MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 1802

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010475	AACTC	2	10	329	338	40 %	20 %	0 %	40 %	170076637
2	NC_010475	ACCGC	2	10	614	623	20 %	0 %	20 %	60 %	170076637
3	NC_010475	ATCAG	2	10	4120	4129	40 %	20 %	20 %	20 %	170076642
4	NC_010475	TTTTC	2	10	5417	5426	0 %	80 %	0 %	20 %	170076645
5	NC_010475	GCTTG	2	10	5778	5787	0 %	40 %	40 %	20 %	170076646
6	NC_010475	ATGGA	2	10	8916	8925	40 %	20 %	40 %	0 %	170076649
7	NC_010475	AAATG	2	10	9111	9120	60 %	20 %	20 %	0 %	170076649
8	NC_010475	AAAGA	2	10	9403	9412	80 %	0 %	20 %	0 %	170076649
9	NC_010475	CAATC	2	10	11352	11361	40 %	20 %	0 %	40 %	170076651
10	NC_010475	CTCAT	2	10	11475	11484	20 %	40 %	0 %	40 %	170076652
11	NC_010475	GTTGG	2	10	11981	11990	0 %	40 %	60 %	0 %	170076653
12	NC_010475	GTCGG	2	10	12629	12638	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010475	TTTGA	2	10	14527	14536	20 %	60 %	20 %	0 %	170076656
14	NC_010475	GAAAT	2	10	15811	15820	60 %	20 %	20 %	0 %	170076657
15	NC_010475	AGTTA	2	10	19611	19620	40 %	40 %	20 %	0 %	170076658
16	NC_010475	TCAAA	2	10	21231	21240	60 %	20 %	0 %	20 %	170076660
17	NC_010475	GACCC	2	10	21591	21600	20 %	0 %	20 %	60 %	170076660
18	NC_010475	TAGCC	2	10	23110	23119	20 %	20 %	20 %	40 %	170076661
19	NC_010475	AGCCA	2	10	26940	26949	40 %	0 %	20 %	40 %	170076665
20	NC_010475	GTTTT	2	10	29394	29403	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010475	CACTC	2	10	29516	29525	20 %	20 %	0 %	60 %	170076668
22	NC_010475	TTTTC	2	10	29618	29627	0 %	80 %	0 %	20 %	170076668
23	NC_010475	TCACC	2	10	32475	32484	20 %	20 %	0 %	60 %	170076670
24	NC_010475	GCCAT	2	10	32947	32956	20 %	20 %	20 %	40 %	170076670
25	NC_010475	TGGGG	2	10	33985	33994	0 %	20 %	80 %	0 %	170076671
26	NC_010475	CATGG	2	10	34476	34485	20 %	20 %	40 %	20 %	170076671
27	NC_010475	TTGAC	2	10	34932	34941	20 %	40 %	20 %	20 %	170076672
28	NC_010475	TGCTC	2	10	35473	35482	0 %	40 %	20 %	40 %	170076672
29	NC_010475	TCAAT	2	10	40539	40548	40 %	40 %	0 %	20 %	170076676
30	NC_010475	TTGAC	2	10	40808	40817	20 %	40 %	20 %	20 %	170076676
31	NC_010475	AGCCA	2	10	41528	41537	40 %	0 %	20 %	40 %	170076676
32	NC_010475	GCTTG	2	10	43412	43421	0 %	40 %	40 %	20 %	170076676
33	NC_010475	CCCGG	2	10	44501	44510	0 %	0 %	40 %	60 %	170076676
34	NC_010475	GGAAT	2	10	47098	47107	40 %	20 %	40 %	0 %	170076678
35	NC_010475	CCCCT	2	10	50257	50266	0 %	20 %	0 %	80 %	170076680
36	NC_010475	CCGTC	2	10	51228	51237	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_010475	CACAA	2	10	51314	51323	60 %	0 %	0 %	40 %	170076682
38	NC_010475	CATCG	2	10	56316	56325	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_010475	TAATC	2	10	58000	58009	40 %	40 %	0 %	20 %	170076684
40	NC_010475	TCGGG	2	10	58457	58466	0 %	20 %	60 %	20 %	170076684
41	NC_010475	CACAA	2	10	59057	59066	60 %	0 %	0 %	40 %	170076684
42	NC_010475	GGGTA	2	10	59693	59702	20 %	20 %	60 %	0 %	170076685
43	NC_010475	GCTTG	2	10	60486	60495	0 %	40 %	40 %	20 %	170076686
44	NC_010475	GGTTG	2	10	60710	60719	0 %	40 %	60 %	0 %	170076687
45	NC_010475	TAATT	2	10	70269	70278	40 %	60 %	0 %	0 %	170076698
46	NC_010475	ATGGA	2	10	74161	74170	40 %	20 %	40 %	0 %	170076702
47	NC_010475	CTGGG	2	10	74730	74739	0 %	20 %	60 %	20 %	170076703
48	NC_010475	CGATT	2	10	75885	75894	20 %	40 %	20 %	20 %	170076704
49	NC_010475	CTGTA	2	10	77269	77278	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_010475	ACGGG	2	10	77758	77767	20 %	0 %	60 %	20 %	170076707
51	NC_010475	TTGGG	2	10	78164	78173	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010475	TAGAT	2	10	79266	79275	40 %	40 %	20 %	0 %	170076708
