MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ4

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010478	ATTG	2	8	99	106	25 %	50 %	25 %	0 %	170079483
2	NC_010478	TGAT	2	8	218	225	25 %	50 %	25 %	0 %	170079483
3	NC_010478	AAGG	2	8	400	407	50 %	0 %	50 %	0 %	170079483
4	NC_010478	AAAC	2	8	630	637	75 %	0 %	0 %	25 %	170079484
5	NC_010478	ATTT	2	8	1537	1544	25 %	75 %	0 %	0 %	170079485
6	NC_010478	GCAC	2	8	1814	1821	25 %	0 %	25 %	50 %	170079485
7	NC_010478	AAAC	2	8	2259	2266	75 %	0 %	0 %	25 %	170079486
8	NC_010478	GTTG	2	8	4192	4199	0 %	50 %	50 %	0 %	170079487
9	NC_010478	TCAA	2	8	5305	5312	50 %	25 %	0 %	25 %	170079489
10	NC_010478	AAGT	2	8	5554	5561	50 %	25 %	25 %	0 %	170079490
11	NC_010478	CACC	2	8	7126	7133	25 %	0 %	0 %	75 %	170079492
12	NC_010478	ATCA	2	8	7559	7566	50 %	25 %	0 %	25 %	170079492
13	NC_010478	TCTT	2	8	8548	8555	0 %	75 %	0 %	25 %	170079493
14	NC_010478	ATAG	2	8	8950	8957	50 %	25 %	25 %	0 %	170079494
15	NC_010478	TTGA	2	8	9040	9047	25 %	50 %	25 %	0 %	170079494
16	NC_010478	CAGT	2	8	9416	9423	25 %	25 %	25 %	25 %	170079495
17	NC_010478	TTCT	2	8	9546	9553	0 %	75 %	0 %	25 %	170079495
18	NC_010478	TAAA	2	8	11280	11287	75 %	25 %	0 %	0 %	170079497
19	NC_010478	CCGT	2	8	12214	12221	0 %	25 %	25 %	50 %	170079498
20	NC_010478	ACAG	2	8	15335	15342	50 %	0 %	25 %	25 %	170079500
21	NC_010478	TTTG	2	8	15765	15772	0 %	75 %	25 %	0 %	170079501
22	NC_010478	GGGC	2	8	15837	15844	0 %	0 %	75 %	25 %	170079501
23	NC_010478	GATT	2	8	16408	16415	25 %	50 %	25 %	0 %	170079501
24	NC_010478	GTAA	2	8	17081	17088	50 %	25 %	25 %	0 %	170079502
25	NC_010478	AGAC	2	8	17564	17571	50 %	0 %	25 %	25 %	170079503
26	NC_010478	GATT	2	8	17573	17580	25 %	50 %	25 %	0 %	170079503
27	NC_010478	TGTT	2	8	17584	17591	0 %	75 %	25 %	0 %	170079503
28	NC_010478	CAAA	2	8	17632	17639	75 %	0 %	0 %	25 %	170079503
29	NC_010478	CTAC	2	8	18231	18238	25 %	25 %	0 %	50 %	170079504
30	NC_010478	TAAT	2	8	18261	18268	50 %	50 %	0 %	0 %	170079504
31	NC_010478	TTTA	2	8	18887	18894	25 %	75 %	0 %	0 %	170079505
32	NC_010478	GTTT	2	8	19485	19492	0 %	75 %	25 %	0 %	170079505
33	NC_010478	TGTT	2	8	19526	19533	0 %	75 %	25 %	0 %	170079505
34	NC_010478	AATT	2	8	20008	20015	50 %	50 %	0 %	0 %	170079506
35	NC_010478	GCGG	2	8	20356	20363	0 %	0 %	75 %	25 %	170079506
36	NC_010478	AGAT	2	8	20855	20862	50 %	25 %	25 %	0 %	170079506
37	NC_010478	AGTA	2	8	22036	22043	50 %	25 %	25 %	0 %	170079506
38	NC_010478	TCTT	2	8	22069	22076	0 %	75 %	0 %	25 %	170079506
39	NC_010478	AAAT	2	8	22515	22522	75 %	25 %	0 %	0 %	170079506
40	NC_010478	ATTT	2	8	23300	23307	25 %	75 %	0 %	0 %	170079507
41	NC_010478	TAAA	2	8	24124	24131	75 %	25 %	0 %	0 %	170079507
42	NC_010478	TCAA	2	8	25592	25599	50 %	25 %	0 %	25 %	170079508
43	NC_010478	TTTA	2	8	25850	25857	25 %	75 %	0 %	0 %	170079508
44	NC_010478	TCTA	2	8	26310	26317	25 %	50 %	0 %	25 %	170079508
45	NC_010478	CAAA	2	8	27821	27828	75 %	0 %	0 %	25 %	170079509
46	NC_010478	AACC	2	8	27916	27923	50 %	0 %	0 %	50 %	170079509
47	NC_010478	CAGC	2	8	28188	28195	25 %	0 %	25 %	50 %	170079509
48	NC_010478	CAAA	2	8	28398	28405	75 %	0 %	0 %	25 %	170079509
49	NC_010478	GACA	2	8	28545	28552	50 %	0 %	25 %	25 %	170079509
50	NC_010478	AGTG	2	8	28588	28595	25 %	25 %	50 %	0 %	170079509
51	NC_010478	TGAT	2	8	29376	29383	25 %	50 %	25 %	0 %	170079510
52	NC_010478	CAAG	2	8	29683	29690	50 %	0 %	25 %	25 %	170079510
53	NC_010478	GGTA	2	8	30058	30065	25 %	25 %	50 %	0 %	170079511
54	NC_010478	TAGG	2	8	30158	30165	25 %	25 %	50 %	0 %	170079511

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.