MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ5

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010479	A	6	6	628	633	100 %	0 %	0 %	0 %	170079514
2	NC_010479	A	6	6	801	806	100 %	0 %	0 %	0 %	170079515
3	NC_010479	G	6	6	1394	1399	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010479	T	7	7	1844	1850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010479	T	7	7	1918	1924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010479	T	6	6	2070	2075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010479	C	6	6	2576	2581	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_010479	C	6	6	3022	3027	0 %	0 %	0 %	100 %	170079517
9	NC_010479	A	6	6	5286	5291	100 %	0 %	0 %	0 %	170079523
10	NC_010479	A	8	8	5328	5335	100 %	0 %	0 %	0 %	170079523
11	NC_010479	T	6	6	5780	5785	0 %	100 %	0 %	0 %	170079524
12	NC_010479	A	6	6	6042	6047	100 %	0 %	0 %	0 %	170079524
13	NC_010479	A	6	6	6272	6277	100 %	0 %	0 %	0 %	170079524
14	NC_010479	A	6	6	6736	6741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010479	C	6	6	6772	6777	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_010479	A	6	6	8001	8006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010479	T	6	6	8399	8404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010479	T	6	6	8671	8676	0 %	100 %	0 %	0 %	170079527
19	NC_010479	A	7	7	9926	9932	100 %	0 %	0 %	0 %	170079528
20	NC_010479	T	6	6	10281	10286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010479	T	8	8	10457	10464	0 %	100 %	0 %	0 %	170079529
22	NC_010479	A	7	7	11646	11652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010479	T	7	7	11985	11991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010479	T	7	7	12065	12071	0 %	100 %	0 %	0 %	170079531
25	NC_010479	T	7	7	12481	12487	0 %	100 %	0 %	0 %	170079531
26	NC_010479	A	6	6	12500	12505	100 %	0 %	0 %	0 %	170079531
27	NC_010479	T	7	7	12694	12700	0 %	100 %	0 %	0 %	170079531
28	NC_010479	T	8	8	12978	12985	0 %	100 %	0 %	0 %	170079531
29	NC_010479	T	7	7	13027	13033	0 %	100 %	0 %	0 %	170079531
30	NC_010479	T	6	6	13035	13040	0 %	100 %	0 %	0 %	170079531
31	NC_010479	A	7	7	13344	13350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010479	T	7	7	14855	14861	0 %	100 %	0 %	0 %	170079534
33	NC_010479	T	6	6	15150	15155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010479	T	6	6	15355	15360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010479	C	6	6	15737	15742	0 %	0 %	0 %	100 %	170079535
36	NC_010479	A	7	7	16744	16750	100 %	0 %	0 %	0 %	170079536
37	NC_010479	T	6	6	17013	17018	0 %	100 %	0 %	0 %	170079537
38	NC_010479	T	6	6	17257	17262	0 %	100 %	0 %	0 %	170079537
39	NC_010479	T	6	6	17587	17592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010479	T	8	8	17932	17939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010479	T	6	6	18077	18082	0 %	100 %	0 %	0 %	170079538
42	NC_010479	C	6	6	18101	18106	0 %	0 %	0 %	100 %	170079538
43	NC_010479	T	6	6	18951	18956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010479	T	6	6	19140	19145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010479	T	8	8	19323	19330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010479	A	6	6	19401	19406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010479	A	6	6	19531	19536	100 %	0 %	0 %	0 %	170079539
48	NC_010479	A	6	6	19549	19554	100 %	0 %	0 %	0 %	170079539
49	NC_010479	T	6	6	19747	19752	0 %	100 %	0 %	0 %	170079539
50	NC_010479	T	8	8	20274	20281	0 %	100 %	0 %	0 %	170079539
51	NC_010479	A	6	6	20436	20441	100 %	0 %	0 %	0 %	170079539
52	NC_010479	A	6	6	20478	20483	100 %	0 %	0 %	0 %	170079540
53	NC_010479	A	8	8	20485	20492	100 %	0 %	0 %	0 %	170079540
54	NC_010479	T	6	6	20504	20509	0 %	100 %	0 %	0 %	170079540
55	NC_010479	A	6	6	20531	20536	100 %	0 %	0 %	0 %	170079540
56	NC_010479	A	6	6	20628	20633	100 %	0 %	0 %	0 %	170079540
57	NC_010479	A	7	7	20903	20909	100 %	0 %	0 %	0 %	170079540
58	NC_010479	A	6	6	20954	20959	100 %	0 %	0 %	0 %	170079540
59	NC_010479	A	6	6	20976	20981	100 %	0 %	0 %	0 %	170079540
60	NC_010479	T	7	7	21363	21369	0 %	100 %	0 %	0 %	170079541
61	NC_010479	A	7	7	21416	21422	100 %	0 %	0 %	0 %	170079541
