	24586	0 %	20 %	40 %	40 %	170079543
16	NC_010479	AAATA	2	10	25222	25231	80 %	20 %	0 %	0 %	170079544
17	NC_010479	GTCTG	2	10	25530	25539	0 %	40 %	40 %	20 %	170079544
18	NC_010479	GCCAA	2	10	29619	29628	40 %	0 %	20 %	40 %	170079548
19	NC_010479	AGATG	2	10	30317	30326	40 %	20 %	40 %	0 %	170079548
20	NC_010479	TCTAT	2	10	36140	36149	20 %	60 %	0 %	20 %	170079551
21	NC_010479	AGATG	2	10	36862	36871	40 %	20 %	40 %	0 %	170079552
22	NC_010479	TTTTA	2	10	36986	36995	20 %	80 %	0 %	0 %	170079552

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.