MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 6119

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010475	CCAA	2	8	370	377	50 %	0 %	0 %	50 %	170076637
2	NC_010475	CCAC	2	8	914	921	25 %	0 %	0 %	75 %	170076637
3	NC_010475	ACCC	2	8	1681	1688	25 %	0 %	0 %	75 %	170076638
4	NC_010475	TTAT	2	8	2207	2214	25 %	75 %	0 %	0 %	170076638
5	NC_010475	TCAA	2	8	2678	2685	50 %	25 %	0 %	25 %	170076639
6	NC_010475	GGCT	2	8	3196	3203	0 %	25 %	50 %	25 %	170076641
7	NC_010475	CGGG	2	8	3810	3817	0 %	0 %	75 %	25 %	170076642
8	NC_010475	TTGA	2	8	4014	4021	25 %	50 %	25 %	0 %	170076642
9	NC_010475	ATTT	2	8	6027	6034	25 %	75 %	0 %	0 %	170076646
10	NC_010475	CAAA	2	8	6464	6471	75 %	0 %	0 %	25 %	170076646
11	NC_010475	ACCC	2	8	6537	6544	25 %	0 %	0 %	75 %	170076646
12	NC_010475	GGCG	2	8	6615	6622	0 %	0 %	75 %	25 %	170076646
13	NC_010475	TAAT	2	8	6631	6638	50 %	50 %	0 %	0 %	170076646
14	NC_010475	AAGA	2	8	7032	7039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010475	ACTA	2	8	7521	7528	50 %	25 %	0 %	25 %	170076647
16	NC_010475	AGAA	2	8	7783	7790	75 %	0 %	25 %	0 %	170076648
17	NC_010475	TACC	2	8	8370	8377	25 %	25 %	0 %	50 %	170076649
18	NC_010475	TGCA	2	8	8474	8481	25 %	25 %	25 %	25 %	170076649
19	NC_010475	CTGC	2	8	9485	9492	0 %	25 %	25 %	50 %	170076649
20	NC_010475	TTGA	2	8	9604	9611	25 %	50 %	25 %	0 %	170076649
21	NC_010475	ATTT	2	8	9645	9652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010475	GAAA	2	8	9654	9661	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010475	TTGA	2	8	9819	9826	25 %	50 %	25 %	0 %	170076650
24	NC_010475	TTGT	2	8	9885	9892	0 %	75 %	25 %	0 %	170076650
25	NC_010475	CGCC	2	8	11118	11125	0 %	0 %	25 %	75 %	170076651
26	NC_010475	CCGA	2	8	11322	11329	25 %	0 %	25 %	50 %	170076651
27	NC_010475	TTGC	2	8	11789	11796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010475	TCAA	2	8	12459	12466	50 %	25 %	0 %	25 %	170076654
29	NC_010475	GTTT	2	8	13760	13767	0 %	75 %	25 %	0 %	170076655
30	NC_010475	GCGG	2	8	13914	13921	0 %	0 %	75 %	25 %	170076655
31	NC_010475	GCTG	2	8	14321	14328	0 %	25 %	50 %	25 %	170076656
32	NC_010475	GCTC	2	8	14607	14614	0 %	25 %	25 %	50 %	170076656
33	NC_010475	AAAT	2	8	15303	15310	75 %	25 %	0 %	0 %	170076657
34	NC_010475	TTAA	2	8	15413	15420	50 %	50 %	0 %	0 %	170076657
35	NC_010475	ACTT	2	8	15840	15847	25 %	50 %	0 %	25 %	170076657
36	NC_010475	AGGT	2	8	16099	16106	25 %	25 %	50 %	0 %	170076658
37	NC_010475	TGAT	2	8	16715	16722	25 %	50 %	25 %	0 %	170076658
38	NC_010475	GGTT	2	8	16771	16778	0 %	50 %	50 %	0 %	170076658
39	NC_010475	AAAT	2	8	18199	18206	75 %	25 %	0 %	0 %	170076658
40	NC_010475	TCGG	2	8	19959	19966	0 %	25 %	50 %	25 %	170076658
41	NC_010475	AACT	2	8	20056	20063	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010475	GACC	2	8	20250	20257	25 %	0 %	25 %	50 %	170076659
43	NC_010475	CCAA	2	8	20354	20361	50 %	0 %	0 %	50 %	170076659
44	NC_010475	GTGG	2	8	21250	21257	0 %	25 %	75 %	0 %	170076660
45	NC_010475	GCGG	2	8	21837	21844	0 %	0 %	75 %	25 %	170076660
46	NC_010475	GGCA	2	8	22423	22430	25 %	0 %	50 %	25 %	170076661
47	NC_010475	CAAA	2	8	23454	23461	75 %	0 %	0 %	25 %	170076662
