MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ5

Total Repeats: 484

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010479	CGA	2	6	88	93	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079514
2	NC_010479	GAA	2	6	151	156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079514
3	NC_010479	GCC	2	6	159	164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079514
4	NC_010479	GCA	2	6	343	348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079514
5	NC_010479	TCA	2	6	410	415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079514
6	NC_010479	AAG	2	6	581	586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079514
7	NC_010479	GAA	2	6	641	646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079515
8	NC_010479	AGG	2	6	713	718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079515
9	NC_010479	TAC	2	6	734	739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079515
10	NC_010479	CAG	2	6	792	797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079515
11	NC_010479	GCA	2	6	883	888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079515
12	NC_010479	GAG	2	6	990	995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010479	AGG	2	6	1054	1059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010479	TAT	2	6	1116	1121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010479	TTG	2	6	1128	1133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010479	AGA	2	6	1157	1162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010479	TAA	2	6	1168	1173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010479	GCT	2	6	1176	1181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010479	CGC	2	6	1334	1339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_010479	GTC	2	6	1414	1419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010479	CAC	2	6	1522	1527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_010479	GCC	2	6	1573	1578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_010479	CCA	2	6	1602	1607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_010479	CCG	2	6	1716	1721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_010479	CCT	2	6	1753	1758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_010479	GGC	2	6	1859	1864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010479	TAG	2	6	1872	1877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010479	CTA	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010479	AGG	2	6	2557	2562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010479	AAC	2	6	2589	2594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010479	GAA	2	6	2713	2718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079516
32	NC_010479	CTG	2	6	2922	2927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079516
33	NC_010479	GGC	2	6	3003	3008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079517
34	NC_010479	TGT	2	6	3050	3055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079517
35	NC_010479	TTG	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079517
36	NC_010479	ACC	2	6	3091	3096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079517
37	NC_010479	ACA	2	6	3291	3296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079518
38	NC_010479	ACA	2	6	3342	3347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079518
39	NC_010479	TGC	2	6	3526	3531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079518
40	NC_010479	AGA	2	6	3616	3621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079518
41	NC_010479	ATG	2	6	3680	3685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079518
42	NC_010479	TTA	2	6	3726	3731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079518
43	NC_010479	ACT	2	6	3735	3740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079518
44	NC_010479	CCT	2	6	3811	3816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_010479	CAA	2	6	3911	3916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079519
46	NC_010479	AAG	2	6	4048	4053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079519
47	NC_010479	TGA	2	6	4175	4180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079519
48	NC_010479	AGC	2	6	4341	4346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079520
49	NC_010479	CAC	2	6	4393	4398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079520
50	NC_010479	AGA	2	6	4426	4431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079520
51	NC_010479	CCT	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079521
52	NC_010479	TCA	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010479	ACC	2	6	5052	5057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079522
54	NC_010479	AGC	2	6	5184	5189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010479	GAA	2	6	5337	5342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079523
56	NC_010479	ACT	2	6	5393	5398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079523
57	NC_010479	AGA	2	6	5402	5407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079523
58	NC_010479	GCA	2	6	5410	5415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079523
59	NC_010479	GCG	2	6	5478	5483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079523
60	NC_010479	TCG	2	6	5533	5538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010479	TAG	2	6	5540	5545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010479	AGC	2	6	5742	5747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079524
63	NC_010479	CCG	2	6	5762	5767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079524
64	NC_010479	AGA	2	6	6033	6038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079524
65	NC_010479	GAC	2	6	6085	6090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079524
66	NC_010479	GAC	2	6	6105	6110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079524
67	NC_010479	GAC	2	6	6125	6130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079524
68	NC_010479	CCT	2	6	6190	6195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079524
69	NC_010479	TGC	2	6	6324	6329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079524
70	NC_010479	CAA	2	6	6403	6408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079524
71	NC_010479	TTA	2	6	6451	6456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079524
72	NC_010479	GGA	2	6	6807	6812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010479	CGG	2	6	6845	6850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079525
74	NC_010479	ACC	3	9	6903	6911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079525
75	NC_010479	TTC	2	6	6978	6983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079525
76	NC_010479	CTA	2	6	7016	7021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079525
77	NC_010479	CAA	2	6	7026	7031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079525
78	NC_010479	TCA	2	6	7045	7050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079525
79	NC_010479	AAC	2	6	7250	7255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079525
80	NC_010479	CGC	2	6	7268	7273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079525
81	NC_010479	TAT	2	6	7313	7318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079525
82	NC_010479	GCG	2	6	7581	7586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079525
83	NC_010479	CAC	2	6	7611	7616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079525
84	NC_010479	CAA	2	6	7617	7622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079525
85	NC_010479	AGT	2	6	7645	7650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010479	CCG	2	6	7689	7694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_010479	CAT	2	6	7710	7715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010479	AAT	2	6	7928	7933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010479	AAC	3	9	8026	8034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079526
90	NC_010479	GTG	2	6	8144	8149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079526
91	NC_010479	ACT	2	6	8226	8231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079526
92	NC_010479	AAG	2	6	8691	8696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079527
93	NC_010479	CTA	2	6	8728	8733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079527
94	NC_010479	TCG	2	6	8855	8860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079527
95	NC_010479	AAG	2	6	8870	8875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079527
96	NC_010479	CAG	2	6	8946	8951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079527
97	NC_010479	ATG	2	6	8976	8981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079527
98	NC_010479	TGA	2	6	9025	9030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079527
99	NC_010479	TGA	2	6	9049	9054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079527
100	NC_010479	GAA	2	6	9238	9243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079527
101	NC_010479	TTC	2	6	9255	9260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079527
102	NC_010479	CGC	2	6	9326	9331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079527
103	NC_010479	CGC	2	6	9379	9384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079527
104	NC_010479	ATC	2	6	9445	9450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010479	CAT	2	6	9453	9458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010479	CCA	2	6	9468	9473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_010479	GCA	2	6	9572	9577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010479	ACA	2	6	9638	9643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079528
109	NC_010479	CGG	2	6	9677	9682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079528
110	NC_010479	GGA	2	6	9915	9920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079528
111	NC_010479	ATC	3	9	10078	10086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079528
112	NC_010479	CGG	2	6	10158	10163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079528
113	NC_010479	GGA	2	6	10302	10307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010479	ATG	2	6	10315	10320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079529
115	NC_010479	ATT	2	6	10336	10341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079529
116	NC_010479	CAC	2	6	10353	10358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079529
117	NC_010479	GTG	2	6	10384	10389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079529
118	NC_010479	ATT	2	6	10402	10407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079529
119	NC_010479	TGG	2	6	10445	10450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079529
120	NC_010479	TCT	2	6	10625	10630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079529
121	NC_010479	GCG	2	6	10707	10712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079529
122	NC_010479	AAT	2	6	10792	10797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079529
123	NC_010479	ATT	2	6	11020	11025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079529
124	NC_010479	TAA	2	6	11052	11057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079529
125	NC_010479	ATG	2	6	11090	11095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079529
126	NC_010479	TAT	2	6	11410	11415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010479	TTG	2	6	11467	11472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079530
128	NC_010479	AAG	2	6	11627	11632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010479	TGA	2	6	11673	11678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010479	GCA	2	6	11812	11817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010479	GAA	2	6	11934	11939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010479	AAG	2	6	11960	11965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010479	TTG	2	6	12120	12125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079531
134	NC_010479	TAT	2	6	12146	12151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079531
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