62	NC_010479	A	6	6	21483	21488	100 %	0 %	0 %	0 %	170079541
63	NC_010479	A	6	6	21556	21561	100 %	0 %	0 %	0 %	170079541
64	NC_010479	A	6	6	21701	21706	100 %	0 %	0 %	0 %	170079541
65	NC_010479	T	7	7	22307	22313	0 %	100 %	0 %	0 %	170079541
66	NC_010479	A	6	6	22457	22462	100 %	0 %	0 %	0 %	170079541
67	NC_010479	A	6	6	22973	22978	100 %	0 %	0 %	0 %	170079541
68	NC_010479	A	6	6	23069	23074	100 %	0 %	0 %	0 %	170079541
69	NC_010479	C	6	6	23347	23352	0 %	0 %	0 %	100 %	170079541
70	NC_010479	T	6	6	23455	23460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010479	A	6	6	23887	23892	100 %	0 %	0 %	0 %	170079542
72	NC_010479	T	7	7	24182	24188	0 %	100 %	0 %	0 %	170079542
73	NC_010479	A	6	6	24220	24225	100 %	0 %	0 %	0 %	170079542
74	NC_010479	A	6	6	25483	25488	100 %	0 %	0 %	0 %	170079544
75	NC_010479	A	6	6	25675	25680	100 %	0 %	0 %	0 %	170079544
76	NC_010479	A	6	6	25739	25744	100 %	0 %	0 %	0 %	170079545
77	NC_010479	A	6	6	25781	25786	100 %	0 %	0 %	0 %	170079545
78	NC_010479	A	6	6	26044	26049	100 %	0 %	0 %	0 %	170079545
79	NC_010479	T	6	6	26155	26160	0 %	100 %	0 %	0 %	170079545
80	NC_010479	T	6	6	26451	26456	0 %	100 %	0 %	0 %	170079546
81	NC_010479	T	6	6	26630	26635	0 %	100 %	0 %	0 %	170079546
82	NC_010479	A	6	6	26711	26716	100 %	0 %	0 %	0 %	170079546
83	NC_010479	A	6	6	26921	26926	100 %	0 %	0 %	0 %	170079546
84	NC_010479	A	7	7	27256	27262	100 %	0 %	0 %	0 %	170079546
85	NC_010479	T	7	7	27465	27471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010479	A	7	7	27530	27536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010479	A	6	6	27552	27557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010479	A	6	6	27567	27572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010479	T	6	6	27619	27624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010479	T	7	7	28212	28218	0 %	100 %	0 %	0 %	170079547
91	NC_010479	A	7	7	28956	28962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010479	T	7	7	29111	29117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010479	A	6	6	29200	29205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010479	A	6	6	30458	30463	100 %	0 %	0 %	0 %	170079548
95	NC_010479	T	6	6	31793	31798	0 %	100 %	0 %	0 %	170079548
96	NC_010479	T	6	6	32762	32767	0 %	100 %	0 %	0 %	170079549
97	NC_010479	A	6	6	33358	33363	100 %	0 %	0 %	0 %	170079551
98	NC_010479	A	7	7	34208	34214	100 %	0 %	0 %	0 %	170079551
99	NC_010479	T	8	8	34235	34242	0 %	100 %	0 %	0 %	170079551
100	NC_010479	A	9	9	34244	34252	100 %	0 %	0 %	0 %	170079551
101	NC_010479	A	7	7	34306	34312	100 %	0 %	0 %	0 %	170079551
102	NC_010479	A	6	6	34492	34497	100 %	0 %	0 %	0 %	170079551
103	NC_010479	A	6	6	34622	34627	100 %	0 %	0 %	0 %	170079551
104	NC_010479	C	6	6	35288	35293	0 %	0 %	0 %	100 %	170079551
105	NC_010479	A	6	6	35416	35421	100 %	0 %	0 %	0 %	170079551
106	NC_010479	A	6	6	35977	35982	100 %	0 %	0 %	0 %	170079551
107	NC_010479	C	6	6	36057	36062	0 %	0 %	0 %	100 %	170079551
108	NC_010479	A	6	6	36515	36520	100 %	0 %	0 %	0 %	170079552
109	NC_010479	A	8	8	36589	36596	100 %	0 %	0 %	0 %	170079552
110	NC_010479	A	7	7	36605	36611	100 %	0 %	0 %	0 %	170079552
111	NC_010479	A	6	6	36613	36618	100 %	0 %	0 %	0 %	170079552
112	NC_010479	A	7	7	36647	36653	100 %	0 %	0 %	0 %	170079552
113	NC_010479	A	6	6	36742	36747	100 %	0 %	0 %	0 %	170079552
114	NC_010479	A	6	6	37051	37056	100 %	0 %	0 %	0 %	170079552
115	NC_010479	A	7	7	37132	37138	100 %	0 %	0 %	0 %	170079552
116	NC_010479	A	6	6	37140	37145	100 %	0 %	0 %	0 %	170079552
117	NC_010479	A	7	7	37218	37224	100 %	0 %	0 %	0 %	170079552
118	NC_010479	A	7	7	37551	37557	100 %	0 %	0 %	0 %	170079552
119	NC_010479	A	7	7	37632	37638	100 %	0 %	0 %	0 %	170079552
120	NC_010479	A	6	6	37763	37768	100 %	0 %	0 %	0 %	170079552
121	NC_010479	A	7	7	37787	37793	100 %	0 %	0 %	0 %	170079552
122	NC_010479	A	6	6	38012	38017	100 %	0 %	0 %	0 %	170079552
123	NC_010479	A	6	6	38020	38025	100 %	0 %	0 %	0 %	170079552
124	NC_010479	A	6	6	38033	38038	100 %	0 %	0 %	0 %	170079552
125	NC_010479	A	7	7	38060	38066	100 %	0 %	0 %	0 %	170079552
126	NC_010479	A	6	6	38165	38170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.