MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 1496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010475	AACTC	2	10	329	338	40 %	20 %	0 %	40 %	170076637
2	NC_010475	ACCGC	2	10	614	623	20 %	0 %	20 %	60 %	170076637
3	NC_010475	ATCAG	2	10	4120	4129	40 %	20 %	20 %	20 %	170076642
4	NC_010475	TTTTC	2	10	5417	5426	0 %	80 %	0 %	20 %	170076645
5	NC_010475	GCTTG	2	10	5778	5787	0 %	40 %	40 %	20 %	170076646
6	NC_010475	ATGGA	2	10	8916	8925	40 %	20 %	40 %	0 %	170076649
7	NC_010475	AAATG	2	10	9111	9120	60 %	20 %	20 %	0 %	170076649
8	NC_010475	AAAGA	2	10	9403	9412	80 %	0 %	20 %	0 %	170076649
9	NC_010475	CAATC	2	10	11352	11361	40 %	20 %	0 %	40 %	170076651
10	NC_010475	CTCAT	2	10	11475	11484	20 %	40 %	0 %	40 %	170076652
11	NC_010475	GTTGG	2	10	11981	11990	0 %	40 %	60 %	0 %	170076653
12	NC_010475	TTTGA	2	10	14527	14536	20 %	60 %	20 %	0 %	170076656
13	NC_010475	GAAAT	2	10	15811	15820	60 %	20 %	20 %	0 %	170076657
14	NC_010475	AGTTA	2	10	19611	19620	40 %	40 %	20 %	0 %	170076658
15	NC_010475	TCAAA	2	10	21231	21240	60 %	20 %	0 %	20 %	170076660
16	NC_010475	GACCC	2	10	21591	21600	20 %	0 %	20 %	60 %	170076660
17	NC_010475	TAGCC	2	10	23110	23119	20 %	20 %	20 %	40 %	170076661
18	NC_010475	AGCCA	2	10	26940	26949	40 %	0 %	20 %	40 %	170076665
19	NC_010475	CACTC	2	10	29516	29525	20 %	20 %	0 %	60 %	170076668
20	NC_010475	TTTTC	2	10	29618	29627	0 %	80 %	0 %	20 %	170076668
21	NC_010475	TCACC	2	10	32475	32484	20 %	20 %	0 %	60 %	170076670
22	NC_010475	GCCAT	2	10	32947	32956	20 %	20 %	20 %	40 %	170076670
23	NC_010475	TGGGG	2	10	33985	33994	0 %	20 %	80 %	0 %	170076671
24	NC_010475	CATGG	2	10	34476	34485	20 %	20 %	40 %	20 %	170076671
25	NC_010475	TTGAC	2	10	34932	34941	20 %	40 %	20 %	20 %	170076672
26	NC_010475	TGCTC	2	10	35473	35482	0 %	40 %	20 %	40 %	170076672
27	NC_010475	TCAAT	2	10	40539	40548	40 %	40 %	0 %	20 %	170076676
28	NC_010475	TTGAC	2	10	40808	40817	20 %	40 %	20 %	20 %	170076676
29	NC_010475	AGCCA	2	10	41528	41537	40 %	0 %	20 %	40 %	170076676
30	NC_010475	GCTTG	2	10	43412	43421	0 %	40 %	40 %	20 %	170076676
31	NC_010475	CCCGG	2	10	44501	44510	0 %	0 %	40 %	60 %	170076676
32	NC_010475	GGAAT	2	10	47098	47107	40 %	20 %	40 %	0 %	170076678
33	NC_010475	CCCCT	2	10	50257	50266	0 %	20 %	0 %	80 %	170076680
34	NC_010475	CACAA	2	10	51314	51323	60 %	0 %	0 %	40 %	170076682
35	NC_010475	TAATC	2	10	58000	58009	40 %	40 %	0 %	20 %	170076684
36	NC_010475	TCGGG	2	10	58457	58466	0 %	20 %	60 %	20 %	170076684
37	NC_010475	CACAA	2	10	59057	59066	60 %	0 %	0 %	40 %	170076684
38	NC_010475	GGGTA	2	10	59693	59702	20 %	20 %	60 %	0 %	170076685
39	NC_010475	GCTTG	2	10	60486	60495	0 %	40 %	40 %	20 %	170076686
40	NC_010475	GGTTG	2	10	60710	60719	0 %	40 %	60 %	0 %	170076687
41	NC_010475	TAATT	2	10	70269	70278	40 %	60 %	0 %	0 %	170076698
