MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ5

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010479	CA	3	6	6143	6148	50 %	0 %	0 %	50 %	170079524
2	NC_010479	TA	3	6	6211	6216	50 %	50 %	0 %	0 %	170079524
3	NC_010479	AG	5	10	6243	6252	50 %	0 %	50 %	0 %	170079524
4	NC_010479	TC	3	6	6640	6645	0 %	50 %	0 %	50 %	170079524
5	NC_010479	GC	3	6	6933	6938	0 %	0 %	50 %	50 %	170079525
6	NC_010479	CT	3	6	12404	12409	0 %	50 %	0 %	50 %	170079531
7	NC_010479	AT	3	6	12412	12417	50 %	50 %	0 %	0 %	170079531
8	NC_010479	TA	3	6	12867	12872	50 %	50 %	0 %	0 %	170079531
9	NC_010479	AT	3	6	12941	12946	50 %	50 %	0 %	0 %	170079531
10	NC_010479	TC	3	6	16023	16028	0 %	50 %	0 %	50 %	170079535
11	NC_010479	CA	3	6	17005	17010	50 %	0 %	0 %	50 %	170079537
12	NC_010479	CG	3	6	17143	17148	0 %	0 %	50 %	50 %	170079537
13	NC_010479	CT	3	6	17450	17455	0 %	50 %	0 %	50 %	170079537
14	NC_010479	GA	3	6	17960	17965	50 %	0 %	50 %	0 %	170079538
15	NC_010479	GA	3	6	17986	17991	50 %	0 %	50 %	0 %	170079538
16	NC_010479	AT	4	8	19499	19506	50 %	50 %	0 %	0 %	170079539
17	NC_010479	TA	3	6	19544	19549	50 %	50 %	0 %	0 %	170079539
18	NC_010479	TA	4	8	20400	20407	50 %	50 %	0 %	0 %	170079539
19	NC_010479	AT	3	6	20412	20417	50 %	50 %	0 %	0 %	170079539
20	NC_010479	AT	3	6	20721	20726	50 %	50 %	0 %	0 %	170079540
21	NC_010479	AG	4	8	21242	21249	50 %	0 %	50 %	0 %	170079540
22	NC_010479	TA	3	6	21437	21442	50 %	50 %	0 %	0 %	170079541
23	NC_010479	AT	3	6	24493	24498	50 %	50 %	0 %	0 %	170079543
24	NC_010479	TC	3	6	24804	24809	0 %	50 %	0 %	50 %	170079543
25	NC_010479	GA	3	6	26103	26108	50 %	0 %	50 %	0 %	170079545
26	NC_010479	AT	3	6	26767	26772	50 %	50 %	0 %	0 %	170079546
27	NC_010479	GA	3	6	27341	27346	50 %	0 %	50 %	0 %	170079546
28	NC_010479	TG	3	6	31308	31313	0 %	50 %	50 %	0 %	170079548
29	NC_010479	GA	3	6	34352	34357	50 %	0 %	50 %	0 %	170079551
30	NC_010479	AG	3	6	35277	35282	50 %	0 %	50 %	0 %	170079551
31	NC_010479	CA	3	6	35343	35348	50 %	0 %	0 %	50 %	170079551
32	NC_010479	AT	3	6	36325	36330	50 %	50 %	0 %	0 %	170079552
33	NC_010479	TA	3	6	37256	37261	50 %	50 %	0 %	0 %	170079552
34	NC_010479	CA	3	6	37646	37651	50 %	0 %	0 %	50 %	170079552
35	NC_010479	TC	3	6	37655	37660	0 %	50 %	0 %	50 %	170079552

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.