48	NC_010475	GAAA	2	8	24706	24713	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010475	TAAA	2	8	25185	25192	75 %	25 %	0 %	0 %	170076663
50	NC_010475	TACT	2	8	25406	25413	25 %	50 %	0 %	25 %	170076664
51	NC_010475	TCTT	2	8	28215	28222	0 %	75 %	0 %	25 %	170076666
52	NC_010475	TACC	2	8	28623	28630	25 %	25 %	0 %	50 %	170076667
53	NC_010475	CAAA	2	8	29038	29045	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010475	TCGC	2	8	29073	29080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010475	CAGC	2	8	30303	30310	25 %	0 %	25 %	50 %	170076668
56	NC_010475	GATA	2	8	30394	30401	50 %	25 %	25 %	0 %	170076668
57	NC_010475	ATTC	2	8	30566	30573	25 %	50 %	0 %	25 %	170076668
58	NC_010475	TTGA	2	8	30852	30859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010475	TTCA	2	8	32302	32309	25 %	50 %	0 %	25 %	170076670
60	NC_010475	GCTT	2	8	32366	32373	0 %	50 %	25 %	25 %	170076670
61	NC_010475	ATTA	2	8	33127	33134	50 %	50 %	0 %	0 %	170076670
62	NC_010475	GAGG	2	8	33394	33401	25 %	0 %	75 %	0 %	170076670
63	NC_010475	AAGG	2	8	34624	34631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010475	CGCC	2	8	36903	36910	0 %	0 %	25 %	75 %	170076674
65	NC_010475	TCTA	2	8	37034	37041	25 %	50 %	0 %	25 %	170076674
66	NC_010475	CTAC	2	8	37426	37433	25 %	25 %	0 %	50 %	170076674
67	NC_010475	CCAG	2	8	37434	37441	25 %	0 %	25 %	50 %	170076674
68	NC_010475	CTAC	2	8	37859	37866	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010475	CCAG	2	8	37867	37874	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010475	CCAT	2	8	39101	39108	25 %	25 %	0 %	50 %	170076675
71	NC_010475	TTTG	2	8	39225	39232	0 %	75 %	25 %	0 %	170076675
72	NC_010475	AAGA	2	8	39893	39900	75 %	0 %	25 %	0 %	170076675
73	NC_010475	GGTT	2	8	40057	40064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010475	GCTC	2	8	40365	40372	0 %	25 %	25 %	50 %	170076676
75	NC_010475	AAGA	2	8	40481	40488	75 %	0 %	25 %	0 %	170076676
76	NC_010475	CTGG	2	8	40618	40625	0 %	25 %	50 %	25 %	170076676
77	NC_010475	ATTG	2	8	41752	41759	25 %	50 %	25 %	0 %	170076676
78	NC_010475	GGGT	2	8	42459	42466	0 %	25 %	75 %	0 %	170076676
79	NC_010475	CCGC	2	8	42891	42898	0 %	0 %	25 %	75 %	170076676
80	NC_010475	CTGG	2	8	43605	43612	0 %	25 %	50 %	25 %	170076676
81	NC_010475	AGGT	2	8	44658	44665	25 %	25 %	50 %	0 %	170076676
82	NC_010475	TGGC	2	8	44756	44763	0 %	25 %	50 %	25 %	170076676
83	NC_010475	ATTT	2	8	46088	46095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010475	TCTT	2	8	46574	46581	0 %	75 %	0 %	25 %	170076677
85	NC_010475	GAGT	2	8	47116	47123	25 %	25 %	50 %	0 %	170076678
86	NC_010475	GTCT	2	8	47477	47484	0 %	50 %	25 %	25 %	170076678
87	NC_010475	CTAT	2	8	47614	47621	25 %	50 %	0 %	25 %	170076678
88	NC_010475	CCCA	2	8	48022	48029	25 %	0 %	0 %	75 %	170076678
89	NC_010475	TCAG	2	8	48261	48268	25 %	25 %	25 %	25 %	170076678
90	NC_010475	TGGG	2	8	48472	48479	0 %	25 %	75 %	0 %	170076679
91	NC_010475	GGCG	2	8	48885	48892	0 %	0 %	75 %	25 %	170076679
92	NC_010475	CCCG	2	8	48915	48922	0 %	0 %	25 %	75 %	170076679
93	NC_010475	TTGC	2	8	50347	50354	0 %	50 %	25 %	25 %	170076680