42	NC_010475	ATGGA	2	10	74161	74170	40 %	20 %	40 %	0 %	170076702
43	NC_010475	CTGGG	2	10	74730	74739	0 %	20 %	60 %	20 %	170076703
44	NC_010475	CGATT	2	10	75885	75894	20 %	40 %	20 %	20 %	170076704
45	NC_010475	ACGGG	2	10	77758	77767	20 %	0 %	60 %	20 %	170076707
46	NC_010475	TAGAT	2	10	79266	79275	40 %	40 %	20 %	0 %	170076708
47	NC_010475	CTCCC	2	10	80390	80399	0 %	20 %	0 %	80 %	170076710
48	NC_010475	TTAGT	2	10	84870	84879	20 %	60 %	20 %	0 %	170076716
49	NC_010475	CTGGG	2	10	85146	85155	0 %	20 %	60 %	20 %	170076716
50	NC_010475	CGGTG	2	10	86833	86842	0 %	20 %	60 %	20 %	170076717
51	NC_010475	GCGGG	2	10	87159	87168	0 %	0 %	80 %	20 %	170076718
52	NC_010475	CAAAA	2	10	87351	87360	80 %	0 %	0 %	20 %	170076718
53	NC_010475	CGAAA	2	10	87380	87389	60 %	0 %	20 %	20 %	170076718
54	NC_010475	GTAGG	2	10	88567	88576	20 %	20 %	60 %	0 %	170076720
55	NC_010475	GGTGA	2	10	90057	90066	20 %	20 %	60 %	0 %	170076721
56	NC_010475	CAAAA	2	10	91904	91913	80 %	0 %	0 %	20 %	170076724
57	NC_010475	AAAAT	2	10	92150	92159	80 %	20 %	0 %	0 %	170076724
58	NC_010475	ACCCA	2	10	93008	93017	40 %	0 %	0 %	60 %	170076725
59	NC_010475	GCTGG	2	10	93644	93653	0 %	20 %	60 %	20 %	170076726
60	NC_010475	CCCGA	2	10	93861	93870	20 %	0 %	20 %	60 %	170076726
61	NC_010475	ACAGT	2	10	95896	95905	40 %	20 %	20 %	20 %	170076729
62	NC_010475	GTCGT	2	10	96090	96099	0 %	40 %	40 %	20 %	170076729
63	NC_010475	ACGGT	2	10	96855	96864	20 %	20 %	40 %	20 %	170076729
64	NC_010475	ATGGC	2	10	101724	101733	20 %	20 %	40 %	20 %	170076734
65	NC_010475	TCAAA	2	10	102349	102358	60 %	20 %	0 %	20 %	170076734
66	NC_010475	GAAAC	2	10	102846	102855	60 %	0 %	20 %	20 %	170076734
67	NC_010475	TCAAA	2	10	103759	103768	60 %	20 %	0 %	20 %	170076735
68	NC_010475	AATGG	2	10	106770	106779	40 %	20 %	40 %	0 %	170076738
69	NC_010475	GATTT	2	10	114393	114402	20 %	60 %	20 %	0 %	170076748
70	NC_010475	AAGGC	2	10	114484	114493	40 %	0 %	40 %	20 %	170076748
71	NC_010475	CTTGG	2	10	114701	114710	0 %	40 %	40 %	20 %	170076748
72	NC_010475	CTTTA	2	10	114785	114794	20 %	60 %	0 %	20 %	170076748
73	NC_010475	GTTGG	2	10	115160	115169	0 %	40 %	60 %	0 %	170076748
74	NC_010475	GGGCC	2	10	119593	119602	0 %	0 %	60 %	40 %	170076752
75	NC_010475	CTGGG	2	10	121413	121422	0 %	20 %	60 %	20 %	170076753
76	NC_010475	GGCGA	2	10	122621	122630	20 %	0 %	60 %	20 %	170076754
77	NC_010475	GTTTG	2	10	125530	125539	0 %	60 %	40 %	0 %	170076756
78	NC_010475	CCAGA	2	10	127714	127723	40 %	0 %	20 %	40 %	170076758
79	NC_010475	GGGGT	2	10	129688	129697	0 %	20 %	80 %	0 %	170076761
80	NC_010475	CAGGG	2	10	131451	131460	20 %	0 %	60 %	20 %	170076764
81	NC_010475	GGGAT	2	10	132594	132603	20 %	20 %	60 %	0 %	170076766
82	NC_010475	AAAAT	2	10	133410	133419	80 %	20 %	0 %	0 %	170076767