53	NC_010475	AGGGT	2	10	79778	79787	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010475	CTCCC	2	10	80390	80399	0 %	20 %	0 %	80 %	170076710
55	NC_010475	ATTAC	2	10	82029	82038	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_010475	AATAG	2	10	82117	82126	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010475	TAATT	2	10	83788	83797	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010475	TTAGT	2	10	84870	84879	20 %	60 %	20 %	0 %	170076716
59	NC_010475	CTGGG	2	10	85146	85155	0 %	20 %	60 %	20 %	170076716
60	NC_010475	CGGTG	2	10	86833	86842	0 %	20 %	60 %	20 %	170076717
61	NC_010475	GCGGG	2	10	87159	87168	0 %	0 %	80 %	20 %	170076718
62	NC_010475	CAAAA	2	10	87351	87360	80 %	0 %	0 %	20 %	170076718
63	NC_010475	CGAAA	2	10	87380	87389	60 %	0 %	20 %	20 %	170076718
64	NC_010475	GTAGG	2	10	88567	88576	20 %	20 %	60 %	0 %	170076720
65	NC_010475	GGTGA	2	10	90057	90066	20 %	20 %	60 %	0 %	170076721
66	NC_010475	CAAAA	2	10	91904	91913	80 %	0 %	0 %	20 %	170076724
67	NC_010475	AAAAT	2	10	92150	92159	80 %	20 %	0 %	0 %	170076724
68	NC_010475	ACCCA	2	10	93008	93017	40 %	0 %	0 %	60 %	170076725
69	NC_010475	GCTGG	2	10	93644	93653	0 %	20 %	60 %	20 %	170076726
70	NC_010475	CCCGA	2	10	93861	93870	20 %	0 %	20 %	60 %	170076726
71	NC_010475	ACAGT	2	10	95896	95905	40 %	20 %	20 %	20 %	170076729
72	NC_010475	GTCGT	2	10	96090	96099	0 %	40 %	40 %	20 %	170076729
73	NC_010475	ACGGT	2	10	96855	96864	20 %	20 %	40 %	20 %	170076729
74	NC_010475	CATGA	2	10	99686	99695	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010475	ATGGC	2	10	101724	101733	20 %	20 %	40 %	20 %	170076734
76	NC_010475	TCAAA	2	10	102349	102358	60 %	20 %	0 %	20 %	170076734
77	NC_010475	GAAAC	2	10	102846	102855	60 %	0 %	20 %	20 %	170076734
78	NC_010475	TCAAA	2	10	103759	103768	60 %	20 %	0 %	20 %	170076735
79	NC_010475	AATGG	2	10	106770	106779	40 %	20 %	40 %	0 %	170076738
80	NC_010475	TCTGA	2	10	108149	108158	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_010475	GATTT	2	10	114393	114402	20 %	60 %	20 %	0 %	170076748
82	NC_010475	AAGGC	2	10	114484	114493	40 %	0 %	40 %	20 %	170076748
83	NC_010475	CTTGG	2	10	114701	114710	0 %	40 %	40 %	20 %	170076748
84	NC_010475	CTTTA	2	10	114785	114794	20 %	60 %	0 %	20 %	170076748
85	NC_010475	GTTGG	2	10	115160	115169	0 %	40 %	60 %	0 %	170076748
86	NC_010475	ACAAA	2	10	117809	117818	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_010475	GGGCC	2	10	119593	119602	0 %	0 %	60 %	40 %	170076752
88	NC_010475	CTGGG	2	10	121413	121422	0 %	20 %	60 %	20 %	170076753
89	NC_010475	GGCGA	2	10	122621	122630	20 %	0 %	60 %	20 %	170076754
90	NC_010475	GTTTG	2	10	125530	125539	0 %	60 %	40 %	0 %	170076756
91	NC_010475	CCAGA	2	10	127714	127723	40 %	0 %	20 %	40 %	170076758
92	NC_010475	AATTT	2	10	127956	127965	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010475	TGAAT	2	10	128348	128357	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010475	GGGGT	2	10	129688	129697	0 %	20 %	80 %	0 %	170076761
95	NC_010475	CAGGG	2	10	131451	131460	20 %	0 %	60 %	20 %	170076764
96	NC_010475	GGGAT	2	10	132594	132603	20 %	20 %	60 %	0 %	170076766
97	NC_010475	AAAAT	2	10	133410	133419	80 %	20 %	0 %	0 %	170076767
98	NC_010475	CCCCA	2	10	134525	134534	20 %	0 %	0 %	80 %	170076767
99	NC_010475	AATAA	2	10	135875	135884	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010475	CCAGA	2	10	138849	138858	40 %	0 %	20 %	40 %	170076771
101	NC_010475	AAAAT	2	10	138891	138900	80 %	20 %	0 %	0 %	170076771
102	NC_010475	ATCCA	2	10	138965	138974	40 %	20 %	0 %	40 %	170076771
103	NC_010475	AACCA	2	10	139853	139862	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_010475	CTTCG	2	10	141171	141180	0 %	40 %	20 %	40 %	170076773
