MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ5

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010479	CT	3	6	1307	1312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010479	CG	3	6	1420	1425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010479	AG	5	10	1876	1885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010479	TC	4	8	2416	2423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010479	TA	3	6	5634	5639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010479	CA	3	6	6143	6148	50 %	0 %	0 %	50 %	170079524
7	NC_010479	TA	3	6	6211	6216	50 %	50 %	0 %	0 %	170079524
8	NC_010479	AG	5	10	6243	6252	50 %	0 %	50 %	0 %	170079524
9	NC_010479	TC	3	6	6640	6645	0 %	50 %	0 %	50 %	170079524
10	NC_010479	GC	3	6	6933	6938	0 %	0 %	50 %	50 %	170079525
11	NC_010479	GA	3	6	7785	7790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010479	GC	3	6	8315	8320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010479	TA	3	6	11759	11764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010479	CT	3	6	12404	12409	0 %	50 %	0 %	50 %	170079531
15	NC_010479	AT	3	6	12412	12417	50 %	50 %	0 %	0 %	170079531
16	NC_010479	TA	3	6	12867	12872	50 %	50 %	0 %	0 %	170079531
17	NC_010479	AT	3	6	12941	12946	50 %	50 %	0 %	0 %	170079531
18	NC_010479	AT	3	6	13318	13323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010479	TA	4	8	13591	13598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010479	AG	3	6	15328	15333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010479	TC	3	6	16023	16028	0 %	50 %	0 %	50 %	170079535
22	NC_010479	CA	3	6	17005	17010	50 %	0 %	0 %	50 %	170079537
23	NC_010479	CG	3	6	17143	17148	0 %	0 %	50 %	50 %	170079537
24	NC_010479	CT	3	6	17450	17455	0 %	50 %	0 %	50 %	170079537
25	NC_010479	GA	3	6	17960	17965	50 %	0 %	50 %	0 %	170079538
26	NC_010479	GA	3	6	17986	17991	50 %	0 %	50 %	0 %	170079538
27	NC_010479	TA	3	6	18854	18859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010479	TC	3	6	18905	18910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010479	AT	4	8	19499	19506	50 %	50 %	0 %	0 %	170079539
30	NC_010479	TA	3	6	19544	19549	50 %	50 %	0 %	0 %	170079539
31	NC_010479	TA	4	8	20400	20407	50 %	50 %	0 %	0 %	170079539
32	NC_010479	AT	3	6	20412	20417	50 %	50 %	0 %	0 %	170079539
33	NC_010479	AT	3	6	20721	20726	50 %	50 %	0 %	0 %	170079540
34	NC_010479	AG	4	8	21242	21249	50 %	0 %	50 %	0 %	170079540
35	NC_010479	TA	3	6	21437	21442	50 %	50 %	0 %	0 %	170079541
36	NC_010479	AT	3	6	24493	24498	50 %	50 %	0 %	0 %	170079543
37	NC_010479	TC	3	6	24804	24809	0 %	50 %	0 %	50 %	170079543
38	NC_010479	GA	3	6	26103	26108	50 %	0 %	50 %	0 %	170079545
39	NC_010479	AT	3	6	26767	26772	50 %	50 %	0 %	0 %	170079546
40	NC_010479	GA	3	6	27341	27346	50 %	0 %	50 %	0 %	170079546
41	NC_010479	TA	4	8	28926	28933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010479	TG	3	6	31308	31313	0 %	50 %	50 %	0 %	170079548
43	NC_010479	GA	3	6	34352	34357	50 %	0 %	50 %	0 %	170079551
44	NC_010479	AG	3	6	35277	35282	50 %	0 %	50 %	0 %	170079551
45	NC_010479	CA	3	6	35343	35348	50 %	0 %	0 %	50 %	170079551
46	NC_010479	AT	3	6	36325	36330	50 %	50 %	0 %	0 %	170079552
47	NC_010479	TA	3	6	37256	37261	50 %	50 %	0 %	0 %	170079552
48	NC_010479	CA	3	6	37646	37651	50 %	0 %	0 %	50 %	170079552
49	NC_010479	TC	3	6	37655	37660	0 %	50 %	0 %	50 %	170079552

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.