83	NC_010475	CCCCA	2	10	134525	134534	20 %	0 %	0 %	80 %	170076767
84	NC_010475	CCAGA	2	10	138849	138858	40 %	0 %	20 %	40 %	170076771
85	NC_010475	AAAAT	2	10	138891	138900	80 %	20 %	0 %	0 %	170076771
86	NC_010475	ATCCA	2	10	138965	138974	40 %	20 %	0 %	40 %	170076771
87	NC_010475	CTTCG	2	10	141171	141180	0 %	40 %	20 %	40 %	170076773
88	NC_010475	CGGCG	2	10	145655	145664	0 %	0 %	60 %	40 %	170076777
89	NC_010475	GTTCT	2	10	149557	149566	0 %	60 %	20 %	20 %	170076779
90	NC_010475	CGCCC	2	10	150705	150714	0 %	0 %	20 %	80 %	170076780
91	NC_010475	CTCCC	2	10	150741	150750	0 %	20 %	0 %	80 %	170076780
92	NC_010475	GCACC	2	10	151562	151571	20 %	0 %	20 %	60 %	170076780
93	NC_010475	GGCGA	2	10	152651	152660	20 %	0 %	60 %	20 %	170076780
94	NC_010475	AAAAT	2	10	153994	154003	80 %	20 %	0 %	0 %	170076781
95	NC_010475	GCTGG	2	10	156122	156131	0 %	20 %	60 %	20 %	170076782
96	NC_010475	TGACT	2	10	158153	158162	20 %	40 %	20 %	20 %	170076783
97	NC_010475	CTTTT	2	10	160769	160778	0 %	80 %	0 %	20 %	170076788
98	NC_010475	AGAGA	2	10	162667	162676	60 %	0 %	40 %	0 %	228861783
99	NC_010475	TTTGC	2	10	163697	163706	0 %	60 %	20 %	20 %	170076790
100	NC_010475	CCTTA	2	10	166616	166625	20 %	40 %	0 %	40 %	170076792
101	NC_010475	GACGA	2	10	170127	170136	40 %	0 %	40 %	20 %	170076796
102	NC_010475	TGTTT	2	10	171161	171170	0 %	80 %	20 %	0 %	170076797
103	NC_010475	CGGTA	2	10	172938	172947	20 %	20 %	40 %	20 %	170076798
104	NC_010475	ATGGG	2	10	175017	175026	20 %	20 %	60 %	0 %	170076800
105	NC_010475	TGGCG	2	10	180385	180394	0 %	20 %	60 %	20 %	170076804
106	NC_010475	CGATG	2	10	183514	183523	20 %	20 %	40 %	20 %	170076806
107	NC_010475	ACCGC	2	10	183675	183684	20 %	0 %	20 %	60 %	170076806
108	NC_010475	CGTGC	2	10	186097	186106	0 %	20 %	40 %	40 %	170076809
109	NC_010475	AATCA	2	10	187410	187419	60 %	20 %	0 %	20 %	170076810
110	NC_010475	TTGGC	2	10	191798	191807	0 %	40 %	40 %	20 %	170076813
111	NC_010475	TTGGT	2	10	192269	192278	0 %	60 %	40 %	0 %	170076813
112	NC_010475	TGGTT	2	10	192413	192422	0 %	60 %	40 %	0 %	170076813
113	NC_010475	TGGGG	2	10	195612	195621	0 %	20 %	80 %	0 %	170076818
114	NC_010475	TCACT	2	10	196042	196051	20 %	40 %	0 %	40 %	170076818
115	NC_010475	CGGTG	2	10	197070	197079	0 %	20 %	60 %	20 %	170076819
116	NC_010475	ACAAA	2	10	197538	197547	80 %	0 %	0 %	20 %	170076819
117	NC_010475	CCAAG	2	10	198790	198799	40 %	0 %	20 %	40 %	170076820
118	NC_010475	TCGCC	2	10	200623	200632	0 %	20 %	20 %	60 %	170076821
119	NC_010475	GGGTA	2	10	201665	201674	20 %	20 %	60 %	0 %	170076822
120	NC_010475	TAAAA	2	10	203002	203011	80 %	20 %	0 %	0 %	170076824
121	NC_010475	CGGGT	2	10	203800	203809	0 %	20 %	60 %	20 %	170076824
122	NC_010475	TGCCG	2	10	208201	208210	0 %	20 %	40 %	40 %	170076827
