MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ3

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010477	TGAT	2	8	101	108	25 %	50 %	25 %	0 %	170079465
2	NC_010477	CAAA	2	8	709	716	75 %	0 %	0 %	25 %	170079466
3	NC_010477	GGAA	2	8	1194	1201	50 %	0 %	50 %	0 %	170079467
4	NC_010477	GGGC	2	8	2256	2263	0 %	0 %	75 %	25 %	170079467
5	NC_010477	AAAC	2	8	2352	2359	75 %	0 %	0 %	25 %	170079467
6	NC_010477	TCAA	2	8	2398	2405	50 %	25 %	0 %	25 %	170079467
7	NC_010477	CGCC	2	8	3120	3127	0 %	0 %	25 %	75 %	170079468
8	NC_010477	TCAG	2	8	3387	3394	25 %	25 %	25 %	25 %	170079468
9	NC_010477	AAGA	2	8	3551	3558	75 %	0 %	25 %	0 %	170079468
10	NC_010477	GAAG	2	8	4094	4101	50 %	0 %	50 %	0 %	170079469
11	NC_010477	CTAC	2	8	4308	4315	25 %	25 %	0 %	50 %	170079469
12	NC_010477	TGAT	2	8	4578	4585	25 %	50 %	25 %	0 %	170079469
13	NC_010477	GATT	2	8	5154	5161	25 %	50 %	25 %	0 %	170079469
14	NC_010477	CGGT	2	8	5436	5443	0 %	25 %	50 %	25 %	170079470
15	NC_010477	CCCA	2	8	5713	5720	25 %	0 %	0 %	75 %	170079470
16	NC_010477	AAGG	2	8	6361	6368	50 %	0 %	50 %	0 %	170079470
17	NC_010477	AACC	2	8	6708	6715	50 %	0 %	0 %	50 %	170079470
18	NC_010477	CGGG	2	8	6861	6868	0 %	0 %	75 %	25 %	170079470
19	NC_010477	CGCA	2	8	7308	7315	25 %	0 %	25 %	50 %	170079470
20	NC_010477	GTAT	2	8	8073	8080	25 %	50 %	25 %	0 %	170079471
21	NC_010477	TTTG	2	8	9117	9124	0 %	75 %	25 %	0 %	170079472
22	NC_010477	GCGG	2	8	9197	9204	0 %	0 %	75 %	25 %	170079472
23	NC_010477	TGAT	2	8	9450	9457	25 %	50 %	25 %	0 %	170079472
24	NC_010477	TTGG	2	8	11768	11775	0 %	50 %	50 %	0 %	170079474
25	NC_010477	GATT	2	8	13911	13918	25 %	50 %	25 %	0 %	170079476
26	NC_010477	CAGC	2	8	13929	13936	25 %	0 %	25 %	50 %	170079476
27	NC_010477	TTTC	2	8	14141	14148	0 %	75 %	0 %	25 %	170079477
28	NC_010477	ATCA	2	8	14979	14986	50 %	25 %	0 %	25 %	170079479
29	NC_010477	CAAA	2	8	15231	15238	75 %	0 %	0 %	25 %	170079480
30	NC_010477	GCCC	2	8	15323	15330	0 %	0 %	25 %	75 %	170079481
31	NC_010477	ACTG	2	8	15624	15631	25 %	25 %	25 %	25 %	170079481

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.