105	NC_010475	CGGCG	2	10	145655	145664	0 %	0 %	60 %	40 %	170076777
106	NC_010475	GTTCT	2	10	149557	149566	0 %	60 %	20 %	20 %	170076779
107	NC_010475	CGCCC	2	10	150705	150714	0 %	0 %	20 %	80 %	170076780
108	NC_010475	CTCCC	2	10	150741	150750	0 %	20 %	0 %	80 %	170076780
109	NC_010475	GCACC	2	10	151562	151571	20 %	0 %	20 %	60 %	170076780
110	NC_010475	GGCGA	2	10	152651	152660	20 %	0 %	60 %	20 %	170076780
111	NC_010475	AAAAT	2	10	153994	154003	80 %	20 %	0 %	0 %	170076781
112	NC_010475	GCTGG	2	10	156122	156131	0 %	20 %	60 %	20 %	170076782
113	NC_010475	TGACT	2	10	158153	158162	20 %	40 %	20 %	20 %	170076783
114	NC_010475	CTTTT	2	10	160769	160778	0 %	80 %	0 %	20 %	170076788
115	NC_010475	AGAGA	2	10	162667	162676	60 %	0 %	40 %	0 %	228861783
116	NC_010475	TTTGC	2	10	163697	163706	0 %	60 %	20 %	20 %	170076790
117	NC_010475	CCTTA	2	10	166616	166625	20 %	40 %	0 %	40 %	170076792
118	NC_010475	GACGA	2	10	170127	170136	40 %	0 %	40 %	20 %	170076796
119	NC_010475	GATAA	2	10	170471	170480	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010475	TGTTT	2	10	171161	171170	0 %	80 %	20 %	0 %	170076797
121	NC_010475	CGGTA	2	10	172938	172947	20 %	20 %	40 %	20 %	170076798
122	NC_010475	AATCA	2	10	173672	173681	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_010475	ATGGG	2	10	175017	175026	20 %	20 %	60 %	0 %	170076800
124	NC_010475	TGGCG	2	10	180385	180394	0 %	20 %	60 %	20 %	170076804
125	NC_010475	CGATG	2	10	183514	183523	20 %	20 %	40 %	20 %	170076806
126	NC_010475	ACCGC	2	10	183675	183684	20 %	0 %	20 %	60 %	170076806
127	NC_010475	CGTGC	2	10	186097	186106	0 %	20 %	40 %	40 %	170076809
128	NC_010475	AATCA	2	10	187410	187419	60 %	20 %	0 %	20 %	170076810
129	NC_010475	TTGGC	2	10	191798	191807	0 %	40 %	40 %	20 %	170076813
130	NC_010475	TTGGT	2	10	192269	192278	0 %	60 %	40 %	0 %	170076813
131	NC_010475	TGGTT	2	10	192413	192422	0 %	60 %	40 %	0 %	170076813
132	NC_010475	TGGGG	2	10	195612	195621	0 %	20 %	80 %	0 %	170076818
133	NC_010475	TCACT	2	10	196042	196051	20 %	40 %	0 %	40 %	170076818
134	NC_010475	TTTTA	2	10	196558	196567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010475	CGGTG	2	10	197070	197079	0 %	20 %	60 %	20 %	170076819
136	NC_010475	ACAAA	2	10	197538	197547	80 %	0 %	0 %	20 %	170076819
137	NC_010475	CCAAG	2	10	198790	198799	40 %	0 %	20 %	40 %	170076820
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248	NC_010475	AAAGG	2	10	366570	366579	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
249	NC_010475	GGATT	2	10	370088	370097	20 %	40 %	40 %	0 %	170076979
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252	NC_010475	ACCTG	2	10	374402	374411	20 %	20 %	20 %	40 %	170076982
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256	NC_010475	TCATT	2	10	384921	384930	20 %	60 %	0 %	20 %	170076989
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261	NC_010475	TTGAT	2	10	405386	405395	20 %	60 %	20 %	0 %	170077008
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263	NC_010475	ACCCC	2	10	407245	407254	20 %	0 %	0 %	80 %	170077010
264	NC_010475	CCAAG	2	10	412452	412461	40 %	0 %	20 %	40 %	170077016
265	NC_010475	AAGGC	2	10	412554	412563	40 %	0 %	40 %	20 %	170077017
266	NC_010475	ATGAG	2	10	413073	413082	40 %	20 %	40 %	0 %	170077017
267	NC_010475	TGTGG	2	10	413710	413719	0 %	40 %	60 %	0 %	170077018
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269	NC_010475	TGGGC	2	10	419675	419684	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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402	NC_010475	TTCCG	2	10	626452	626461	0 %	40 %	20 %	40 %	170077221
403	NC_010475	TTATT	2	10	627268	627277	20 %	80 %	0 %	0 %	170077222
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