123	NC_010475	CCAAT	2	10	208343	208352	40 %	20 %	0 %	40 %	170076827
124	NC_010475	GGACA	2	10	210941	210950	40 %	0 %	40 %	20 %	170076831
125	NC_010475	GCCAT	2	10	212824	212833	20 %	20 %	20 %	40 %	170076834
126	NC_010475	CCCAA	2	10	214028	214037	40 %	0 %	0 %	60 %	170076835
127	NC_010475	TGGGA	2	10	215032	215041	20 %	20 %	60 %	0 %	170076835
128	NC_010475	GTGTT	2	10	216431	216440	0 %	60 %	40 %	0 %	170076837
129	NC_010475	CGTCG	2	10	216920	216929	0 %	20 %	40 %	40 %	170076837
130	NC_010475	GTTGC	2	10	219551	219560	0 %	40 %	40 %	20 %	170076841
131	NC_010475	GTCAA	2	10	220206	220215	40 %	20 %	20 %	20 %	170076842
132	NC_010475	GTTGG	2	10	220247	220256	0 %	40 %	60 %	0 %	170076842
133	NC_010475	TCGTC	2	10	224771	224780	0 %	40 %	20 %	40 %	170076845
134	NC_010475	GAGTC	2	10	225584	225593	20 %	20 %	40 %	20 %	170076845
135	NC_010475	TGCGG	2	10	225800	225809	0 %	20 %	60 %	20 %	170076845
136	NC_010475	GCTGG	2	10	229694	229703	0 %	20 %	60 %	20 %	170076848
137	NC_010475	ACCGC	2	10	232489	232498	20 %	0 %	20 %	60 %	170076852
138	NC_010475	GGAAT	2	10	233051	233060	40 %	20 %	40 %	0 %	170076852
139	NC_010475	CATTG	2	10	236823	236832	20 %	40 %	20 %	20 %	170076856
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141	NC_010475	TGGCT	2	10	240995	241004	0 %	40 %	40 %	20 %	170076860
142	NC_010475	GATCA	2	10	241095	241104	40 %	20 %	20 %	20 %	170076860
143	NC_010475	AACCC	2	10	243420	243429	40 %	0 %	0 %	60 %	170076864
144	NC_010475	AGATC	2	10	245031	245040	40 %	20 %	20 %	20 %	170076866
145	NC_010475	AAAAT	2	10	245360	245369	80 %	20 %	0 %	0 %	170076866
146	NC_010475	ATTTA	2	10	245711	245720	40 %	60 %	0 %	0 %	170076866
147	NC_010475	AAAGT	2	10	246161	246170	60 %	20 %	20 %	0 %	170076866
148	NC_010475	GGATT	2	10	246520	246529	20 %	40 %	40 %	0 %	170076867
149	NC_010475	ATTTA	2	10	246576	246585	40 %	60 %	0 %	0 %	170076867
150	NC_010475	GCGTT	2	10	246970	246979	0 %	40 %	40 %	20 %	170076867
151	NC_010475	CGCCC	2	10	247246	247255	0 %	0 %	20 %	80 %	170076867
152	NC_010475	ATAAA	2	10	248011	248020	80 %	20 %	0 %	0 %	170076867
153	NC_010475	GCCTT	2	10	249223	249232	0 %	40 %	20 %	40 %	170076868
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156	NC_010475	CACAT	2	10	263856	263865	40 %	20 %	0 %	40 %	170076879
157	NC_010475	CCAAA	2	10	264019	264028	60 %	0 %	0 %	40 %	170076879
158	NC_010475	TCTGG	2	10	269311	269320	0 %	40 %	40 %	20 %	170076884
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163	NC_010475	TTTAC	2	10	287194	287203	20 %	60 %	0 %	20 %	170076900
164	NC_010475	CGTAC	2	10	294881	294890	20 %	20 %	20 %	40 %	170076908
165	NC_010475	TTCCA	2	10	294959	294968	20 %	40 %	0 %	40 %	170076908
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168	NC_010475	TACCG	2	10	298683	298692	20 %	20 %	20 %	40 %	170076911