94	NC_010475	TTGA	2	8	50595	50602	25 %	50 %	25 %	0 %	170076680
95	NC_010475	TGGC	2	8	51455	51462	0 %	25 %	50 %	25 %	170076682
96	NC_010475	GCGG	2	8	52132	52139	0 %	0 %	75 %	25 %	170076683
97	NC_010475	GCGG	2	8	52639	52646	0 %	0 %	75 %	25 %	170076683
98	NC_010475	CTGG	2	8	52870	52877	0 %	25 %	50 %	25 %	170076683
99	NC_010475	CGCC	2	8	53014	53021	0 %	0 %	25 %	75 %	170076683
100	NC_010475	CCGA	2	8	53277	53284	25 %	0 %	25 %	50 %	170076683
101	NC_010475	TGAA	2	8	54207	54214	50 %	25 %	25 %	0 %	170076683
102	NC_010475	ATCC	2	8	55567	55574	25 %	25 %	0 %	50 %	170076683
103	NC_010475	CCAA	2	8	55782	55789	50 %	0 %	0 %	50 %	170076683
104	NC_010475	ATCA	2	8	56690	56697	50 %	25 %	0 %	25 %	170076684
105	NC_010475	ATTT	2	8	56842	56849	25 %	75 %	0 %	0 %	170076684
106	NC_010475	CTCC	2	8	57165	57172	0 %	25 %	0 %	75 %	170076684
107	NC_010475	AGTC	2	8	58444	58451	25 %	25 %	25 %	25 %	170076684
108	NC_010475	GCCA	2	8	59094	59101	25 %	0 %	25 %	50 %	170076684
109	NC_010475	CAAC	2	8	59224	59231	50 %	0 %	0 %	50 %	170076684
110	NC_010475	CTCA	2	8	60134	60141	25 %	25 %	0 %	50 %	170076685
111	NC_010475	CCTG	2	8	60447	60454	0 %	25 %	25 %	50 %	170076686
112	NC_010475	ATAG	2	8	60664	60671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010475	TCAT	2	8	60807	60814	25 %	50 %	0 %	25 %	170076687
114	NC_010475	GATG	2	8	61809	61816	25 %	25 %	50 %	0 %	170076688
115	NC_010475	CAAA	2	8	62689	62696	75 %	0 %	0 %	25 %	170076690
116	NC_010475	CCTT	2	8	62731	62738	0 %	50 %	0 %	50 %	170076690
117	NC_010475	TGAG	2	8	62843	62850	25 %	25 %	50 %	0 %	170076690
118	NC_010475	AGAA	2	8	62995	63002	75 %	0 %	25 %	0 %	170076690
119	NC_010475	CGCT	2	8	63224	63231	0 %	25 %	25 %	50 %	170076691
120	NC_010475	CAGA	2	8	63328	63335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010475	TTTC	2	8	63582	63589	0 %	75 %	0 %	25 %	170076692
122	NC_010475	GTGG	2	8	63682	63689	0 %	25 %	75 %	0 %	170076692
123	NC_010475	CATT	2	8	63921	63928	25 %	50 %	0 %	25 %	170076692
124	NC_010475	ACTT	2	8	64473	64480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_010475	GTTG	2	8	64499	64506	0 %	50 %	50 %	0 %	170076693
126	NC_010475	TGTT	2	8	64715	64722	0 %	75 %	25 %	0 %	170076693
127	NC_010475	GTCG	2	8	65180	65187	0 %	25 %	50 %	25 %	170076693
128	NC_010475	TCAA	2	8	65226	65233	50 %	25 %	0 %	25 %	170076693
129	NC_010475	AAAT	2	8	65561	65568	75 %	25 %	0 %	0 %	170076694
130	NC_010475	GCGG	2	8	66388	66395	0 %	0 %	75 %	25 %	170076696
131	NC_010475	GGGT	2	8	66947	66954	0 %	25 %	75 %	0 %	170076696
132	NC_010475	CGAT	2	8	67010	67017	25 %	25 %	25 %	25 %	170076696
133	NC_010475	CTCA	2	8	67182	67189	25 %	25 %	0 %	50 %	170076697
134	NC_010475	CCTC	2	8	67556	67563	0 %	25 %	0 %	75 %	170076697
135	NC_010475	GCGG	2	8	67624	67631	0 %	0 %	75 %	25 %	170076697
136	NC_010475	TATC	2	8	67719	67726	25 %	50 %	0 %	25 %	170076698
137	NC_010475	GGTT	2	8	68386	68393	0 %	50 %	50 %	0 %	170076698
138	NC_010475	GAAT	2	8	68931	68938	50 %	25 %	25 %	0 %	170076698
139	NC_010475	GTTT	2	8	69611	69618	0 %	75 %	25 %	0 %	170076698
140	NC_010475	ATTT	2	8	70230	70237	25 %	75 %	0 %	0 %	170076698
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