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187	NC_010475	ATCCG	2	10	329689	329698	20 %	20 %	20 %	40 %	170076943
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192	NC_010475	TAAAC	2	10	335289	335298	60 %	20 %	0 %	20 %	170076948
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194	NC_010475	CGGCG	2	10	338837	338846	0 %	0 %	60 %	40 %	170076953
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201	NC_010475	AAACA	2	10	348677	348686	80 %	0 %	0 %	20 %	170076962
202	NC_010475	TGTTT	2	10	349223	349232	0 %	80 %	20 %	0 %	170076962
203	NC_010475	AGCCA	2	10	350441	350450	40 %	0 %	20 %	40 %	170076963
204	NC_010475	CGCAT	2	10	350471	350480	20 %	20 %	20 %	40 %	170076963
205	NC_010475	AAAAC	2	10	352593	352602	80 %	0 %	0 %	20 %	170076966
206	NC_010475	TTGGG	2	10	358707	358716	0 %	40 %	60 %	0 %	170076969
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211	NC_010475	AGAAA	2	10	379901	379910	80 %	0 %	20 %	0 %	170076986
212	NC_010475	AGAAA	2	10	382109	382118	80 %	0 %	20 %	0 %	170076987
213	NC_010475	TCATT	2	10	384921	384930	20 %	60 %	0 %	20 %	170076989
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231	NC_010475	ATTTT	2	10	433501	433510	20 %	80 %	0 %	0 %	170077041
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233	NC_010475	CATCA	2	10	434817	434826	40 %	20 %	0 %	40 %	170077042
234	NC_010475	TTTGC	2	10	435739	435748	0 %	60 %	20 %	20 %	170077043
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237	NC_010475	CTCTC	2	10	437743	437752	0 %	40 %	0 %	60 %	170077046
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247	NC_010475	CATCG	2	10	455628	455637	20 %	20 %	20 %	40 %	170077059
248	NC_010475	AATTA	2	10	457676	457685	60 %	40 %	0 %	0 %	170077060
249	NC_010475	CTGAA	2	10	461250	461259	40 %	20 %	20 %	20 %	170077063
250	NC_010475	TCGCC	2	10	463297	463306	0 %	20 %	20 %	60 %	170077063
251	NC_010475	CAGTC	2	10	463616	463625	20 %	20 %	20 %	40 %	170077064
252	NC_010475	ACACC	2	10	463681	463690	40 %	0 %	0 %	60 %	170077064
253	NC_010475	TCCGT	2	10	465836	465845	0 %	40 %	20 %	40 %	170077066
254	NC_010475	CCATC	2	10	467972	467981	20 %	20 %	0 %	60 %	170077068
255	NC_010475	AGTCC	2	10	468244	468253	20 %	20 %	20 %	40 %	170077068
256	NC_010475	CCCAG	2	10	469807	469816	20 %	0 %	20 %	60 %	170077070
257	NC_010475	GTGAT	2	10	469896	469905	20 %	40 %	40 %	0 %	170077070
258	NC_010475	ACCCG	2	10	475039	475048	20 %	0 %	20 %	60 %	170077073
259	NC_010475	GCATT	2	10	479821	479830	20 %	40 %	20 %	20 %	170077076
260	NC_010475	TTGCT	2	10	481356	481365	0 %	60 %	20 %	20 %	170077077
261	NC_010475	CTCAC	2	10	482685	482694	20 %	20 %	0 %	60 %	170077078
262	NC_010475	ACTGC	2	10	483244	483253	20 %	20 %	20 %	40 %	170077079
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